More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0204 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  77.89 
 
 
397 aa  652    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  90.73 
 
 
399 aa  755    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  83.88 
 
 
396 aa  700    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  78.89 
 
 
399 aa  647    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  77.14 
 
 
397 aa  646    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  100 
 
 
399 aa  818    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  75.13 
 
 
398 aa  633  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  63.73 
 
 
396 aa  531  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  59.95 
 
 
402 aa  502  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  55.38 
 
 
396 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  56.28 
 
 
397 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  56.46 
 
 
396 aa  463  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  54.89 
 
 
400 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  55.44 
 
 
399 aa  451  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  55.87 
 
 
403 aa  449  1e-125  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  55.81 
 
 
394 aa  448  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  55.56 
 
 
395 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  53.27 
 
 
395 aa  443  1e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  54.91 
 
 
417 aa  433  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.6 
 
 
395 aa  431  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  52.02 
 
 
396 aa  434  1e-120  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  54.52 
 
 
395 aa  431  1e-119  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  53.06 
 
 
394 aa  429  1e-119  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  53.65 
 
 
391 aa  431  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  55.28 
 
 
400 aa  427  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  51.65 
 
 
399 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  52.04 
 
 
398 aa  410  1e-113  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  52.55 
 
 
398 aa  410  1e-113  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  51.89 
 
 
396 aa  402  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  51.66 
 
 
400 aa  393  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  50.75 
 
 
427 aa  393  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  49.25 
 
 
418 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  51.02 
 
 
398 aa  394  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  49.25 
 
 
418 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0906  acetylornithine aminotransferase  50.26 
 
 
402 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  50.51 
 
 
426 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  49.74 
 
 
398 aa  389  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  50.9 
 
 
423 aa  389  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2429  acetylornithine aminotransferase  48.72 
 
 
398 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3002  acetylornithine aminotransferase  48.21 
 
 
398 aa  385  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.555766  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2179  acetylornithine aminotransferase  48.34 
 
 
398 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.569965  normal  0.442274 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.5 
 
 
427 aa  384  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  48.35 
 
 
404 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  50 
 
 
387 aa  383  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  47.66 
 
 
392 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  49.5 
 
 
418 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  49.87 
 
 
392 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3011  acetylornithine aminotransferase  47.1 
 
 
404 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  47.47 
 
 
397 aa  375  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  48.3 
 
 
391 aa  372  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1452  acetylornithine aminotransferase  48.95 
 
 
402 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  48.31 
 
 
390 aa  372  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.67 
 
 
398 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3029  acetylornithine aminotransferase  48.04 
 
 
410 aa  371  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51469  normal  0.939431 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.59 
 
 
394 aa  369  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2767  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.75 
 
 
403 aa  371  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2121  acetylornithine aminotransferase  46 
 
 
404 aa  371  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00994118  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  47.03 
 
 
390 aa  370  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0313  acetylornithine aminotransferase  49.74 
 
 
380 aa  370  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  48.45 
 
 
403 aa  368  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  45.62 
 
 
388 aa  364  1e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  48.31 
 
 
401 aa  362  4e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  46.91 
 
 
385 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1851  acetylornithine aminotransferase  49.1 
 
 
394 aa  360  3e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  46.77 
 
 
400 aa  360  3e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1958  acetylornithine aminotransferase  45.62 
 
 
401 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  46.65 
 
 
385 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2318  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.74 
 
 
396 aa  355  5e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.156448 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  46.37 
 
 
388 aa  355  6.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.37 
 
 
388 aa  355  6.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  48.19 
 
 
386 aa  354  1e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0395  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.25 
 
 
413 aa  354  1e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.538676 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.96 
 
 
410 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  47.49 
 
 
422 aa  353  2.9999999999999997e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3033  acetylornithine aminotransferase  47.62 
 
 
390 aa  352  5e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.850335  normal  0.390329 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34500  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.57 
 
 
406 aa  351  1e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.12 
 
 
402 aa  351  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4916  acetylornithine transaminase protein  48.01 
 
 
405 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4075  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.08 
 
 
396 aa  350  3e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1024  acetylornithine transaminase protein  47.63 
 
 
395 aa  349  4e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433962  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1180  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.76 
 
 
410 aa  349  4e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2124  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.76 
 
 
410 aa  349  5e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.975893  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2911  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.5 
 
 
406 aa  348  7e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.408245 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4556  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.08 
 
 
396 aa  348  9e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.974298 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.81 
 
 
397 aa  348  9e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.28 
 
 
397 aa  347  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3986  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.5 
 
 
406 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5259  acetylornithine transaminase protein  46.34 
 
 
403 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0701  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.5 
 
 
410 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520056  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3708  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.59 
 
 
412 aa  347  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.339324  normal  0.0114471 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4291  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.5 
 
 
410 aa  347  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  44.42 
 
 
386 aa  346  4e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4442  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.08 
 
 
396 aa  346  4e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.977458  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3770  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.77 
 
 
406 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0233516 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1434  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.12 
 
 
406 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.845656 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1787  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.76 
 
 
409 aa  345  6e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1775  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.76 
 
 
411 aa  345  7e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.664584  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4033  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.76 
 
 
408 aa  345  7e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.327701  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3149  acetylornithine aminotransferase  44.33 
 
 
402 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.457305 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50577  acetylornithine aminotransferase  44.39 
 
 
476 aa  345  8.999999999999999e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>