More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0078 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3384  cardiolipin synthetase, putative  85.6 
 
 		 525 aa  810    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 502 aa  1014    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0603365 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1886  cardiolipin synthase  46.02 
 
 		 510 aa  424  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.115754  hitchhiker  0.00782832 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2154  phospholipase D/transphosphatidylase  35.07 
 
 		 518 aa  281  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0310472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1926  phospholipase D/transphosphatidylase  36.67 
 
 		 582 aa  265  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0663  phospholipase D/transphosphatidylase  37.67 
 
 		 535 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000324106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2103  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.15 
 
 		 517 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1456  phospholipase D/transphosphatidylase  33.95 
 
 		 522 aa  258  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4479  phospholipase D/transphosphatidylase  37.5 
 
 		 516 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3640  phospholipase D/transphosphatidylase  37.5 
 
 		 516 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2203  phospholipase D/transphosphatidylase  36.89 
 
 		 516 aa  256  9e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3887  phospholipase D/transphosphatidylase  37.5 
 
 		 560 aa  256  9e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40611  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2333  phospholipase D/transphosphatidylase  36.43 
 
 		 514 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.271927 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3742  putative phospholipase D protein  37.17 
 
 		 548 aa  253  7e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.135454 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2154  putative phospholipase D precursor  36.51 
 
 		 517 aa  253  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3791  phospholipase D/transphosphatidylase  37.3 
 
 		 516 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.102545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4172  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.96 
 
 		 564 aa  251  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4284  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.96 
 
 		 564 aa  251  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.730338 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2081  putative phospholipase D  33.48 
 
 		 510 aa  250  5e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2946  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.79 
 
 		 557 aa  249  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.378913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2951  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.35 
 
 		 529 aa  248  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0851513 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2055  phospholipase D/transphosphatidylase  35.47 
 
 		 515 aa  248  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0614113  normal  0.204663 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2113  phospholipase D protein, putative  33.63 
 
 		 522 aa  247  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3283  phospholipase D/transphosphatidylase  36.79 
 
 		 505 aa  246  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1462  phospholipase D/transphosphatidylase  32.81 
 
 		 514 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1371  phospholipase D/transphosphatidylase  33.62 
 
 		 540 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130503 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1436  phospholipase D/transphosphatidylase  34.2 
 
 		 540 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0951062 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4980  phospholipase D/transphosphatidylase  34.89 
 
 		 538 aa  244  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0796  phospholipase D/transphosphatidylase  35.23 
 
 		 562 aa  243  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829142  normal  0.0553202 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01043  predicted hydrolase  35.33 
 
 		 473 aa  242  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.951902  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2599  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.57 
 
 		 493 aa  242  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0536182  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01050  hypothetical protein  35.33 
 
 		 473 aa  242  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.795141  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1166  phopholipase D  35.57 
 
 		 476 aa  242  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.130412  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2553  phospholipase D/transphosphatidylase  35.33 
 
 		 476 aa  241  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.424547  normal  0.39142 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1426  phopholipase D  35.1 
 
 		 473 aa  241  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.33637  normal  0.352917 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1424  phospholipase D/transphosphatidylase  32.55 
 
 		 544 aa  241  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2285  phopholipase D  35.33 
 
 		 476 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0421  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.5 
 
 		 514 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1167  phopholipase D  35.33 
 
 		 476 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.383725  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6079  phospholipase D/transphosphatidylase  36.65 
 
 		 541 aa  240  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2202  phopholipase D-family protein  35.58 
 
 		 508 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2085  phopholipase D  35.1 
 
 		 473 aa  239  9e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.374109 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1562  phospholipase D/transphosphatidylase  33.55 
 
 		 495 aa  239  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0457673  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3039  phopholipase D domain-containing protein  31.73 
 
 		 510 aa  238  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0791  phospholipase D  31.55 
 
 		 570 aa  237  3e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3993  phospholipase D/transphosphatidylase  34.56 
 
 		 517 aa  237  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.927932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0797  phospholipase D/transphosphatidylase  30.96 
 
 		 566 aa  237  4e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1039  putative phospholipase D  33.07 
 
 		 558 aa  236  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2139  phospholipase D/transphosphatidylase  35.68 
 
 		 540 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2752  phospholipase D/transphosphatidylase  35.68 
 
 		 540 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2668  phospholipase D/transphosphatidylase  34.89 
 
 		 540 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2801  phospholipase D/transphosphatidylase  34.6 
 
 		 540 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0493  phospholipase D, putative  34.61 
 
 		 553 aa  234  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1732  phospholipase D/transphosphatidylase  34.32 
 
 		 543 aa  233  5e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.229068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2777  phospholipase D/transphosphatidylase  34.93 
 
 		 540 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.326922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1811  phospholipase D/transphosphatidylase  33.79 
 
 		 532 aa  233  9e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52997  normal  0.0386663 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2100  phospholipase D/transphosphatidylase  33.06 
 
 		 506 aa  232  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0208  putative phospholipase D  34.91 
 
 		 550 aa  232  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0978  phospholipase D, putative  34.91 
 
 		 595 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899552  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0473  phospholipase-D family protein  34.48 
 
 		 516 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0239  putative phospholipase D  34.91 
 
 		 550 aa  232  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1383  putative phospholipase D  34.91 
 
 		 550 aa  232  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1580  putative phospholipase D  34.91 
 
 		 550 aa  232  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2558  phospholipase D family protein  34.68 
 
 		 550 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140702  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2702  phospholipase D family protein  34.91 
 
 		 550 aa  231  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  34.48 
 
 		 516 aa  230  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5034  phospholipase D/transphosphatidylase  33.47 
 
 		 543 aa  230  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1146  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.81 
 
 		 520 aa  227  4e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000126804  hitchhiker  4.1949e-17 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0547  phospholipase D/transphosphatidylase  35.44 
 
 		 549 aa  227  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.954131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2900  phospholipase D/transphosphatidylase  32.88 
 
 		 507 aa  227  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0104537 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3210  putative phospholipase D protein  33.19 
 
 		 529 aa  225  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.824664 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2395  phospholipase D/transphosphatidylase  32.99 
 
 		 516 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138129  normal  0.528036 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0845  phospholipase D/transphosphatidylase  33.33 
 
 		 517 aa  224  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000670  cardiolipin synthetase  31.79 
 
 		 505 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0871  phospholipase D/transphosphatidylase  32.31 
 
 		 520 aa  221  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0032  phospholipase D/transphosphatidylase  32.08 
 
 		 516 aa  220  5e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00522964  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2346  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.46 
 
 		 524 aa  219  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5588  putative phospholipase D/transphosphatidylase  34.53 
 
 		 534 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0380  phospholipase D/transphosphatidylase  32.33 
 
 		 652 aa  216  5.9999999999999996e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0340  phospholipase D/transphosphatidylase  34.22 
 
 		 519 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.22272  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70110  putative cardiolipin synthase  31.46 
 
 		 529 aa  216  9e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0434  cardiolipin synthase  32.13 
 
 		 664 aa  216  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0142  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.19 
 
 		 527 aa  213  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.150882  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5759  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.26 
 
 		 519 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1771  phospholipase D/transphosphatidylase  32.08 
 
 		 515 aa  209  7e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2041  phopholipase D  33 
 
 		 434 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00421548  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2225  phopholipase D  33 
 
 		 434 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1244  phopholipase D  33 
 
 		 434 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1215  phopholipase D  33 
 
 		 434 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.192537 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1259  phopholipase D  33 
 
 		 434 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.515013  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0095  phospholipase D family protein  31.06 
 
 		 542 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5532  phospholipase D/transphosphatidylase  32.13 
 
 		 522 aa  204  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0467  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.97 
 
 		 534 aa  203  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2014  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.49 
 
 		 551 aa  202  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.384488  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0229  phospholipase D/transphosphatidylase  31.26 
 
 		 526 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6085  putative lipoprotein  31.81 
 
 		 517 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3191  phospholipase D/transphosphatidylase  30.87 
 
 		 576 aa  201  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269008  normal  0.521574 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5186  phospholipase D/transphosphatidylase  31 
 
 		 517 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5276  phospholipase D/transphosphatidylase  30.79 
 
 		 517 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5328  phospholipase D/transphosphatidylase  30.95 
 
 		 517 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0620748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>