More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3108 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  100 
 
 		 480 aa  947    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  52.1 
 
 		 468 aa  488  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  52.32 
 
 		 464 aa  472  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  51.95 
 
 		 464 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  51.95 
 
 		 464 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  51.95 
 
 		 464 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  52.32 
 
 		 464 aa  472  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  51.62 
 
 		 465 aa  474  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  52.32 
 
 		 464 aa  472  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  52.32 
 
 		 464 aa  472  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  51.95 
 
 		 464 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  52.32 
 
 		 464 aa  472  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  52.32 
 
 		 464 aa  472  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  51.95 
 
 		 464 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  52.32 
 
 		 464 aa  472  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  52.32 
 
 		 464 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  52.32 
 
 		 464 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  51.84 
 
 		 472 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  48.15 
 
 		 476 aa  445  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  47.99 
 
 		 471 aa  426  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  47.77 
 
 		 472 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  47.32 
 
 		 472 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  47.77 
 
 		 472 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  47.77 
 
 		 472 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  47.77 
 
 		 472 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  47.32 
 
 		 472 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  47.77 
 
 		 472 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  47.32 
 
 		 472 aa  419  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  47.32 
 
 		 472 aa  420  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  47.1 
 
 		 472 aa  418  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  47.32 
 
 		 472 aa  420  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  47.1 
 
 		 472 aa  418  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  47.32 
 
 		 472 aa  420  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  47.32 
 
 		 472 aa  420  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1362  sugar transporter  50.57 
 
 		 467 aa  383  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  41.47 
 
 		 480 aa  318  1e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  40.21 
 
 		 477 aa  317  4e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  39.37 
 
 		 463 aa  301  2e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  39.15 
 
 		 463 aa  301  2e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  41.36 
 
 		 468 aa  278  2e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  41.02 
 
 		 447 aa  272  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  36.92 
 
 		 492 aa  271  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  38.89 
 
 		 452 aa  271  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  38.89 
 
 		 452 aa  271  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  35.31 
 
 		 448 aa  265  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  35.32 
 
 		 468 aa  259  6e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  35.96 
 
 		 497 aa  256  6e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  34.53 
 
 		 458 aa  253  7e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  35.21 
 
 		 472 aa  252  9.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  35.41 
 
 		 475 aa  251  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  37.08 
 
 		 474 aa  251  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  33.63 
 
 		 507 aa  249  7e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  36.22 
 
 		 464 aa  247  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  34.66 
 
 		 475 aa  247  3e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  36.78 
 
 		 449 aa  245  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  33.63 
 
 		 457 aa  242  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0488  hypothetical protein  35.68 
 
 		 473 aa  241  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0464  hypothetical protein  35.32 
 
 		 473 aa  242  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  33.92 
 
 		 466 aa  240  2.9999999999999997e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  32.91 
 
 		 533 aa  240  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  35.22 
 
 		 490 aa  238  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  35.68 
 
 		 480 aa  238  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  36.04 
 
 		 477 aa  237  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  33.93 
 
 		 441 aa  236  8e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  34.84 
 
 		 516 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  31.71 
 
 		 480 aa  235  2.0000000000000002e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  35.48 
 
 		 482 aa  233  4.0000000000000004e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  34.14 
 
 		 484 aa  233  6e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  32.09 
 
 		 444 aa  230  5e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  35.06 
 
 		 452 aa  228  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  34.02 
 
 		 491 aa  228  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  34.52 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1014  sugar transporter  34.08 
 
 		 480 aa  227  4e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.920138  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  33.85 
 
 		 480 aa  225  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  35.29 
 
 		 459 aa  225  2e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  32.3 
 
 		 482 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  33.55 
 
 		 473 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  33.33 
 
 		 473 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04316  MFS myo-inositol transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06080)  33.19 
 
 		 517 aa  224  3e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38765  normal  0.214777 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0500  sugar transporter  34.74 
 
 		 445 aa  224  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615232  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1681  D-xylose proton-symporter  32.9 
 
 		 464 aa  224  3e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.142267  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  35.07 
 
 		 486 aa  223  8e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1624  hypothetical protein  31.53 
 
 		 471 aa  223  8e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  34.76 
 
 		 471 aa  222  9.999999999999999e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  32.15 
 
 		 480 aa  221  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  32.13 
 
 		 450 aa  220  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  30.87 
 
 		 477 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1619  hypothetical protein  30.77 
 
 		 471 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  32.82 
 
 		 466 aa  217  4e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  33.33 
 
 		 544 aa  216  5e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  30.67 
 
 		 491 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  32.69 
 
 		 485 aa  215  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  31.22 
 
 		 438 aa  216  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  30.67 
 
 		 491 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0826  sugar transporter  36.28 
 
 		 444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  30.67 
 
 		 491 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  30.67 
 
 		 491 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  30.67 
 
 		 491 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  30.67 
 
 		 491 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03799  MFS transporter  32.28 
 
 		 524 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>