More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2201 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  82.89 
 
 
409 aa  644  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
409 aa  813  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  83.86 
 
 
409 aa  671  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  98.04 
 
 
409 aa  802  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.57118e-10 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  69.06 
 
 
408 aa  541  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3570  protein of unknown function DUF214  69.44 
 
 
409 aa  517  1e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  53.63 
 
 
406 aa  419  1e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  4.72644e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  49.88 
 
 
406 aa  399  1e-110  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  48.03 
 
 
401 aa  390  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  50.25 
 
 
409 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  50 
 
 
409 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  52.62 
 
 
402 aa  382  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  48.28 
 
 
401 aa  384  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  1.78318e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  50 
 
 
409 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  48.88 
 
 
406 aa  379  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1168  hypothetical protein  52.02 
 
 
406 aa  371  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.69946  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  46.08 
 
 
400 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  47.5 
 
 
405 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  45.54 
 
 
406 aa  365  1e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  48.16 
 
 
404 aa  357  2e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  47.53 
 
 
707 aa  357  2e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  46.57 
 
 
400 aa  357  3e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  48.26 
 
 
406 aa  355  9e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2918  protein of unknown function DUF214  47.9 
 
 
405 aa  350  3e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.393852  normal  0.599334 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  44.47 
 
 
403 aa  348  7e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  45.95 
 
 
403 aa  345  9e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  46.68 
 
 
658 aa  341  2e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  45.59 
 
 
412 aa  339  4e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2775  hypothetical protein  47.26 
 
 
409 aa  338  1e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0520922  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  47.79 
 
 
408 aa  337  3e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  45.07 
 
 
402 aa  337  3e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  41.52 
 
 
715 aa  329  7e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  44.09 
 
 
402 aa  328  9e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  44.09 
 
 
402 aa  328  9e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  41.07 
 
 
456 aa  326  6e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  42.51 
 
 
411 aa  325  7e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  42.82 
 
 
402 aa  324  1e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  42.57 
 
 
400 aa  323  3e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  46.63 
 
 
670 aa  321  1e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  42.86 
 
 
400 aa  321  2e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  43 
 
 
401 aa  320  4e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  43.1 
 
 
400 aa  319  7e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  43.61 
 
 
657 aa  317  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  43.98 
 
 
401 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  43.98 
 
 
401 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  42.04 
 
 
405 aa  315  7e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  44.75 
 
 
657 aa  315  1e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  44.31 
 
 
407 aa  314  2e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  42.86 
 
 
653 aa  313  4e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  43.61 
 
 
656 aa  311  9e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  43.28 
 
 
403 aa  308  8e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  43.41 
 
 
651 aa  307  2e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  43.95 
 
 
391 aa  305  8e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  43.03 
 
 
657 aa  302  8e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  39.07 
 
 
409 aa  300  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  41.87 
 
 
405 aa  299  8e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  43.35 
 
 
405 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  41.13 
 
 
405 aa  296  5e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  41.89 
 
 
652 aa  295  7e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  41.4 
 
 
443 aa  295  9e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  40.9 
 
 
454 aa  293  5e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2039  hypothetical protein  43.64 
 
 
403 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  43.24 
 
 
410 aa  288  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2149  hypothetical protein  41.19 
 
 
402 aa  287  3e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0531927  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  43.46 
 
 
653 aa  286  6e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2608  hypothetical protein  41.87 
 
 
411 aa  284  2e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  41.77 
 
 
410 aa  284  2e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  41.1 
 
 
644 aa  284  2e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  42.48 
 
 
409 aa  282  9e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  41.13 
 
 
405 aa  282  9e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3269  hypothetical protein  43.13 
 
 
417 aa  281  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392624  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  41.13 
 
 
405 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  40.65 
 
 
661 aa  280  4e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  41.81 
 
 
418 aa  279  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  41.77 
 
 
405 aa  278  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  43.37 
 
 
412 aa  277  2e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  38.42 
 
 
409 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  38.9 
 
 
398 aa  277  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  40.34 
 
 
671 aa  277  3e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  38.86 
 
 
409 aa  276  4e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  38.48 
 
 
410 aa  276  6e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  38.24 
 
 
410 aa  275  9e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  41.13 
 
 
423 aa  273  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  40.64 
 
 
405 aa  273  4e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  40.64 
 
 
405 aa  273  4e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  38.61 
 
 
409 aa  271  1e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  43 
 
 
411 aa  271  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  39.22 
 
 
404 aa  270  3e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  38.08 
 
 
409 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  38.97 
 
 
404 aa  268  1e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  38.57 
 
 
647 aa  267  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  38.92 
 
 
394 aa  266  4e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  39.5 
 
 
409 aa  265  8e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  39.5 
 
 
409 aa  265  8e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  38.42 
 
 
403 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  39.27 
 
 
392 aa  262  6e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1452  hypothetical protein  43.73 
 
 
410 aa  262  8e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  37.84 
 
 
663 aa  259  7e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  37.12 
 
 
408 aa  256  5e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  38.18 
 
 
663 aa  255  1e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>