59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0226 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0226  spore photoproduct lyase  100 
 
 		 341 aa  709    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0919  spore photoproduct lyase  78.3 
 
 		 341 aa  588  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3959  spore photoproduct lyase  78.01 
 
 		 341 aa  585  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.901366  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4315  spore photoproduct lyase  77.71 
 
 		 341 aa  584  1e-166  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3948  spore photoproduct lyase  77.42 
 
 		 341 aa  580  1.0000000000000001e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4225  spore photoproduct lyase  77.71 
 
 		 341 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4334  spore photoproduct lyase  77.42 
 
 		 341 aa  581  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4278  spore photoproduct lyase  77.71 
 
 		 341 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4109  spore photoproduct lyase  77.42 
 
 		 341 aa  580  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4429  spore photoproduct lyase  77.42 
 
 		 341 aa  580  1e-164  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4058  spore photoproduct lyase  77.13 
 
 		 341 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2489  spore photoproduct lyase  68.53 
 
 		 342 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0691  spore photoproduct lyase  53.85 
 
 		 352 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22270  spore photoproduct lyase  45.75 
 
 		 340 aa  328  7e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0238  Radical SAM domain protein  46.45 
 
 		 340 aa  325  5e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2341  Radical SAM domain protein  48.09 
 
 		 357 aa  324  1e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0393103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0720  spore photoproduct lyase  45.1 
 
 		 340 aa  325  1e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0712219  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1928  spore photoproduct lyase, splB  49.7 
 
 		 340 aa  319  3.9999999999999996e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0667  radical SAM domain-containing protein  46.65 
 
 		 341 aa  316  3e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0624  Radical SAM domain protein  43.45 
 
 		 339 aa  300  3e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00552775  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1066  radical SAM domain-containing protein  37.36 
 
 		 387 aa  253  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.504445 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3293  spore photoproduct lyase  37.93 
 
 		 363 aa  228  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2944  radical SAM domain-containing protein  37.82 
 
 		 371 aa  228  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164371 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2717  radical SAM domain-containing protein  38.68 
 
 		 371 aa  219  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4985  Radical SAM domain protein  36.65 
 
 		 373 aa  219  7e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.831424  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2839  radical SAM domain protein  37.07 
 
 		 370 aa  218  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95751  normal  0.218512 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5726  radical SAM domain-containing protein  36.78 
 
 		 359 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.297493  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0830  radical SAM domain-containing protein  37.04 
 
 		 376 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0103728 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4460  Radical SAM domain protein  36.08 
 
 		 360 aa  194  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.26561  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1777  hypothetical protein  32.35 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3628  hypothetical protein  31.4 
 
 		 334 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1838  hypothetical protein  28.99 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000126536  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1857  Radical SAM domain protein  24.14 
 
 		 354 aa  102  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000532474 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1110  Radical SAM domain protein  25.85 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1261  DNA repair photolyase-like  24.66 
 
 		 389 aa  88.2  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0827  radical SAM domain protein  25.82 
 
 		 359 aa  87.8  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1656  radical SAM domain protein  25 
 
 		 353 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1282  DNA repair photolyase-like protein  26.33 
 
 		 426 aa  86.7  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5436  radical SAM domain-containing protein  24.64 
 
 		 355 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.786254 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3333  Radical SAM domain protein  23.45 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3457  radical SAM domain-containing protein  22.48 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3136  radical SAM domain-containing protein  22.48 
 
 		 354 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2339  radical SAM domain-containing protein  25.18 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2710  radical SAM domain-containing protein  23.91 
 
 		 370 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0234574 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2665  radical SAM family protein  23.91 
 
 		 370 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2695  radical SAM domain-containing protein  23.91 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.955919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1237  hypothetical protein  28.36 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.231628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0354  radical SAM domain-containing protein  23.02 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360809  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1935  Radical SAM domain protein  21.9 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.779003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1416  radical SAM domain-containing protein  21.35 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1929  DNA repair photolyase-like protein  25.24 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0715996  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1936  DNA repair photolyase-like protein  26.19 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290758  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0074  hypothetical protein  24.39 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2013  hypothetical protein  22.66 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2907  Radical SAM domain protein  21.26 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2336  DNA repair photolyase-like protein  19.67 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000245241  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07430  tRNA-N(6)-(isopentenyl)adenosine-37 thiotransferase enzyme MiaB  23.46 
 
 		 448 aa  53.9  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000348325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0463  DNA repair photolyase  17.95 
 
 		 335 aa  49.7  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0639  DNA repair photolyase-like protein  20.51 
 
 		 337 aa  47  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>