More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2729 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  95.1 
 
 
571 aa  1135    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  80.42 
 
 
572 aa  980    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  80.24 
 
 
572 aa  977    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  80.59 
 
 
572 aa  981    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  80.42 
 
 
572 aa  979    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  80.24 
 
 
572 aa  977    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  80.42 
 
 
572 aa  979    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  100 
 
 
571 aa  1180    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  72.28 
 
 
568 aa  872    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  80.59 
 
 
572 aa  981    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  80.42 
 
 
572 aa  980    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  80.59 
 
 
572 aa  981    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  72.28 
 
 
568 aa  872    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  80.42 
 
 
572 aa  982    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  80.42 
 
 
572 aa  981    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1412  acetyl-CoA synthetase  47.27 
 
 
587 aa  543  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0511  acetyl-CoA synthetase  47.47 
 
 
607 aa  534  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3465  AMP-dependent synthetase and ligase  47.56 
 
 
598 aa  535  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271153  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3568  acetyl-CoA synthetase  46.83 
 
 
588 aa  528  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0207513  normal  0.0354675 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4644  acetyl-CoA synthetase  46.83 
 
 
588 aa  528  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291537  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1854  AMP-dependent synthetase and ligase  46.39 
 
 
567 aa  530  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1608  acetyl-CoA synthetase  47.27 
 
 
584 aa  531  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.281409  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0761  acetyl-CoA synthetase  46.25 
 
 
592 aa  525  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000550868  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7028  acetyl-CoA synthetase  47.64 
 
 
585 aa  522  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.277819 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2597  acetyl-CoA synthetase  46.22 
 
 
588 aa  523  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0867997  hitchhiker  0.000215379 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3600  acetyl-CoA synthetase  46.89 
 
 
584 aa  524  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1407  acetyl-CoA synthetase  46.15 
 
 
598 aa  521  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.959258 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0927  acetyl-CoA synthetase  46.94 
 
 
588 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2174  acetyl-CoA synthetase  46.14 
 
 
588 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.181143  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0388  acetyl-CoA synthetase  45.47 
 
 
602 aa  504  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  46.74 
 
 
632 aa  499  1e-140  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2708  acetyl-CoA synthetase  43.35 
 
 
576 aa  485  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.180648  hitchhiker  0.00000972511 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2340  AMP-dependent synthetase and ligase  44.61 
 
 
539 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0089  acetate/CoA ligase  42.88 
 
 
626 aa  449  1e-125  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.191746  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  43.86 
 
 
560 aa  448  1.0000000000000001e-124  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  42.81 
 
 
629 aa  444  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  42.12 
 
 
625 aa  445  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  41.39 
 
 
670 aa  432  1e-120  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  40.53 
 
 
632 aa  432  1e-119  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  42.53 
 
 
659 aa  429  1e-119  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1973  AMP-dependent synthetase and ligase  39.48 
 
 
576 aa  428  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  40.81 
 
 
639 aa  426  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  40.33 
 
 
639 aa  427  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  41.95 
 
 
631 aa  428  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  40.3 
 
 
632 aa  422  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1319  acetate/CoA ligase  41.95 
 
 
631 aa  424  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  41.85 
 
 
660 aa  422  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  41.33 
 
 
653 aa  425  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  40.48 
 
 
666 aa  422  1e-117  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  41.35 
 
 
667 aa  423  1e-117  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  41.2 
 
 
629 aa  420  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  40.56 
 
 
632 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  43.56 
 
 
644 aa  418  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  40.56 
 
 
632 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0491  acetate/CoA ligase  42.53 
 
 
635 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  42.04 
 
 
668 aa  416  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  41.62 
 
 
631 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  41.14 
 
 
666 aa  413  1e-114  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  40.13 
 
 
629 aa  415  1e-114  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  40.39 
 
 
631 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  42.41 
 
 
650 aa  415  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  42.13 
 
 
638 aa  413  1e-114  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  41.86 
 
 
655 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  40.77 
 
 
552 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  40 
 
 
629 aa  411  1e-113  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  43.01 
 
 
644 aa  411  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  39.54 
 
 
664 aa  407  1.0000000000000001e-112  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  40.73 
 
 
649 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  40.14 
 
 
661 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  41.33 
 
 
650 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  40.73 
 
 
666 aa  405  1e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  40.92 
 
 
670 aa  402  1e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  40.73 
 
 
657 aa  404  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  40.94 
 
 
656 aa  402  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  39.07 
 
 
552 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2783  acetate/CoA ligase  38.57 
 
 
651 aa  403  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.943311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  40.49 
 
 
655 aa  402  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  40.73 
 
 
664 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  41.95 
 
 
648 aa  400  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  40.88 
 
 
643 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  40.55 
 
 
664 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  40.7 
 
 
653 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  39.49 
 
 
656 aa  400  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  42.08 
 
 
650 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0180  AMP-dependent synthetase and ligase  40.11 
 
 
553 aa  402  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  39.79 
 
 
661 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  39.61 
 
 
652 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1300  AMP-dependent synthetase and ligase  40.82 
 
 
627 aa  397  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3955  acetyl-CoA synthetase  39.41 
 
 
648 aa  394  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  39.86 
 
 
673 aa  394  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  38.59 
 
 
667 aa  393  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  40.24 
 
 
660 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  40.03 
 
 
645 aa  394  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5450  acetyl-CoA synthetase  41.12 
 
 
645 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820254  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  41.12 
 
 
645 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  37.99 
 
 
652 aa  392  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  40.46 
 
 
667 aa  394  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  40.07 
 
 
658 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  40.6 
 
 
667 aa  390  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  39.72 
 
 
664 aa  389  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>