More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2088 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006274  BCZK0939  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  67.88 
 
 
560 aa  735  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  4.53053e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0961  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  67.88 
 
 
560 aa  734  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00186325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0948  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  67.88 
 
 
560 aa  734  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  7.99901e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1027  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  67.88 
 
 
560 aa  734  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  8.88189e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1196  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  67.7 
 
 
560 aa  732  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  4.05869e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0056  FAD dependent oxidoreductase  61.08 
 
 
564 aa  665  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1067  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  67.15 
 
 
560 aa  730  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000136753  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4232  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  67.33 
 
 
560 aa  732  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.59546e-08  hitchhiker  7.4562e-08 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1107  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  67.88 
 
 
560 aa  734  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.58319e-29 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0527  FAD dependent oxidoreductase  80.15 
 
 
557 aa  893  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
554 aa  1147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1360  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  62.75 
 
 
573 aa  679  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  2.54105e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  62.75 
 
 
557 aa  681  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  62.13 
 
 
557 aa  675  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0808  FAD dependent oxidoreductase  68.98 
 
 
560 aa  747  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  1.05669e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1126  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  67.88 
 
 
560 aa  735  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  2.04459e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0949  FAD dependent oxidoreductase  67.15 
 
 
560 aa  736  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  4.27543e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1004  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (aerobic)  48.6 
 
 
543 aa  499  1e-140  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100601  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0274  alpha-glycerophosphate oxidase  40.37 
 
 
609 aa  437  1e-121  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.51 
 
 
532 aa  293  5e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  34.71 
 
 
539 aa  286  8e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  34.3 
 
 
531 aa  285  2e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  34.81 
 
 
567 aa  279  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  35.69 
 
 
537 aa  278  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  35.09 
 
 
545 aa  276  6e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  35.41 
 
 
537 aa  276  9e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  36.29 
 
 
529 aa  271  3e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  34.17 
 
 
516 aa  269  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  32.45 
 
 
543 aa  267  4e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.58 
 
 
525 aa  267  5e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  33.52 
 
 
548 aa  267  5e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  34.38 
 
 
525 aa  266  6e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  36.97 
 
 
524 aa  265  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  33.7 
 
 
546 aa  264  3e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  33.93 
 
 
542 aa  263  7e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  37.14 
 
 
533 aa  262  9e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  8.58537e-06  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  34.18 
 
 
582 aa  262  9e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  32.85 
 
 
574 aa  261  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  32.96 
 
 
556 aa  261  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  36.35 
 
 
532 aa  261  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  36.76 
 
 
519 aa  260  4e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  34.94 
 
 
579 aa  259  8e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  34.2 
 
 
573 aa  259  9e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  36.23 
 
 
532 aa  258  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  8.68135e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.4 
 
 
530 aa  258  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  1.66291e-05 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  35.28 
 
 
582 aa  258  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  35.05 
 
 
579 aa  258  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  39.01 
 
 
566 aa  256  7e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  34.82 
 
 
552 aa  256  1e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  35.04 
 
 
546 aa  255  1e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  33.08 
 
 
603 aa  255  2e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  30.81 
 
 
700 aa  252  1e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  33.96 
 
 
519 aa  252  1e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.09 
 
 
591 aa  251  3e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  33.45 
 
 
600 aa  251  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3436  FAD dependent oxidoreductase  31.79 
 
 
536 aa  251  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0404922  hitchhiker  4.73208e-05 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.27 
 
 
585 aa  250  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.54 
 
 
587 aa  249  9e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  36.98 
 
 
540 aa  249  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.37 
 
 
605 aa  249  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  35.33 
 
 
534 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  35.89 
 
 
528 aa  247  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  1.74141e-05  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  35.13 
 
 
543 aa  246  7e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  35.41 
 
 
579 aa  246  7e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  35.41 
 
 
579 aa  246  1e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  35.41 
 
 
579 aa  246  1e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  34.74 
 
 
518 aa  246  1e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  32.45 
 
 
578 aa  244  2e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  34.28 
 
 
519 aa  241  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  35.22 
 
 
576 aa  242  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  33.82 
 
 
577 aa  241  3e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0359  FAD dependent oxidoreductase  37.89 
 
 
526 aa  241  3e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000963274  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  34.5 
 
 
536 aa  241  3e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  32.97 
 
 
543 aa  240  5e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  33.95 
 
 
572 aa  240  5e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  35.02 
 
 
595 aa  239  7e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.26 
 
 
554 aa  239  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2133  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.4 
 
 
526 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  34.13 
 
 
569 aa  239  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  33.74 
 
 
573 aa  238  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  31.33 
 
 
545 aa  238  2e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  32.97 
 
 
582 aa  238  3e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0014  FAD dependent oxidoreductase  35.98 
 
 
551 aa  237  5e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  35.79 
 
 
585 aa  236  5e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  35.93 
 
 
581 aa  236  1e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  31.05 
 
 
520 aa  235  2e-60  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  36.03 
 
 
546 aa  234  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  36.58 
 
 
585 aa  234  3e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
568 aa  233  9e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  33.21 
 
 
547 aa  231  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  32.77 
 
 
582 aa  230  5e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  32.78 
 
 
560 aa  230  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  31.41 
 
 
576 aa  229  7e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
575 aa  229  8e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2412  FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 
552 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  31.63 
 
 
583 aa  229  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  31.79 
 
 
579 aa  229  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6538e-07 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68764  mitochondrial glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.24 
 
 
640 aa  228  2e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.43 
 
 
567 aa  227  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 
562 aa  227  4e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>