More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1451 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 490 aa  1013    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2409  transcriptional regulator  39.33 
 
 		 479 aa  347  4e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00453228  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  38.7 
 
 		 477 aa  343  4e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  38.49 
 
 		 477 aa  341  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2769  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 477 aa  336  5e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000296805  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 477 aa  331  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  37.24 
 
 		 477 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 477 aa  329  7e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 477 aa  329  7e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2472  GntR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 477 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.656755  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 498 aa  252  1e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  31.07 
 
 		 498 aa  250  5e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 477 aa  243  6e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.07 
 
 		 468 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  30.64 
 
 		 493 aa  236  6e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 547 aa  227  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 477 aa  224  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  29.4 
 
 		 517 aa  224  4e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 477 aa  223  8e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 477 aa  223  8e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  28.04 
 
 		 477 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.84 
 
 		 477 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.84 
 
 		 477 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 477 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  28.42 
 
 		 480 aa  216  7e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  27.01 
 
 		 477 aa  216  9e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3856  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.57 
 
 		 477 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 402 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  29.16 
 
 		 484 aa  214  2.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  27.07 
 
 		 554 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 402 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  32.69 
 
 		 394 aa  213  7.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  29.36 
 
 		 480 aa  213  9e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 480 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1442  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.57 
 
 		 477 aa  211  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.057405  hitchhiker  0.00000201635 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  29.16 
 
 		 483 aa  211  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  29.16 
 
 		 480 aa  210  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  29.16 
 
 		 480 aa  210  5e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  29.16 
 
 		 480 aa  210  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.95 
 
 		 480 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  28.95 
 
 		 480 aa  208  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  30.17 
 
 		 480 aa  207  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  27.47 
 
 		 480 aa  207  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1870  GntR family transcriptional regulator  30.44 
 
 		 476 aa  206  7e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  29.81 
 
 		 503 aa  206  8e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 480 aa  205  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  27.62 
 
 		 480 aa  206  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  29.39 
 
 		 477 aa  206  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 477 aa  204  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1804  GntR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 481 aa  204  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 480 aa  204  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 520 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  31.67 
 
 		 463 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2087  transcription regulator, GntR family  27.41 
 
 		 480 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000314762  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 340 aa  201  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  31.79 
 
 		 395 aa  199  7e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  29.87 
 
 		 397 aa  199  7e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  30.79 
 
 		 395 aa  199  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 398 aa  197  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  29.66 
 
 		 425 aa  197  4.0000000000000005e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 398 aa  196  7e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2637  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.74 
 
 		 493 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 400 aa  194  2e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 397 aa  195  2e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6026  GntR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 461 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  30.43 
 
 		 402 aa  194  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 395 aa  194  4e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3951  aminotransferase, class I and II  30.97 
 
 		 421 aa  194  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0704499  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1924  GntR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 468 aa  194  4e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 504 aa  193  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  27.91 
 
 		 477 aa  193  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 383 aa  193  7e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  27.7 
 
 		 477 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2212  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 468 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0372  2-aminoadipate aminotransferase / aromatic amino acid aminotransferase  31.39 
 
 		 411 aa  192  1e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0989  putative transcription regulator protein  27.79 
 
 		 490 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0613071  normal  0.192866 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  28.04 
 
 		 485 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69750  putative transcriptional regulator  27.63 
 
 		 458 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.477513  normal  0.557474 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  29.73 
 
 		 400 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 490 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2022  transcriptional regulator  25.42 
 
 		 509 aa  191  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.52 
 
 		 492 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.684396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0403  GntR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 473 aa  190  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0790125 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0919  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  27.83 
 
 		 517 aa  190  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  29.48 
 
 		 397 aa  189  9e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  28.29 
 
 		 461 aa  189  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 414 aa  188  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4267  putative transcriptional regulator, GntR family  29.54 
 
 		 454 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.525497 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2114  transcriptional regulator  27.22 
 
 		 489 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.213451 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1049  putative GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 389 aa  187  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  27.47 
 
 		 438 aa  187  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 396 aa  187  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 478 aa  187  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1939  transcriptional regulator  26.83 
 
 		 476 aa  187  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0234327  normal  0.0215976 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  27.59 
 
 		 500 aa  186  7e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5687  GntR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 486 aa  186  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  30.86 
 
 		 398 aa  186  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0411  aminotransferase  28.93 
 
 		 405 aa  186  1.0000000000000001e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.894171  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0931  transcriptional regulator  26.54 
 
 		 486 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.651676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  30.15 
 
 		 377 aa  185  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>