More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1822 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  41.41 
 
 		 881 aa  681    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  42.42 
 
 		 883 aa  671    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  42.69 
 
 		 854 aa  665    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  44.67 
 
 		 858 aa  720    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 871 aa  1767    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  42.02 
 
 		 857 aa  650    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  43.26 
 
 		 891 aa  696    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2603  DNA mismatch repair protein MutS  39.42 
 
 		 891 aa  637    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  41.52 
 
 		 873 aa  707    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  45.71 
 
 		 854 aa  684    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2173  DNA mismatch repair protein MutS  44.48 
 
 		 939 aa  649    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.01775  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1151  DNA mismatch repair protein MutS  45.8 
 
 		 882 aa  663    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75556  normal  0.534383 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  43.72 
 
 		 892 aa  707    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  42.33 
 
 		 872 aa  666    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2101  DNA mismatch repair protein MutS  40.84 
 
 		 858 aa  639    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0147  DNA mismatch repair protein MutS  42.54 
 
 		 910 aa  647    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  42.27 
 
 		 856 aa  653    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  41.13 
 
 		 855 aa  644    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  43.72 
 
 		 892 aa  708    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  43.93 
 
 		 890 aa  710    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  43.74 
 
 		 894 aa  706    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1671  DNA mismatch repair protein MutS  44.48 
 
 		 891 aa  650    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207117  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  43.64 
 
 		 858 aa  695    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  42.24 
 
 		 862 aa  670    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  40.67 
 
 		 859 aa  639    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  42.36 
 
 		 860 aa  652    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3145  DNA mismatch repair protein MutS  44.48 
 
 		 939 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1111  DNA mismatch repair protein MutS  44.64 
 
 		 922 aa  642    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.88674  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  42.21 
 
 		 855 aa  664    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  47.17 
 
 		 900 aa  780    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1159  DNA mismatch repair protein MutS  45.68 
 
 		 850 aa  652    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0179722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  43.51 
 
 		 855 aa  702    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  44.57 
 
 		 854 aa  680    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2691  DNA mismatch repair protein MutS  43.39 
 
 		 938 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0407651  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  42.47 
 
 		 863 aa  662    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  42.25 
 
 		 860 aa  652    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  44.56 
 
 		 905 aa  676    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  61.89 
 
 		 870 aa  1101    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  42.02 
 
 		 857 aa  651    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  42.25 
 
 		 855 aa  667    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  44.58 
 
 		 873 aa  703    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2612  DNA mismatch repair protein MutS  44.48 
 
 		 939 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  82 
 
 		 872 aa  1467    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  44.58 
 
 		 904 aa  711    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  42.91 
 
 		 871 aa  696    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  43.72 
 
 		 892 aa  708    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  41.33 
 
 		 856 aa  660    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  44.91 
 
 		 882 aa  675    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0670  DNA mismatch repair protein MutS  45.26 
 
 		 902 aa  653    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.48055  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  72.48 
 
 		 872 aa  1305    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  48.91 
 
 		 863 aa  741    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1913  DNA mismatch repair protein MutS  44.34 
 
 		 893 aa  653    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.396246  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  52.49 
 
 		 882 aa  756    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  42.14 
 
 		 872 aa  708    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  64.64 
 
 		 870 aa  1142    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  45.55 
 
 		 892 aa  712    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1446  DNA mismatch repair protein MutS  44.48 
 
 		 939 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  45.48 
 
 		 872 aa  694    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  49.43 
 
 		 868 aa  815    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  42.83 
 
 		 910 aa  649    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  43.26 
 
 		 887 aa  691    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  42.89 
 
 		 856 aa  677    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  43.05 
 
 		 884 aa  659    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  43.05 
 
 		 884 aa  659    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2559  DNA mismatch repair protein MutS  44.48 
 
 		 891 aa  640    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  42.14 
 
 		 872 aa  708    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  42.35 
 
 		 862 aa  659    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  46.05 
 
 		 887 aa  775    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  42.38 
 
 		 856 aa  667    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  44.35 
 
 		 859 aa  700    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  42.78 
 
 		 856 aa  673    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1075  DNA mismatch repair protein MutS  45.83 
 
 		 916 aa  679    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835373  normal  0.410772 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0142  DNA mismatch repair protein MutS  42.65 
 
 		 898 aa  650    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  46.95 
 
 		 882 aa  749    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  50.68 
 
 		 870 aa  856    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  42.27 
 
 		 861 aa  664    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5989  DNA mismatch repair protein MutS  42.78 
 
 		 885 aa  645    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  43.87 
 
 		 872 aa  707    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3263  DNA mismatch repair protein MutS  40.94 
 
 		 889 aa  639    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4031  DNA mismatch repair protein MutS  43.53 
 
 		 881 aa  637    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137829  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  43.2 
 
 		 856 aa  689    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  45.26 
 
 		 910 aa  770    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  48.59 
 
 		 910 aa  769    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  43.36 
 
 		 895 aa  714    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  43.28 
 
 		 901 aa  687    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  42.27 
 
 		 861 aa  666    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  42.16 
 
 		 861 aa  662    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  45.56 
 
 		 878 aa  660    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  42.86 
 
 		 861 aa  671    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  48.51 
 
 		 859 aa  788    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  42.73 
 
 		 874 aa  689    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2124  DNA mismatch repair protein MutS  43.89 
 
 		 886 aa  639    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  42.25 
 
 		 855 aa  667    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  42.35 
 
 		 840 aa  660    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  42.05 
 
 		 857 aa  663    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  42.31 
 
 		 854 aa  680    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  40.74 
 
 		 852 aa  655    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  43.74 
 
 		 854 aa  655    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  46.99 
 
 		 857 aa  734    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  52.11 
 
 		 889 aa  881    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>