More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0756 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0756  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 		 549 aa  1087    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  59.2 
 
 		 549 aa  598  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.62 
 
 		 550 aa  548  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.92 
 
 		 547 aa  533  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.46 
 
 		 549 aa  531  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.37 
 
 		 547 aa  525  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.57 
 
 		 550 aa  403  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.41 
 
 		 674 aa  405  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  55.61 
 
 		 549 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.25 
 
 		 545 aa  398  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.6 
 
 		 557 aa  381  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.37 
 
 		 544 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.24 
 
 		 540 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.27 
 
 		 540 aa  376  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  44.97 
 
 		 541 aa  373  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  43.6 
 
 		 544 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.76 
 
 		 540 aa  372  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.43 
 
 		 549 aa  375  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.824592  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.72 
 
 		 540 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.81 
 
 		 547 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  55.38 
 
 		 533 aa  368  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.16 
 
 		 661 aa  365  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.1 
 
 		 544 aa  361  2e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000143655  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.49 
 
 		 543 aa  359  7e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.36 
 
 		 535 aa  353  4e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.74566  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.66 
 
 		 535 aa  351  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000408371 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.93 
 
 		 538 aa  352  1e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.1 
 
 		 539 aa  347  3e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.28 
 
 		 544 aa  347  3e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.48 
 
 		 542 aa  347  4e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  55.07 
 
 		 549 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.77 
 
 		 565 aa  343  5e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.121118  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.84 
 
 		 533 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.66 
 
 		 541 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.74 
 
 		 542 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.72 
 
 		 542 aa  335  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  53.08 
 
 		 541 aa  332  8e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1032  methyl-accepting chemotaxis protein  46.84 
 
 		 645 aa  332  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.54 
 
 		 700 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.34 
 
 		 570 aa  326  5e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.05 
 
 		 533 aa  326  6e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0401  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  48.28 
 
 		 539 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0750  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  50.27 
 
 		 539 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0935  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  51.31 
 
 		 528 aa  319  9e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220244  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.56 
 
 		 563 aa  319  9e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317109  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2652  methyl-accepting chemotaxis protein  53.5 
 
 		 392 aa  318  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2579  methyl-accepting chemotaxis protein  52.68 
 
 		 543 aa  316  8e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.54 
 
 		 518 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.75 
 
 		 540 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1891  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.6 
 
 		 509 aa  311  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.745334  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.78 
 
 		 388 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.98 
 
 		 569 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1357  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.88 
 
 		 392 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9116599999999996e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.71 
 
 		 700 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.04 
 
 		 392 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0205381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  50.14 
 
 		 632 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0728  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.36 
 
 		 537 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.15 
 
 		 518 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.66 
 
 		 822 aa  301  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.92 
 
 		 532 aa  301  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0235494 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.88 
 
 		 532 aa  301  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.826751  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0960  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53 
 
 		 666 aa  296  5e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000181378  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3312  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.71 
 
 		 533 aa  295  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1035  methyl-accepting chemotaxis protein  50.27 
 
 		 549 aa  291  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.640997  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  47.92 
 
 		 546 aa  290  4e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.62 
 
 		 546 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.86 
 
 		 515 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.2 
 
 		 515 aa  282  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.04 
 
 		 540 aa  280  6e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.566239  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.97 
 
 		 549 aa  276  8e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.52 
 
 		 658 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2152  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.86 
 
 		 474 aa  248  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000647381  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3465  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.52 
 
 		 423 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.63 
 
 		 541 aa  236  7e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0916  methyl-accepting chemotaxis protein  41.19 
 
 		 394 aa  230  6e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00484593  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.56 
 
 		 543 aa  229  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.64 
 
 		 601 aa  223  6e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0241  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.37 
 
 		 393 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0575576 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.61 
 
 		 541 aa  220  6e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.6 
 
 		 541 aa  218  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.69 
 
 		 830 aa  217  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.68 
 
 		 637 aa  217  5e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.33 
 
 		 637 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0257  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.22 
 
 		 393 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.42 
 
 		 573 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0116952  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1624  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.23 
 
 		 626 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.835429  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3805  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.06 
 
 		 422 aa  213  5.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000721713  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.76 
 
 		 673 aa  212  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.712235  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.23 
 
 		 636 aa  213  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3582  methyl-accepting chemotaxis protein  30.66 
 
 		 541 aa  211  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.83 
 
 		 541 aa  211  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0582  methyl-accepting chemotaxis protein  38.81 
 
 		 696 aa  210  5e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.1 
 
 		 548 aa  210  5e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.12 
 
 		 564 aa  210  6e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000139892  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2500  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.08 
 
 		 557 aa  209  8e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.98 
 
 		 628 aa  209  9e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3394  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.16 
 
 		 664 aa  209  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000171268  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0157  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.62 
 
 		 646 aa  208  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.805637  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  32.84 
 
 		 541 aa  208  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.95 
 
 		 393 aa  208  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000818802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>