More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0398 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  100 
 
 		 118 aa  242  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  69.23 
 
 		 127 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  64.66 
 
 		 125 aa  165  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  58.59 
 
 		 129 aa  135  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  57.58 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  39.05 
 
 		 220 aa  96.3  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  41 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  38.61 
 
 		 145 aa  85.5  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  37.25 
 
 		 113 aa  83.6  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  44.94 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  36.63 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  39.6 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  33.86 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  37 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  41.76 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  42 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  27.12 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  37.11 
 
 		 279 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  35.78 
 
 		 464 aa  77.4  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  38 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  33.67 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0463  rhodanese domain-containing protein  42.05 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  38.46 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  35.05 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  33.06 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  39.18 
 
 		 288 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  43.24 
 
 		 277 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  32.67 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  34.45 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  36.47 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  32.38 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  35.29 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  36.46 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  40.43 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  33.94 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1271  rhodanese-like protein  34.62 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  37.8 
 
 		 271 aa  71.6  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  36.73 
 
 		 480 aa  71.2  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  35.64 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  37.11 
 
 		 284 aa  71.2  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  35.05 
 
 		 280 aa  71.2  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  32.32 
 
 		 229 aa  71.2  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  36.54 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2634  NADH oxidase/rhodanese-related sulfurtransferase  35.11 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0487  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  33.62 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  35.42 
 
 		 144 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2024  Rhodanese domain protein  40.91 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41 
 
 		 389 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  40.26 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  38.3 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  36.9 
 
 		 479 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2247  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.43 
 
 		 377 aa  68.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  37.8 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  35.04 
 
 		 471 aa  68.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  37.93 
 
 		 461 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  34.04 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  30.69 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4697  Rhodanese domain protein  36.27 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0900105 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1253  rhodanese domain-containing protein  38.14 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000299854 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0692  rhodanese domain-containing protein  37.76 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.53 
 
 		 379 aa  67.8  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  40.21 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  32.95 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  35.63 
 
 		 277 aa  67.8  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.38 
 
 		 392 aa  67.8  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2271  Rhodanese domain protein  35.79 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.31 
 
 		 386 aa  67.4  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4704  Rhodanese domain protein  36.08 
 
 		 114 aa  67  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.87 
 
 		 375 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  32.65 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  27.68 
 
 		 133 aa  67  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0154  rhodanese domain-containing protein  32.22 
 
 		 113 aa  67  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3448  PE-PGRS family protein  41.86 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  31.82 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  35.64 
 
 		 480 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  33.98 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  38.03 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  34.69 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  33.65 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  37.08 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  37.63 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3199  hypothetical protein  41.86 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000000504945  unclonable  0.00000352479 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  36 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  30.19 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1579  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  36.17 
 
 		 566 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1757  rhodanese domain-containing protein  35.05 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0421554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  37.08 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  32.63 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1974  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.78 
 
 		 563 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000959863  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1188  Rhodanese domain protein  36.05 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3386  hypothetical protein  37.89 
 
 		 387 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0847115 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0701  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  34.04 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.6297700000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1506  rhodanese-like domain-containing protein  36.08 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207517  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0773  Rhodanese domain protein  34.78 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>