More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0041 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  100 
 
 		 201 aa  402  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1439  SOS-response transcriptional repressor, LexA  72.14 
 
 		 201 aa  305  4.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1617  LexA repressor  68.97 
 
 		 203 aa  284  8e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  69.31 
 
 		 201 aa  277  6e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  69.31 
 
 		 201 aa  275  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  65.84 
 
 		 201 aa  267  8e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1232  transcriptional repressor, LexA family  64.14 
 
 		 209 aa  257  7e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0192  SOS-response transcriptional repressor, LexA  60.4 
 
 		 200 aa  244  6e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1572  SOS-response transcriptional repressor, LexA  53.02 
 
 		 217 aa  228  4e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  55.45 
 
 		 200 aa  225  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  45.67 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  45.24 
 
 		 269 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  45.24 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  45.24 
 
 		 206 aa  182  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  45.24 
 
 		 206 aa  182  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  45.24 
 
 		 269 aa  182  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  45.24 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  45.24 
 
 		 206 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  45.24 
 
 		 206 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  45.24 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  44.76 
 
 		 206 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  46.15 
 
 		 204 aa  181  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11470  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.69 
 
 		 207 aa  176  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  44.71 
 
 		 207 aa  174  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  46.57 
 
 		 222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  44.88 
 
 		 204 aa  168  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1400  LexA repressor  42.18 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00035573  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1427  LexA repressor  42.18 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  47.55 
 
 		 202 aa  166  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0909  LexA repressor  41.43 
 
 		 206 aa  165  5e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07410  SOS-response transcriptional repressor, LexA  44.19 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000224442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2543  LexA family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0539699  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1662  SOS-response transcriptional repressor, LexA  46.04 
 
 		 197 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  40.89 
 
 		 203 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  40.89 
 
 		 203 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0793  LexA repressor  46.04 
 
 		 207 aa  161  5.0000000000000005e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163757  hitchhiker  8.744270000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.27 
 
 		 222 aa  161  6e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1735  LexA family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 197 aa  159  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2446  transcriptional repressor, LexA family  44.83 
 
 		 226 aa  158  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.575713 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1204  LexA repressor  44.39 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000092857  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  43.38 
 
 		 238 aa  157  9e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1120  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.86 
 
 		 205 aa  157  9e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.430548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1693  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.8 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.026271  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27590  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.26 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1184  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.89 
 
 		 199 aa  155  3e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  44.67 
 
 		 196 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7132  Repressor lexA  41.94 
 
 		 236 aa  154  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2805  transcriptional repressor, LexA family  40.67 
 
 		 208 aa  154  8e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000318976  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0234  LexA family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 210 aa  153  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.38 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2168  LexA repressor  43.19 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264168  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2157  LexA repressor  43.19 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00513762 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2214  LexA repressor  43.19 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2441  LexA repressor  41.86 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.628301  normal  0.115914 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1008  repressor lexA  43.78 
 
 		 204 aa  152  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000183008  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12734  LexA repressor  42.45 
 
 		 217 aa  151  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3956  LexA repressor  42.25 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal  0.995266 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2134  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.71 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.017177 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1611  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.59 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000160494  unclonable  3.1983e-16 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1873  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.63 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.164237  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2238  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.09 
 
 		 228 aa  148  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.778697  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4471  transcriptional repressor, LexA family  40.95 
 
 		 204 aa  147  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2148  transcriptional repressor, LexA family  39.74 
 
 		 230 aa  147  8e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1701  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.04 
 
 		 229 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0677  LexA repressor  40.87 
 
 		 208 aa  145  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000451027  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2221  LexA repressor  43.9 
 
 		 233 aa  144  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0110096  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1002  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.76 
 
 		 215 aa  145  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0970  XRE family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 212 aa  144  7.0000000000000006e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0257991  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10800  SOS regulatory protein LexA  38.39 
 
 		 230 aa  144  8.000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  unclonable  0.0000000017839 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2104  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.34 
 
 		 231 aa  144  9e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.788745  normal  0.0179142 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1583  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.93 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4567  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17230  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40 
 
 		 233 aa  142  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.302677 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1451  LexA repressor  40 
 
 		 261 aa  142  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440028  normal  0.764251 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1739  LexA repressor  42.21 
 
 		 202 aa  142  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2084  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.98 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507519 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2243  LexA repressor  46.02 
 
 		 198 aa  141  7e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10620  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.39 
 
 		 234 aa  141  7e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.445804  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3779  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.29 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0927  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.84 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0770  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.94 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.953907  normal  0.283902 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1808  transcriptional repressor, LexA family  39.72 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0793  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.5 
 
 		 198 aa  137  7.999999999999999e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1434  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.48 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.298134  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1258  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.73 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1932  LexA repressor  42.79 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.424325  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3902  transcriptional repressor, LexA family  39.07 
 
 		 263 aa  136  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1479  LexA repressor  37.55 
 
 		 275 aa  136  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0381882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3817  LexA repressor  39.19 
 
 		 246 aa  136  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.18019  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0893  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.3 
 
 		 207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0427  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.65 
 
 		 243 aa  135  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783758  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3510  LexA repressor  37.83 
 
 		 256 aa  134  7.000000000000001e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2152  peptidase S24, LexA repressor  40.38 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0120342  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1237  LexA family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0151  LexA family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2433  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.34 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342507  normal  0.324912 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1054  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.81 
 
 		 241 aa  130  9e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.675228 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1506  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.71 
 
 		 244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.03098  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1939  LexA repressor  41.62 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269028  normal  0.116637 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14510  LexA repressor  40.8 
 
 		 202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>