100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_4131 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  100 
 
 		 396 aa  818    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  94.19 
 
 		 396 aa  773    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  62.28 
 
 		 402 aa  546  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  61.11 
 
 		 396 aa  523  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3322200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  61.11 
 
 		 396 aa  522  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  27.61 
 
 		 387 aa  149  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  26.07 
 
 		 408 aa  138  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  26.72 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8558  hypothetical protein  29.1 
 
 		 398 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  24.94 
 
 		 417 aa  117  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1055  domain of unknown function DUF1745  28.28 
 
 		 389 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0012  hypothetical protein  26.51 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0572769  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0911  hypothetical protein  21.98 
 
 		 400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.36206  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  24.81 
 
 		 401 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3254  domain of unknown function DUF1745  27.81 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126453  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  26.8 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3246  domain of unknown function DUF1745  24.38 
 
 		 396 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116005  normal  0.61148 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3113  hypothetical protein  27.3 
 
 		 397 aa  107  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.680527  hitchhiker  0.0000208643 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  24.68 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  27.12 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  25.2 
 
 		 381 aa  104  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  26.42 
 
 		 395 aa  103  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  24.54 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4044  hypothetical protein  25.34 
 
 		 401 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2659  hypothetical protein  27.95 
 
 		 406 aa  100  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1561  hypothetical protein  26.72 
 
 		 404 aa  100  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1891  hypothetical protein  24.85 
 
 		 391 aa  99.8  8e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.473859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0444  hypothetical protein  25.94 
 
 		 412 aa  97.8  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0091  domain of unknown function DUF1745  27.49 
 
 		 383 aa  97.4  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189874  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1400  domain of unknown function DUF1745  26.56 
 
 		 398 aa  96.3  9e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.653815  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  27.17 
 
 		 373 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0889  hypothetical protein  28.76 
 
 		 374 aa  94.7  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10891  hypothetical protein  28.64 
 
 		 386 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.824347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  24.19 
 
 		 427 aa  91.7  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10639  hypothetical protein  28.44 
 
 		 383 aa  92  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000135133  normal  0.805152 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0360  hypothetical protein  27.39 
 
 		 398 aa  91.7  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.435591  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3390  hypothetical protein  26.98 
 
 		 414 aa  89  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.0973611 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  23.87 
 
 		 1101 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0940  domain of unknown function DUF1745  23.36 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0913  domain of unknown function DUF1745  23.36 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  23.73 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1049  hypothetical protein  26.39 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198533 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0354  hypothetical protein  24.33 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0331  hypothetical protein  23.93 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3184  hypothetical protein  20.8 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2191  diguanylate cyclase  24.12 
 
 		 806 aa  77  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00068502 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  26.9 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4241  domain of unknown function DUF1745  23.63 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000432273  hitchhiker  0.00000452646 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3242  domain of unknown function DUF1745  23.48 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0186777  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4078  domain of unknown function DUF1745  25.09 
 
 		 411 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2568  FIST C domain protein  26.89 
 
 		 375 aa  72.8  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0105627  normal  0.0110126 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0438  domain of unknown function DUF1745  26.34 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2305  domain of unknown function DUF1745  21.18 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3884  domain of unknown function DUF1745  25.44 
 
 		 1852 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0294  hypothetical protein  23.48 
 
 		 375 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1387  hypothetical protein  23.11 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1108  domain of unknown function DUF1745  23.11 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3636  hypothetical protein  23.48 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0371475  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0696  transcriptional regulator, TrmB  22.29 
 
 		 512 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2063  hypothetical protein  22.48 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.748308  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  23.4 
 
 		 629 aa  62.4  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0140  FIST C domain protein  24.06 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1203  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  21.47 
 
 		 932 aa  60.8  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00343755  normal  0.259486 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0281  hypothetical protein  24.07 
 
 		 431 aa  60.1  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.812324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0615  hypothetical protein  25.69 
 
 		 468 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.948448  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24381  hypothetical protein  23.55 
 
 		 429 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2912  hypothetical protein  25.31 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1369  hypothetical protein  26.39 
 
 		 468 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0268  diguanylate cyclase  19.49 
 
 		 933 aa  57.4  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0380534  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5581  hypothetical protein  22.54 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19369  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6102  domain of unknown function DUF1745  23.29 
 
 		 386 aa  55.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0288  hypothetical protein  25.39 
 
 		 467 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0550  hypothetical protein  25.65 
 
 		 467 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1202  fused sensor protein/response regulator  21.35 
 
 		 934 aa  53.5  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127641  normal  0.087847 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1204  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  21.3 
 
 		 931 aa  52.8  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271509 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0306  hypothetical protein  23.49 
 
 		 447 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3160  domain of unknown function DUF1745  25 
 
 		 421 aa  51.2  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3887  hypothetical protein  25 
 
 		 421 aa  51.2  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.894307 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0895  FIST C domain protein  22.49 
 
 		 350 aa  49.3  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000443325  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0527  hypothetical protein  23.11 
 
 		 411 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.437223  hitchhiker  0.00000299697 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3953  hypothetical protein  23.44 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1939  hypothetical protein  25.42 
 
 		 384 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2542  hypothetical protein  19.41 
 
 		 395 aa  46.2  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1434  domain of unknown function DUF1745  22.27 
 
 		 402 aa  46.6  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318192  normal  0.236861 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2052  domain of unknown function DUF1745  22.69 
 
 		 379 aa  46.2  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4045  hypothetical protein  23.4 
 
 		 378 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0732  hypothetical protein  22.01 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1892  hypothetical protein  30.38 
 
 		 382 aa  45.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.056146  normal  0.181862 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1054  hypothetical protein  25 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1561  hypothetical protein  19.91 
 
 		 394 aa  45.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0408772  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3261  hypothetical protein  23.42 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.389498 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4508  hypothetical protein  26.63 
 
 		 439 aa  44.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260066 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4934  hypothetical protein  21.77 
 
 		 422 aa  44.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2538  hypothetical protein  21.48 
 
 		 382 aa  43.9  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02432  hypothetical protein  24.56 
 
 		 391 aa  43.9  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0700  hypothetical protein  22.38 
 
 		 380 aa  43.9  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal  0.0832434 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0466  domain of unknown function DUF1745  24.16 
 
 		 385 aa  43.1  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1435  hypothetical protein  23.47 
 
 		 501 aa  43.1  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29005  predicted protein  22.99 
 
 		 313 aa  43.1  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.161534  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2940  hypothetical protein  22.87 
 
 		 402 aa  42.7  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00513133 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>