221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6531 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6531  hypothetical protein  100 
 
 
417 aa  830  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.830465  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0282  Mur ligase  85.13 
 
 
416 aa  689  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0648  domain of unknown function DUF1727  43.37 
 
 
412 aa  310  3e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0913  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  43.39 
 
 
429 aa  297  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323703  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1706  hypothetical protein  48.79 
 
 
421 aa  293  4e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0418667  hitchhiker  0.00728652 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2714  putative ligase  43.91 
 
 
418 aa  288  2e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0468  hypothetical protein  43.37 
 
 
424 aa  284  3e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.748006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3222  hypothetical protein  44.5 
 
 
415 aa  283  5e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0406463 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4348  domain of unknown function DUF1727  43.28 
 
 
418 aa  282  9e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229746  normal  0.964565 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3448  hypothetical protein  44.31 
 
 
420 aa  280  3e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1034  domain of unknown function DUF1727  46.84 
 
 
394 aa  278  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4298  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  42.72 
 
 
411 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2661  hypothetical protein  43.45 
 
 
410 aa  266  4e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4990  hypothetical protein  42.53 
 
 
408 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4901  hypothetical protein  42.53 
 
 
408 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5269  hypothetical protein  42.03 
 
 
408 aa  262  8e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235064  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0442  domain of unknown function DUF1727  40.72 
 
 
425 aa  250  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4002  domain of unknown function DUF1727  42.39 
 
 
412 aa  250  4e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1291  hypothetical protein  42.28 
 
 
406 aa  246  4e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13744  ligase  41.85 
 
 
413 aa  243  3e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00431951  normal  0.370504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5520  hypothetical protein  41.26 
 
 
425 aa  239  5e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33342  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1442  domain of unknown function DUF1727  36.84 
 
 
408 aa  191  2e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1627  domain of unknown function DUF1727  33.41 
 
 
462 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2945  domain of unknown function DUF1727  33.78 
 
 
474 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.833945  hitchhiker  0.00605856 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3270  domain of unknown function DUF1727  35.24 
 
 
458 aa  170  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.704416  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0514  hypothetical protein  31.31 
 
 
445 aa  166  5e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.265585  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3614  hypothetical protein  33.62 
 
 
463 aa  166  8e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529006  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1345  domain of unknown function DUF1727  32.29 
 
 
476 aa  164  2e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.49333e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1208  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  31.08 
 
 
449 aa  163  6e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.970096  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4285  hypothetical protein  31.66 
 
 
447 aa  160  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1946  hypothetical protein  29.33 
 
 
437 aa  159  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.102068  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1980  hypothetical protein  29.33 
 
 
437 aa  159  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.270286  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2069  domain of unknown function DUF1727  29.06 
 
 
467 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0981076  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0500  hypothetical protein  33.47 
 
 
491 aa  156  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.496593  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1785  domain of unknown function DUF1727  30.38 
 
 
446 aa  154  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0144804  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1250  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  31.28 
 
 
455 aa  152  9e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.2325e-08  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1430  Mur ligase family protein  29.1 
 
 
437 aa  152  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67526  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1788  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  30.14 
 
 
452 aa  152  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0985  domain of unknown function DUF1727  28.3 
 
 
443 aa  152  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  2.65712e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0588  hypothetical protein  35.54 
 
 
469 aa  148  2e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.414158  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0008  hypothetical protein  27.06 
 
 
446 aa  148  2e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1599  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  30.79 
 
 
445 aa  148  2e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.709076  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3108  domain of unknown function DUF1727  30.42 
 
 
448 aa  147  4e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3012  domain of unknown function DUF1727  30.42 
 
 
448 aa  147  4e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0013  domain of unknown function DUF1727  30.98 
 
 
444 aa  145  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0450  hypothetical protein  29.43 
 
 
445 aa  145  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1233  Mur ligase family protein  29.66 
 
 
441 aa  144  3e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.198792  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0443  domain of unknown function DUF1727  35.15 
 
 
463 aa  144  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0884  mur ligase family protein  28.4 
 
 
447 aa  144  4e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  34.24 
 
 
744 aa  143  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1206  Mur ligase family protein  27.85 
 
 
451 aa  143  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0554717  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1392  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthetase MurC-like protein  27.63 
 
 
451 aa  142  9e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0524526  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1559  domain of unknown function DUF1727  29.6 
 
 
445 aa  140  4e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181708 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2009  hypothetical protein  32.35 
 
 
466 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  9.64515e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1153  domain of unknown function DUF1727  33.49 
 
 
474 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0440  hypothetical protein  29.02 
 
 
467 aa  137  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1255  hypothetical protein  31.61 
 
 
507 aa  132  2e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0966  hypothetical protein  29.11 
 
 
464 aa  127  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3016  hypothetical protein  33.88 
 
 
436 aa  121  2e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1027  domain of unknown function DUF1727  31.78 
 
 
456 aa  119  1e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0076  Mur ligase middle domain protein  29.83 
 
 
472 aa  113  5e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85492e-07 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0996  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  31.63 
 
 
455 aa  112  1e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00110541  normal  0.028804 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2036  domain of unknown function DUF1727  32.61 
 
 
430 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.88378e-11 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17860  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  26.04 
 
 
445 aa  95.9  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.934196  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2306  hypothetical protein  31.25 
 
 
429 aa  82.4  1e-14  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0105732  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1231  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  39.41 
 
 
490 aa  80.9  4e-14  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.661721  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2613  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  29.84 
 
 
473 aa  68.6  2e-10  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00649562  unclonable  5.96507e-12 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3810  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  29.64 
 
 
489 aa  60.5  5e-08  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.144086  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0849  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  28.79 
 
 
474 aa  59.3  1e-07  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1327  Mur ligase middle domain protein  22.7 
 
 
470 aa  55.8  1e-06  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  3.99076e-06  decreased coverage  0.000242236 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09480  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  30.32 
 
 
471 aa  55.1  2e-06  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0452016  normal  0.0351394 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0690  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  29.41 
 
 
465 aa  55.1  2e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05211  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  26.81 
 
 
460 aa  55.1  2e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4218  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  28.17 
 
 
488 aa  55.1  2e-06  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2456  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate--D-alanyl-D-alanyl ligase  24.41 
 
 
465 aa  54.7  3e-06  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3483  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  28.52 
 
 
461 aa  54.3  4e-06  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2047  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  29.28 
 
 
477 aa  53.9  5e-06  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00131729  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2103  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  30.25 
 
 
465 aa  53.5  6e-06  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188407  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3452  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  28.46 
 
 
484 aa  53.9  6e-06  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000273756 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0779  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  30.25 
 
 
465 aa  53.5  6e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.230521  normal  0.687569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1685  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  27.47 
 
 
460 aa  53.5  6e-06  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0488  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  26.76 
 
 
488 aa  53.5  7e-06  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.275208  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2090  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  31.52 
 
 
486 aa  53.5  7e-06  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.787988  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14121  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  22.98 
 
 
457 aa  53.1  8e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0237832 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0686  UDP-N-acetylmuramate  27.82 
 
 
461 aa  52.8  1e-05  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0355  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  28.32 
 
 
484 aa  51.6  2e-05  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000792879 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1435  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25 
 
 
455 aa  52  2e-05  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0676  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  26.09 
 
 
462 aa  52.4  2e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0451  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  28.28 
 
 
491 aa  52  2e-05  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.367175  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3144  UDP-N-acetylmuramate  27.31 
 
 
479 aa  52  2e-05  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0349  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  27.63 
 
 
487 aa  51.2  3e-05  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.593739  normal  0.1204 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0414  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  27.11 
 
 
488 aa  50.8  4e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104727 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0428  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  27.11 
 
 
488 aa  50.8  4e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.19875  hitchhiker  9.35532e-11 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0653  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  25.59 
 
 
501 aa  50.8  4e-05  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0402  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  27.11 
 
 
488 aa  50.8  4e-05  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.366897  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0387  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  26.41 
 
 
488 aa  50.8  4e-05  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.110933  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3742  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  26.41 
 
 
488 aa  50.8  4e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113506  hitchhiker  3.37645e-07 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0403  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  27.11 
 
 
488 aa  50.8  4e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0491685  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0929  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  23.14 
 
 
469 aa  50.4  5e-05  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.418814  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3469  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  28.68 
 
 
467 aa  50.8  5e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0154582  hitchhiker  0.00481744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>