More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6507 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 270 aa  530  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  77.06 
 
 		 239 aa  348  8e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  59.47 
 
 		 241 aa  276  4e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  60.17 
 
 		 233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  59.32 
 
 		 233 aa  271  9e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.16 
 
 		 239 aa  266  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  56.83 
 
 		 239 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.26 
 
 		 231 aa  264  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.68 
 
 		 241 aa  261  6e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  59.03 
 
 		 236 aa  261  6.999999999999999e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.19 
 
 		 242 aa  261  1e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  58.08 
 
 		 246 aa  260  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.69 
 
 		 244 aa  260  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.52 
 
 		 240 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  56.22 
 
 		 247 aa  256  3e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  60 
 
 		 242 aa  256  3e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  55.6 
 
 		 238 aa  256  4e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  55.74 
 
 		 239 aa  255  6e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  55.74 
 
 		 239 aa  255  6e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  55.74 
 
 		 239 aa  255  6e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  56.09 
 
 		 233 aa  254  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  57.58 
 
 		 235 aa  253  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  56.17 
 
 		 234 aa  253  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  55.26 
 
 		 239 aa  251  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4408  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.96 
 
 		 230 aa  251  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  55.95 
 
 		 236 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0219  two component transcriptional regulator  56.83 
 
 		 237 aa  250  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127265  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  57.83 
 
 		 229 aa  249  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  55.19 
 
 		 239 aa  249  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  55.51 
 
 		 238 aa  249  5e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.47 
 
 		 243 aa  247  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.99 
 
 		 236 aa  245  4e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.95 
 
 		 236 aa  245  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  51.23 
 
 		 243 aa  245  6.999999999999999e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.65 
 
 		 273 aa  243  3e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  51.93 
 
 		 241 aa  243  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  53.65 
 
 		 406 aa  241  6e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.49 
 
 		 237 aa  241  1e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  57.71 
 
 		 234 aa  240  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0899  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.58 
 
 		 236 aa  240  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.383063 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0720  response regulator receiver domain protein  48.35 
 
 		 246 aa  239  2.9999999999999997e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.351492 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3340  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.31 
 
 		 258 aa  239  4e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454745 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1418  response regulator receiver  55.47 
 
 		 251 aa  239  5e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0582944 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  54.67 
 
 		 248 aa  238  8e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  54.22 
 
 		 252 aa  237  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  52 
 
 		 236 aa  235  7e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1384  two component transcriptional regulator  56.52 
 
 		 252 aa  233  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00801111  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.88 
 
 		 235 aa  229  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.79 
 
 		 271 aa  228  6e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.42 
 
 		 233 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3267  winged helix family two component transcriptional regulator  55.26 
 
 		 229 aa  227  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0891778  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  49.57 
 
 		 257 aa  223  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6147  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.9 
 
 		 244 aa  219  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200947 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  53.04 
 
 		 231 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  49.11 
 
 		 286 aa  211  9e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4688  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.44 
 
 		 252 aa  210  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0804  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.03 
 
 		 246 aa  209  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1724  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.09 
 
 		 243 aa  209  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5255  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.11 
 
 		 242 aa  208  8e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  48.13 
 
 		 246 aa  206  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 227 aa  206  5e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 246 aa  204  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  46.96 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.96 
 
 		 228 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3926  two component transcriptional regulator  48.89 
 
 		 254 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4000  two component transcriptional regulator  48.89 
 
 		 254 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3941  two component transcriptional regulator  48.89 
 
 		 254 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  46.38 
 
 		 231 aa  202  7e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  46.52 
 
 		 230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  43.97 
 
 		 239 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  43.97 
 
 		 239 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4429  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.133228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  43.97 
 
 		 239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  46.09 
 
 		 230 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  46.09 
 
 		 230 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  46.09 
 
 		 230 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  43.53 
 
 		 239 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  43.53 
 
 		 239 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  43.53 
 
 		 239 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  43.53 
 
 		 239 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  43.53 
 
 		 239 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  43.23 
 
 		 227 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  43.53 
 
 		 239 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  44.78 
 
 		 229 aa  197  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  42.36 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  42.36 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.78 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  42.36 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.89 
 
 		 235 aa  195  6e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 240 aa  195  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 223 aa  195  6e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 232 aa  195  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22060  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.29 
 
 		 254 aa  195  7e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0729677  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2266  two component transcriptional regulator  47.56 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 224 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  45.16 
 
 		 283 aa  192  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.78 
 
 		 238 aa  192  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 228 aa  191  9e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>