126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3932 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3932  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  570  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3854  hypothetical protein  71.93 
 
 		 286 aa  418  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357835  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2688  hypothetical protein  68.42 
 
 		 286 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.566827  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6257  hypothetical protein  69.12 
 
 		 285 aa  397  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.949372  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6698  hypothetical protein  51.39 
 
 		 291 aa  270  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.490421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0252  hypothetical protein  54.81 
 
 		 290 aa  260  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0151  hypothetical protein  50.87 
 
 		 283 aa  250  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0952  hypothetical protein  50.7 
 
 		 285 aa  248  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7266  hypothetical protein  49.66 
 
 		 334 aa  245  6e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4343  hypothetical protein  47.2 
 
 		 288 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0059  hypothetical protein  47.78 
 
 		 303 aa  226  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1071  hypothetical protein  47.55 
 
 		 304 aa  224  9e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38250  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  45.45 
 
 		 280 aa  218  8.999999999999998e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4349  hypothetical protein  43.86 
 
 		 324 aa  217  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5643  hypothetical protein  46.26 
 
 		 297 aa  217  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3965  hypothetical protein  44.37 
 
 		 324 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1368  hypothetical protein  49.8 
 
 		 281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233326  normal  0.203451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1068  hypothetical protein  49.19 
 
 		 276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1084  hypothetical protein  49.19 
 
 		 276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0372016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1367  hypothetical protein  48.57 
 
 		 285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134083 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13500  hypothetical protein  47.15 
 
 		 285 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000277953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1067  hypothetical protein  43.96 
 
 		 283 aa  212  7e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1083  hypothetical protein  43.96 
 
 		 283 aa  212  7e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.377526  normal  0.11045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1094  hypothetical protein  43.96 
 
 		 283 aa  212  7e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1095  hypothetical protein  48.79 
 
 		 276 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2620  hypothetical protein  45.95 
 
 		 296 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3207  putative F420-dependent oxidoreductase  47.41 
 
 		 272 aa  206  5e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5006  hypothetical protein  44.66 
 
 		 287 aa  205  7e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3680  putative F420-dependent oxidoreductase  48.8 
 
 		 281 aa  203  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5005  hypothetical protein  45.63 
 
 		 294 aa  201  8e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3644  hypothetical protein  43.54 
 
 		 307 aa  198  7.999999999999999e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0497  hypothetical protein  41.96 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0508  hypothetical protein  41.96 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0486  hypothetical protein  41.96 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1512  hypothetical protein  43.66 
 
 		 279 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00633715  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2385  putative F420-dependent oxidoreductase  43.06 
 
 		 288 aa  190  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1545  hypothetical protein  45.91 
 
 		 301 aa  188  8e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000935429  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5428  hypothetical protein  37.5 
 
 		 275 aa  149  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4154  hypothetical protein  40.43 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.238248  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5686  hypothetical protein  34.85 
 
 		 271 aa  118  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100066 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  29.76 
 
 		 318 aa  85.9  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.42 
 
 		 322 aa  79  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  29.04 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  28.52 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  27.96 
 
 		 344 aa  68.9  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  27.27 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  26.02 
 
 		 350 aa  65.9  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  26.02 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  27.08 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2916  luciferase family protein  29.24 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  25.77 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  19.81 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  24.92 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  25.18 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  25.5 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  25.87 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.06 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.29 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.15 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2453  luciferase family protein  28.67 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1412  luciferase family protein  26.9 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3731  luciferase-like protein  28.12 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.23 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3804  luciferase family protein  28.12 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0754765 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  26.59 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3743  luciferase family protein  28.12 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.17 
 
 		 320 aa  54.3  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.07 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  21.28 
 
 		 345 aa  53.9  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4047  luciferase family protein  33.14 
 
 		 347 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  0.465581 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  27.42 
 
 		 346 aa  53.5  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.27 
 
 		 332 aa  52.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  28.57 
 
 		 283 aa  52.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  24.46 
 
 		 346 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  25.45 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  25.45 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  25.45 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4308  luciferase family protein  26.3 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1995  putative F420-dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 346 aa  51.6  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  29.21 
 
 		 349 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  24.22 
 
 		 344 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  25.27 
 
 		 318 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  23.08 
 
 		 347 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1055  methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.87 
 
 		 320 aa  50.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.411528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0892  methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.87 
 
 		 320 aa  50.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  24.15 
 
 		 359 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  29.38 
 
 		 349 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  24.03 
 
 		 350 aa  49.7  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3612  luciferase family protein  26.75 
 
 		 342 aa  48.9  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4576  putative oxidoreductase  28.18 
 
 		 355 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.248726  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.54 
 
 		 328 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.43 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  25.09 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4934  luciferase-like protein  29.1 
 
 		 309 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5022  luciferase family protein  29.1 
 
 		 309 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.125832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  25.65 
 
 		 342 aa  47  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  25.51 
 
 		 346 aa  46.6  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3116  luciferase family protein  28.67 
 
 		 324 aa  46.6  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.878039  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.12 
 
 		 351 aa  46.6  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  22.88 
 
 		 336 aa  46.2  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>