116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3644 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3644  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  609  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2620  hypothetical protein  64.07 
 
 		 296 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4349  hypothetical protein  61.54 
 
 		 324 aa  343  2e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3965  hypothetical protein  61.54 
 
 		 324 aa  339  2.9999999999999998e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7266  hypothetical protein  47.67 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1071  hypothetical protein  46.62 
 
 		 304 aa  223  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0059  hypothetical protein  46.46 
 
 		 303 aa  223  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6698  hypothetical protein  47.16 
 
 		 291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.490421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5643  hypothetical protein  45.51 
 
 		 297 aa  208  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3932  hypothetical protein  43.54 
 
 		 286 aa  202  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38250  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  45.08 
 
 		 280 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0151  hypothetical protein  42.71 
 
 		 283 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3854  hypothetical protein  42.28 
 
 		 286 aa  189  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357835  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0252  hypothetical protein  44.6 
 
 		 290 aa  182  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4343  hypothetical protein  40.88 
 
 		 288 aa  181  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2688  hypothetical protein  40.47 
 
 		 286 aa  176  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.566827  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6257  hypothetical protein  39.12 
 
 		 285 aa  175  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.949372  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1367  hypothetical protein  38.91 
 
 		 285 aa  165  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1067  hypothetical protein  37.99 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1083  hypothetical protein  37.99 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.377526  normal  0.11045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1094  hypothetical protein  37.99 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2385  putative F420-dependent oxidoreductase  43.24 
 
 		 288 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3680  putative F420-dependent oxidoreductase  41.42 
 
 		 281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0497  hypothetical protein  40.14 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0508  hypothetical protein  40.14 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0486  hypothetical protein  40.14 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13500  hypothetical protein  41.37 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000277953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1512  hypothetical protein  43.17 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00633715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5005  hypothetical protein  41.67 
 
 		 294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1068  hypothetical protein  42.41 
 
 		 276 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1084  hypothetical protein  42.41 
 
 		 276 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0372016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1095  hypothetical protein  42.41 
 
 		 276 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0952  hypothetical protein  37.37 
 
 		 285 aa  160  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5006  hypothetical protein  37.82 
 
 		 287 aa  159  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1368  hypothetical protein  40.98 
 
 		 281 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233326  normal  0.203451 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4154  hypothetical protein  42.07 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.238248  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3207  putative F420-dependent oxidoreductase  40.78 
 
 		 272 aa  156  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1545  hypothetical protein  39.85 
 
 		 301 aa  149  8e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000935429  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5428  hypothetical protein  32.12 
 
 		 275 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5686  hypothetical protein  31.8 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.53 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  26.67 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  28.34 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  26.69 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  27.76 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2778  Luciferase-like monooxygenase  33.12 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  26.53 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  27.09 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  27.96 
 
 		 346 aa  55.8  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  25.08 
 
 		 344 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  23.49 
 
 		 339 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  29.24 
 
 		 372 aa  55.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  26.8 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  27.48 
 
 		 326 aa  53.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  24.4 
 
 		 350 aa  53.1  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  26.46 
 
 		 309 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  23.35 
 
 		 350 aa  52.4  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.97 
 
 		 336 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  26.42 
 
 		 343 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  27.03 
 
 		 327 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  25.07 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.31 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  24.33 
 
 		 340 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  24.33 
 
 		 340 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.33 
 
 		 340 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  27.42 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  36.05 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  25.71 
 
 		 346 aa  50.8  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  26.37 
 
 		 344 aa  50.1  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  40.58 
 
 		 361 aa  50.1  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  23.61 
 
 		 353 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.89 
 
 		 318 aa  49.7  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.82 
 
 		 332 aa  49.7  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4576  putative oxidoreductase  27.8 
 
 		 355 aa  49.3  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.248726  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  24.92 
 
 		 346 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3731  luciferase-like protein  27.27 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3804  luciferase family protein  27.27 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0754765 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  23.85 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3743  luciferase family protein  27.27 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  25.08 
 
 		 345 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  30.86 
 
 		 348 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.12 
 
 		 346 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0223  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.59 
 
 		 341 aa  46.6  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.04 
 
 		 339 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2391  luciferase-like  32.56 
 
 		 351 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  25.29 
 
 		 349 aa  46.2  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5730  luciferase family protein  31.17 
 
 		 353 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  26.84 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  35.62 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  23.82 
 
 		 349 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  22.8 
 
 		 349 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2460  putative F420-dependent oxidoreductase  31.44 
 
 		 531 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.952845  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  25.91 
 
 		 359 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  21.85 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.89 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  23.66 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  23.66 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  26.05 
 
 		 317 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1677  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.33 
 
 		 325 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  33.33 
 
 		 345 aa  44.3  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>