64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6698 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6698  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  579  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.490421  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4343  hypothetical protein  59.65 
 
 
288 aa  326  3e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0252  hypothetical protein  57.3 
 
 
290 aa  308  9e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38250  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  56.55 
 
 
280 aa  290  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201502  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0151  hypothetical protein  54.23 
 
 
283 aa  271  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3932  hypothetical protein  51.39 
 
 
286 aa  270  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3854  hypothetical protein  50.52 
 
 
286 aa  259  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357835  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6257  hypothetical protein  49.66 
 
 
285 aa  258  6e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.949372  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1083  hypothetical protein  52.83 
 
 
283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.377526  normal  0.11045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1094  hypothetical protein  52.83 
 
 
283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5006  hypothetical protein  52.45 
 
 
287 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1067  hypothetical protein  52.83 
 
 
283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2688  hypothetical protein  49.13 
 
 
286 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.566827  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1512  hypothetical protein  51.39 
 
 
279 aa  250  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00633715  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1367  hypothetical protein  52.45 
 
 
285 aa  249  4e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.134083 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3207  putative F420-dependent oxidoreductase  51.29 
 
 
272 aa  247  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13500  hypothetical protein  52.55 
 
 
285 aa  246  4e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000277953  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1368  hypothetical protein  50.36 
 
 
281 aa  237  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233326  normal  0.203451 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5643  hypothetical protein  49.82 
 
 
297 aa  236  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2620  hypothetical protein  49.83 
 
 
296 aa  236  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2385  putative F420-dependent oxidoreductase  52.52 
 
 
288 aa  236  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1068  hypothetical protein  49.06 
 
 
276 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1084  hypothetical protein  49.06 
 
 
276 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0372016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1095  hypothetical protein  49.06 
 
 
276 aa  235  6e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0952  hypothetical protein  46.58 
 
 
285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4349  hypothetical protein  48.97 
 
 
324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5005  hypothetical protein  48.59 
 
 
294 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3965  hypothetical protein  48.62 
 
 
324 aa  230  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1071  hypothetical protein  47.57 
 
 
304 aa  228  7e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0059  hypothetical protein  45.92 
 
 
303 aa  228  8e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7266  hypothetical protein  46.23 
 
 
334 aa  225  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3680  putative F420-dependent oxidoreductase  53.01 
 
 
281 aa  222  6e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1545  hypothetical protein  48.83 
 
 
301 aa  210  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000935429  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3644  hypothetical protein  46.64 
 
 
307 aa  209  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0497  hypothetical protein  40.55 
 
 
303 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0508  hypothetical protein  40.55 
 
 
303 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0486  hypothetical protein  40.55 
 
 
303 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5428  hypothetical protein  39.84 
 
 
275 aa  158  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5686  hypothetical protein  37.82 
 
 
271 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0100066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4154  hypothetical protein  38.38 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.238248  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  28.57 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  27.8 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.64 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  29.7 
 
 
327 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  28.87 
 
 
309 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  28.32 
 
 
346 aa  60.1  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  29.49 
 
 
306 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  25.78 
 
 
335 aa  52.4  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  27.66 
 
 
318 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  26.88 
 
 
318 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  27.66 
 
 
318 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  27.66 
 
 
318 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  26.71 
 
 
344 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  27.49 
 
 
318 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  30.65 
 
 
301 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  28.52 
 
 
321 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.85 
 
 
339 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4308  luciferase family protein  27.11 
 
 
318 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.69 
 
 
318 aa  44.3  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2916  luciferase family protein  25.87 
 
 
330 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2758  Luciferase-like monooxygenase  27.91 
 
 
296 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  28.03 
 
 
283 aa  43.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  26.26 
 
 
317 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  22.46 
 
 
353 aa  42.7  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>