74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2385 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2385  putative F420-dependent oxidoreductase  100 
 
 
288 aa  559  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38250  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  59.71 
 
 
280 aa  303  2.0000000000000002e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201502  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5005  hypothetical protein  56.99 
 
 
294 aa  284  9e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1368  hypothetical protein  55.59 
 
 
281 aa  282  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233326  normal  0.203451 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1367  hypothetical protein  54.87 
 
 
285 aa  281  9e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.134083 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1095  hypothetical protein  57.5 
 
 
276 aa  279  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1068  hypothetical protein  57.5 
 
 
276 aa  279  4e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1084  hypothetical protein  57.5 
 
 
276 aa  279  4e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0372016 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13500  hypothetical protein  57.03 
 
 
285 aa  277  1e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000277953  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5006  hypothetical protein  53.79 
 
 
287 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1512  hypothetical protein  51.77 
 
 
279 aa  263  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00633715  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1094  hypothetical protein  52.73 
 
 
283 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1083  hypothetical protein  52.73 
 
 
283 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.377526  normal  0.11045 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1067  hypothetical protein  52.73 
 
 
283 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3207  putative F420-dependent oxidoreductase  54.41 
 
 
272 aa  260  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3680  putative F420-dependent oxidoreductase  51.71 
 
 
281 aa  246  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6698  hypothetical protein  52.52 
 
 
291 aa  247  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.490421  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0151  hypothetical protein  50.18 
 
 
283 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0252  hypothetical protein  52.34 
 
 
290 aa  238  8e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4343  hypothetical protein  45.8 
 
 
288 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5643  hypothetical protein  48.54 
 
 
297 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2620  hypothetical protein  45.64 
 
 
296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0952  hypothetical protein  44.87 
 
 
285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3932  hypothetical protein  43.06 
 
 
286 aa  193  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1545  hypothetical protein  46.15 
 
 
301 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000935429  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6257  hypothetical protein  43.68 
 
 
285 aa  186  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.949372  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7266  hypothetical protein  41.64 
 
 
334 aa  183  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1071  hypothetical protein  43.75 
 
 
304 aa  180  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3854  hypothetical protein  42.91 
 
 
286 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357835  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4349  hypothetical protein  41.7 
 
 
324 aa  178  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2688  hypothetical protein  40.8 
 
 
286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.566827  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3965  hypothetical protein  40.99 
 
 
324 aa  170  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0059  hypothetical protein  38.74 
 
 
303 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3644  hypothetical protein  43.24 
 
 
307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0497  hypothetical protein  39.19 
 
 
303 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0486  hypothetical protein  39.19 
 
 
303 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0508  hypothetical protein  39.19 
 
 
303 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4154  hypothetical protein  40.39 
 
 
301 aa  146  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.238248  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5428  hypothetical protein  38.21 
 
 
275 aa  132  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5686  hypothetical protein  38.58 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0100066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  29.52 
 
 
318 aa  68.9  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  27.34 
 
 
318 aa  65.1  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.12 
 
 
322 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  25.99 
 
 
344 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2852  luciferase family protein  30.07 
 
 
314 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.709446  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  26.94 
 
 
327 aa  58.9  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  23.7 
 
 
359 aa  55.8  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  27.04 
 
 
346 aa  53.9  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4112  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.03 
 
 
344 aa  52.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.273719  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  26.77 
 
 
309 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  24.91 
 
 
335 aa  49.3  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1412  luciferase family protein  27.68 
 
 
318 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  25.1 
 
 
306 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  25.53 
 
 
351 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  41.1 
 
 
333 aa  46.6  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  23.9 
 
 
353 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.62 
 
 
339 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  26.81 
 
 
326 aa  46.2  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  25.16 
 
 
346 aa  45.8  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  24.57 
 
 
350 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  27.04 
 
 
318 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  24.52 
 
 
349 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  24.57 
 
 
350 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.52 
 
 
333 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  27.67 
 
 
309 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  24.52 
 
 
349 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  24.52 
 
 
349 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  26.64 
 
 
301 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3861  luciferase family protein  32.61 
 
 
349 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  23.99 
 
 
345 aa  43.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3612  luciferase family protein  24.58 
 
 
342 aa  43.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.48 
 
 
334 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7143  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.67 
 
 
345 aa  42.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0956909 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1517  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.25 
 
 
255 aa  42  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351914  normal  0.0459793 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>