64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1512 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1512  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  549  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00633715  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38250  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  61.87 
 
 
280 aa  332  3e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201502  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3207  putative F420-dependent oxidoreductase  56.62 
 
 
272 aa  302  4.0000000000000003e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1094  hypothetical protein  54.91 
 
 
283 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1067  hypothetical protein  54.91 
 
 
283 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1083  hypothetical protein  54.91 
 
 
283 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.377526  normal  0.11045 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5006  hypothetical protein  52.35 
 
 
287 aa  277  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1367  hypothetical protein  51.81 
 
 
285 aa  278  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.134083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1068  hypothetical protein  52.54 
 
 
276 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1084  hypothetical protein  52.54 
 
 
276 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0372016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1095  hypothetical protein  52.17 
 
 
276 aa  268  7e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3680  putative F420-dependent oxidoreductase  53.54 
 
 
281 aa  265  8.999999999999999e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13500  hypothetical protein  49.82 
 
 
285 aa  263  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000277953  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1368  hypothetical protein  50.54 
 
 
281 aa  263  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233326  normal  0.203451 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2385  putative F420-dependent oxidoreductase  51.77 
 
 
288 aa  261  8.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5005  hypothetical protein  49.48 
 
 
294 aa  261  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6698  hypothetical protein  51.39 
 
 
291 aa  252  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.490421  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0252  hypothetical protein  50.8 
 
 
290 aa  235  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0151  hypothetical protein  51.69 
 
 
283 aa  231  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4343  hypothetical protein  47.74 
 
 
288 aa  228  8e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0952  hypothetical protein  47.76 
 
 
285 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5643  hypothetical protein  47.62 
 
 
297 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1545  hypothetical protein  50.83 
 
 
301 aa  202  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000935429  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3932  hypothetical protein  43.66 
 
 
286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3854  hypothetical protein  43.87 
 
 
286 aa  192  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357835  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2688  hypothetical protein  42.38 
 
 
286 aa  187  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.566827  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7266  hypothetical protein  43.01 
 
 
334 aa  186  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6257  hypothetical protein  44.61 
 
 
285 aa  186  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.949372  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1071  hypothetical protein  42.96 
 
 
304 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2620  hypothetical protein  42.65 
 
 
296 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0059  hypothetical protein  40.66 
 
 
303 aa  168  8e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3644  hypothetical protein  43.17 
 
 
307 aa  165  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4349  hypothetical protein  44 
 
 
324 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3965  hypothetical protein  42.34 
 
 
324 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0508  hypothetical protein  38.06 
 
 
303 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0497  hypothetical protein  38.06 
 
 
303 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0486  hypothetical protein  38.06 
 
 
303 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4154  hypothetical protein  39.05 
 
 
301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.238248  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5428  hypothetical protein  38.59 
 
 
275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5686  hypothetical protein  37.69 
 
 
271 aa  125  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0100066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  26.03 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.82 
 
 
322 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  29.55 
 
 
318 aa  63.5  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  27.69 
 
 
346 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  28.66 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  29.41 
 
 
309 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  25.08 
 
 
318 aa  48.9  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  25.85 
 
 
321 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5876  luciferase family protein  41.86 
 
 
349 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195682  normal  0.21189 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3725  luciferase family protein  26.82 
 
 
316 aa  47  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.290268  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.45 
 
 
334 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  23.81 
 
 
344 aa  46.2  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4429  luciferase family protein  40 
 
 
349 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3937  luciferase-like  40 
 
 
349 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334928  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1533  flavin-dependent oxidoreductase  39.53 
 
 
349 aa  45.8  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4190  luciferase family protein  38.82 
 
 
353 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  28.67 
 
 
317 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  26.2 
 
 
335 aa  44.3  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2852  luciferase family protein  25.83 
 
 
314 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.709446  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  24.63 
 
 
327 aa  43.5  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4321  luciferase-like monooxygenase  37.65 
 
 
349 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1982  luciferase family oxidoreductase, group 1  33.06 
 
 
346 aa  43.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0356258  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3861  luciferase family protein  37.65 
 
 
349 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0394  putative luciferase-like monooxygenase  36.47 
 
 
333 aa  42  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.885628  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>