More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1982 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1982  luciferase family oxidoreductase, group 1  100 
 
 		 346 aa  674    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0356258  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1595  luciferase-like monooxygenase  51.74 
 
 		 385 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.823817  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0215  luciferase family protein  54.22 
 
 		 374 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3879  monooxygenase  52.57 
 
 		 373 aa  326  4.0000000000000003e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3793  Luciferase-like monooxygenase  47.84 
 
 		 379 aa  300  4e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.858529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2015  luciferase family protein  49.35 
 
 		 391 aa  281  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878231  normal  0.162196 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0688  luciferase-like protein  49.71 
 
 		 348 aa  281  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34640  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  44.33 
 
 		 436 aa  245  6.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3465  luciferase family protein  42.78 
 
 		 386 aa  232  6e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  40.17 
 
 		 339 aa  212  5.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7218  Luciferase-like monooxygenase  39.42 
 
 		 335 aa  203  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140559  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3458  hypothetical protein  38.26 
 
 		 339 aa  200  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.147347  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6282  luciferase family protein  39.18 
 
 		 335 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975045  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2838  luciferase family protein  38.44 
 
 		 338 aa  196  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0259325  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0690  luciferase-like  39.76 
 
 		 332 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1169  luciferase family protein  39.76 
 
 		 332 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1145  luciferase family protein  39.47 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1545  Luciferase-like monooxygenase  36.5 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1765  luciferase-like monooxygenase  39.41 
 
 		 397 aa  193  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0498  hypothetical protein  37.1 
 
 		 341 aa  192  7e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1795  luciferase family protein  37.54 
 
 		 336 aa  192  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2136  luciferase family protein  39.17 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4281  flavin-dependent oxidoreductase  38.87 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2368  Luciferase-like monooxygenase  36.89 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0105651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6468  luciferase family protein  37.65 
 
 		 356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0486136 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2932  putative flavin-dpendent alkanal monooxygenase, luciferase-like  36.2 
 
 		 331 aa  190  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2861  luciferase-like monooxygenase  39.02 
 
 		 424 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2799  luciferase-like monooxygenase  39.02 
 
 		 352 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2739  luciferase-like monooxygenase  39.41 
 
 		 336 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  37.1 
 
 		 340 aa  189  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0580  luciferase-like monooxygenase  38.73 
 
 		 352 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1747  luciferase-like monooxygenase  39.12 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2855  luciferase-like monooxygenase  38.73 
 
 		 352 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0815  hypothetical protein  36.69 
 
 		 335 aa  187  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3339  hypothetical protein  36.89 
 
 		 339 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4004  hypothetical protein  37.35 
 
 		 347 aa  183  5.0000000000000004e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2172  luciferase family protein  36.44 
 
 		 331 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115486  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0592  hypothetical protein  36.69 
 
 		 335 aa  182  6e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1048  luciferase family protein  37.98 
 
 		 332 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1051  luciferase-like monooxygenase  37.98 
 
 		 332 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0352  luciferase-like  37.79 
 
 		 355 aa  182  9.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3720  hypothetical protein  37.06 
 
 		 351 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3587  hypothetical protein  37.06 
 
 		 351 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3726  hypothetical protein  37.18 
 
 		 351 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000427742  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  37.28 
 
 		 343 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  36.89 
 
 		 357 aa  180  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3958  Luciferase-like monooxygenase  36.78 
 
 		 346 aa  179  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.321099 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  36.69 
 
 		 328 aa  179  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3316  luciferase-like  35.26 
 
 		 335 aa  179  7e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0292  Luciferase-like monooxygenase  49.52 
 
 		 448 aa  178  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.313138 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3670  luciferase family protein  37.14 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3262  Luciferase-like monooxygenase  38.71 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3503  luciferase-like  34.71 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  35.1 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0647  luciferase-like protein  36.02 
 
 		 331 aa  178  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1047  luciferase family protein  35.4 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.360006  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3964  Luciferase-like monooxygenase  37.14 
 
 		 343 aa  178  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0564  luciferase family protein  36.57 
 
 		 337 aa  177  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0103  luciferase family protein  35.24 
 
 		 334 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000816879 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  37.21 
 
 		 337 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0513  luciferase family protein  29.91 
 
 		 333 aa  176  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2544  luciferase family protein  37.69 
 
 		 326 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.154645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0103  luciferase family protein  34.96 
 
 		 334 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3171  luciferase family protein  37.43 
 
 		 326 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.977634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2289  luciferase family oxidoreductase, group 1  36.44 
 
 		 340 aa  176  8e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0714  luciferase family protein  35.31 
 
 		 335 aa  175  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2861  Luciferase-like monooxygenase  39.26 
 
 		 335 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0060  luciferase family protein  38.12 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00186  flavin-dependent oxidoreductase  36.61 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.395347  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0088  luciferase family protein  34.67 
 
 		 334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161707 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4330  luciferase family protein  39.07 
 
 		 329 aa  174  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0607996  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1357  luciferase family oxidoreductase, group 1  37.57 
 
 		 332 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1883  Luciferase-like monooxygenase  38.07 
 
 		 342 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.560845  normal  0.157479 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4479  hypothetical protein  34.42 
 
 		 335 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  35.69 
 
 		 338 aa  172  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0098  luciferase-like  34.81 
 
 		 333 aa  172  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0889  luciferase-like  37.06 
 
 		 328 aa  171  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.761673  normal  0.656027 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2678  luciferase family protein  37.01 
 
 		 326 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0310045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1766  luciferase-like  35.61 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0136597 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0927  luciferase-like  36.44 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.928282  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1776  luciferase family protein  34.4 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2449  luciferase family protein  36.36 
 
 		 336 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3456  hypothetical protein  33.73 
 
 		 335 aa  170  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0106  luciferase family protein  34.38 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045714 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0545  Luciferase-like monooxygenase  33.83 
 
 		 335 aa  169  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3642  hypothetical protein  33.83 
 
 		 335 aa  169  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0538  hypothetical protein  33.83 
 
 		 335 aa  169  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0742204 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3352  hypothetical protein  33.83 
 
 		 335 aa  169  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1983  luciferase family protein  32.05 
 
 		 338 aa  169  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437489  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2562  Luciferase-like monooxygenase  37.28 
 
 		 348 aa  169  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.261536  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03027  predicted enzyme  33.83 
 
 		 335 aa  169  7e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02978  hypothetical protein  33.83 
 
 		 335 aa  169  7e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2476  luciferase family oxidoreductase, group 1  34.27 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  36.15 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1027  Luciferase-like monooxygenase  36.18 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.789463  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3612  hypothetical protein  34.51 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2156  luciferase family protein  32.65 
 
 		 344 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3973  luciferase family protein  36.69 
 
 		 361 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5700  luciferase family protein  36.05 
 
 		 333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732464 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2679  putative luciferase-like monooxygenase  36.31 
 
 		 353 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172098  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>