More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2015 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2015  luciferase family protein  100 
 
 		 391 aa  756    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878231  normal  0.162196 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1595  luciferase-like monooxygenase  59.38 
 
 		 385 aa  395  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.823817  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3879  monooxygenase  60.16 
 
 		 373 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3793  Luciferase-like monooxygenase  48.84 
 
 		 379 aa  326  4.0000000000000003e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.858529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34640  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  49.49 
 
 		 436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0215  luciferase family protein  50.26 
 
 		 374 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1982  luciferase family oxidoreductase, group 1  49.35 
 
 		 346 aa  292  7e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0356258  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3465  luciferase family protein  46.39 
 
 		 386 aa  283  5.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0688  luciferase-like protein  50.41 
 
 		 348 aa  277  3e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  39.84 
 
 		 340 aa  223  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2172  luciferase family protein  36.98 
 
 		 331 aa  212  7e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115486  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  36.43 
 
 		 327 aa  212  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1765  luciferase-like monooxygenase  39.84 
 
 		 397 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0580  luciferase-like monooxygenase  39.84 
 
 		 352 aa  209  8e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1747  luciferase-like monooxygenase  39.84 
 
 		 336 aa  209  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1047  luciferase family protein  36.6 
 
 		 327 aa  209  8e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.360006  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2855  luciferase-like monooxygenase  39.84 
 
 		 352 aa  209  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2861  luciferase-like monooxygenase  39.84 
 
 		 424 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2739  luciferase-like monooxygenase  39.84 
 
 		 336 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2799  luciferase-like monooxygenase  39.84 
 
 		 352 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6282  luciferase family protein  37.5 
 
 		 335 aa  207  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975045  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  36.87 
 
 		 328 aa  206  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1048  luciferase family protein  39.22 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1051  luciferase-like monooxygenase  39.06 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4281  flavin-dependent oxidoreductase  38.44 
 
 		 332 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  38.2 
 
 		 357 aa  203  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2136  luciferase family protein  38.54 
 
 		 332 aa  202  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0690  luciferase-like  38.44 
 
 		 332 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1169  luciferase family protein  38.44 
 
 		 332 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1145  luciferase family protein  38.89 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2838  luciferase family protein  37.34 
 
 		 338 aa  202  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0259325  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0292  Luciferase-like monooxygenase  47.6 
 
 		 448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.313138 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1357  luciferase family oxidoreductase, group 1  38.42 
 
 		 332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0352  luciferase-like  38.44 
 
 		 355 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  37.24 
 
 		 338 aa  198  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3458  hypothetical protein  35.45 
 
 		 339 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.147347  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6468  luciferase family protein  38.64 
 
 		 356 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0486136 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7218  Luciferase-like monooxygenase  37.23 
 
 		 335 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140559  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3503  luciferase-like  37.08 
 
 		 328 aa  196  8.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  37.8 
 
 		 339 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  38.48 
 
 		 338 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1795  luciferase family protein  36.8 
 
 		 336 aa  193  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0103  luciferase family protein  36.68 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0564  luciferase family protein  37.73 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2289  luciferase family oxidoreductase, group 1  37.37 
 
 		 340 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3958  Luciferase-like monooxygenase  38.96 
 
 		 346 aa  190  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.321099 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0098  luciferase-like  35.31 
 
 		 333 aa  189  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2368  Luciferase-like monooxygenase  34.29 
 
 		 334 aa  189  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0105651 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  37.56 
 
 		 343 aa  190  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  37.27 
 
 		 337 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1545  Luciferase-like monooxygenase  34.79 
 
 		 331 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0088  luciferase family protein  36.68 
 
 		 334 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161707 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0160  Luciferase-like monooxygenase  37.47 
 
 		 327 aa  188  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0060  luciferase family protein  38.1 
 
 		 333 aa  188  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0647  luciferase-like protein  35.75 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2932  putative flavin-dpendent alkanal monooxygenase, luciferase-like  34.96 
 
 		 331 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2544  luciferase family protein  35.17 
 
 		 326 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.154645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0103  luciferase family protein  36.29 
 
 		 334 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000816879 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3171  luciferase family protein  35.17 
 
 		 326 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.977634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0106  luciferase family protein  36.29 
 
 		 334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045714 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0761  luciferase family oxidoreductase, group 1  38.52 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390481  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3964  Luciferase-like monooxygenase  37.24 
 
 		 343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2679  putative luciferase-like monooxygenase  38.62 
 
 		 353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1154  luciferase-like  35.96 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.111277  normal  0.95241 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32520  hypothetical protein  35.25 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.985458  normal  0.231393 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1438  Luciferase-like monooxygenase  34.21 
 
 		 331 aa  184  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0843804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3670  luciferase family protein  36.98 
 
 		 343 aa  184  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2755  hypothetical protein  34.99 
 
 		 333 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2678  luciferase family protein  34.55 
 
 		 326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0310045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3043  luciferase family protein  36.91 
 
 		 327 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4222  Luciferase-like monooxygenase  37.37 
 
 		 338 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504496  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0714  luciferase family protein  33.59 
 
 		 335 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1238  putative luciferase  35.45 
 
 		 339 aa  183  6e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.816802  normal  0.894284 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0498  hypothetical protein  32.72 
 
 		 341 aa  182  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3792  Luciferase-like monooxygenase  40.99 
 
 		 361 aa  182  8.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186196  hitchhiker  0.000277385 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02070  Luciferase-like flavin monooxygenase  36.65 
 
 		 331 aa  182  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3339  hypothetical protein  33.86 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4452  luciferase family protein  33.94 
 
 		 333 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3262  Luciferase-like monooxygenase  36.1 
 
 		 331 aa  179  5.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1074  luciferase family protein  34.81 
 
 		 345 aa  179  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2562  Luciferase-like monooxygenase  37.11 
 
 		 348 aa  179  7e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.261536  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1994  luciferase family oxidoreductase, group 1  35.45 
 
 		 341 aa  179  8e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0214  luciferase family protein  37.34 
 
 		 327 aa  179  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.527708 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1097  luciferase-like  35.4 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.286853  normal  0.650073 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2201  luciferase-like monooxygenase  35.75 
 
 		 338 aa  178  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123209 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0039  luciferase  33.07 
 
 		 333 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1563  putative oxidoreductase  37.08 
 
 		 335 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00186  flavin-dependent oxidoreductase  35.7 
 
 		 328 aa  177  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.395347  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1789  luciferase-like protein  33.76 
 
 		 333 aa  177  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0815  hypothetical protein  34.67 
 
 		 335 aa  177  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2449  luciferase family protein  35.45 
 
 		 336 aa  177  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0153  bacterial luciferase family protein  32.55 
 
 		 333 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3603  flavin dependant oxidoreductase  32.9 
 
 		 338 aa  176  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4004  hypothetical protein  35.71 
 
 		 347 aa  176  7e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0592  hypothetical protein  33.86 
 
 		 335 aa  176  9e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3720  hypothetical protein  35.45 
 
 		 351 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3587  hypothetical protein  35.45 
 
 		 351 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5700  luciferase family protein  34.7 
 
 		 333 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732464 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3463  hypothetical protein  32.53 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3465  hypothetical protein  32.53 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>