More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3465 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3465  luciferase family protein  100 
 
 		 386 aa  753    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1595  luciferase-like monooxygenase  50.13 
 
 		 385 aa  317  3e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.823817  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3793  Luciferase-like monooxygenase  46.7 
 
 		 379 aa  304  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.858529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3879  monooxygenase  50.14 
 
 		 373 aa  293  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2015  luciferase family protein  46.39 
 
 		 391 aa  273  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878231  normal  0.162196 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0215  luciferase family protein  42.29 
 
 		 374 aa  241  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1982  luciferase family oxidoreductase, group 1  42.93 
 
 		 346 aa  236  6e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0356258  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34640  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  40.67 
 
 		 436 aa  225  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0352  luciferase-like  40.32 
 
 		 355 aa  218  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0688  luciferase-like protein  41.44 
 
 		 348 aa  216  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6468  luciferase family protein  37.43 
 
 		 356 aa  212  7.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0486136 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3726  hypothetical protein  37.53 
 
 		 351 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000427742  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  38.32 
 
 		 340 aa  209  9e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  38.86 
 
 		 339 aa  203  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  34.7 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  35.16 
 
 		 328 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3262  Luciferase-like monooxygenase  35.6 
 
 		 331 aa  199  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1047  luciferase family protein  34.43 
 
 		 327 aa  197  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.360006  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0103  luciferase family protein  35.23 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2172  luciferase family protein  34.44 
 
 		 331 aa  193  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115486  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  36.16 
 
 		 357 aa  192  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0088  luciferase family protein  34.96 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161707 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0103  luciferase family protein  34.69 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000816879 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32520  hypothetical protein  36.34 
 
 		 333 aa  190  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.985458  normal  0.231393 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3316  luciferase-like  34.53 
 
 		 335 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0039  luciferase  35.15 
 
 		 333 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2755  hypothetical protein  36.07 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0098  luciferase-like  34.85 
 
 		 333 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0106  luciferase family protein  34.42 
 
 		 334 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045714 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6282  luciferase family protein  36.19 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975045  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0564  luciferase family protein  34.15 
 
 		 337 aa  184  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2368  Luciferase-like monooxygenase  31.52 
 
 		 334 aa  184  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0105651 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2838  luciferase family protein  34.34 
 
 		 338 aa  183  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0259325  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0153  bacterial luciferase family protein  34.6 
 
 		 333 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  33.42 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1074  luciferase family protein  32.7 
 
 		 345 aa  179  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1765  luciferase-like monooxygenase  36.07 
 
 		 397 aa  179  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  34.51 
 
 		 343 aa  179  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3458  hypothetical protein  32.88 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.147347  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1438  Luciferase-like monooxygenase  32.88 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0843804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3339  hypothetical protein  32.33 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2861  luciferase-like monooxygenase  36.24 
 
 		 424 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0580  luciferase-like monooxygenase  35.97 
 
 		 352 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0647  luciferase-like protein  33.96 
 
 		 331 aa  176  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2855  luciferase-like monooxygenase  35.97 
 
 		 352 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02070  Luciferase-like flavin monooxygenase  35.42 
 
 		 331 aa  176  6e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1766  luciferase-like  34.13 
 
 		 338 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0136597 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1747  luciferase-like monooxygenase  35.97 
 
 		 336 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2201  luciferase-like monooxygenase  34.25 
 
 		 338 aa  176  6e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123209 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2678  luciferase family protein  33.61 
 
 		 326 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0310045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00186  flavin-dependent oxidoreductase  34.34 
 
 		 328 aa  176  7e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.395347  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2739  luciferase-like monooxygenase  35.97 
 
 		 336 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2799  luciferase-like monooxygenase  35.97 
 
 		 352 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4452  luciferase family protein  32.97 
 
 		 333 aa  176  8e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7218  Luciferase-like monooxygenase  35.07 
 
 		 335 aa  176  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140559  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3958  Luciferase-like monooxygenase  35.39 
 
 		 346 aa  176  9e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.321099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  31.71 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3964  Luciferase-like monooxygenase  35.44 
 
 		 343 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1789  luciferase-like protein  32.69 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2679  putative luciferase-like monooxygenase  34.06 
 
 		 353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0761  luciferase family oxidoreductase, group 1  34.97 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390481  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3670  luciferase family protein  35.16 
 
 		 343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  34.22 
 
 		 338 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2544  luciferase family protein  33.33 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.154645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1097  luciferase-like  33.88 
 
 		 334 aa  171  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.286853  normal  0.650073 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5700  luciferase family protein  34.15 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732464 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1238  putative luciferase  30.25 
 
 		 339 aa  170  4e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.816802  normal  0.894284 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0592  hypothetical protein  32.7 
 
 		 335 aa  170  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0643  Luciferase-like monooxygenase  34.25 
 
 		 343 aa  170  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207067  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3792  Luciferase-like monooxygenase  36.32 
 
 		 361 aa  170  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186196  hitchhiker  0.000277385 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2289  luciferase family oxidoreductase, group 1  33.7 
 
 		 340 aa  170  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3720  hypothetical protein  32.6 
 
 		 351 aa  169  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3587  hypothetical protein  32.6 
 
 		 351 aa  169  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4004  hypothetical protein  32.6 
 
 		 347 aa  169  9e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3171  luciferase family protein  33.61 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.977634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3503  luciferase-like  32.52 
 
 		 328 aa  169  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3336  Luciferase-like monooxygenase  33.69 
 
 		 352 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0310508  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1357  luciferase family oxidoreductase, group 1  34.81 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3631  hypothetical protein  31.4 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2136  luciferase family protein  34.7 
 
 		 332 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3465  hypothetical protein  31.4 
 
 		 335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4479  hypothetical protein  31.4 
 
 		 335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4929  Luciferase-like monooxygenase  32.36 
 
 		 341 aa  166  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.164106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3463  hypothetical protein  31.4 
 
 		 335 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0815  hypothetical protein  32.69 
 
 		 335 aa  167  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0664  luciferase family protein  33.7 
 
 		 343 aa  167  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.860501 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1051  luciferase-like monooxygenase  34.24 
 
 		 332 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1154  luciferase-like  30.27 
 
 		 339 aa  166  5e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.111277  normal  0.95241 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1048  luciferase family protein  34.24 
 
 		 332 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3571  hypothetical protein  31.4 
 
 		 335 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3534  hypothetical protein  31.4 
 
 		 335 aa  166  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0498  hypothetical protein  31.15 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1515  luciferase family protein  35.85 
 
 		 346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.192461 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4281  flavin-dependent oxidoreductase  34.6 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1795  luciferase family protein  32.88 
 
 		 336 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0690  luciferase-like  34.33 
 
 		 332 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1169  luciferase family protein  34.33 
 
 		 332 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3215  Luciferase-like monooxygenase  32.42 
 
 		 333 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.607873 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3456  hypothetical protein  30.6 
 
 		 335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3612  hypothetical protein  30.96 
 
 		 335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>