More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3793 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3793  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
379 aa  763    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.858529  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3879  monooxygenase  64.1 
 
 
373 aa  432  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1595  luciferase-like monooxygenase  59.15 
 
 
385 aa  423  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.823817  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0215  luciferase family protein  52.55 
 
 
374 aa  362  6e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2015  luciferase family protein  48.84 
 
 
391 aa  328  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878231  normal  0.162196 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3465  luciferase family protein  46.7 
 
 
386 aa  312  6.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469803  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34640  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  46.67 
 
 
436 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1982  luciferase family oxidoreductase, group 1  47.84 
 
 
346 aa  309  4e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0356258  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0688  luciferase-like protein  49.15 
 
 
348 aa  299  6e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6468  luciferase family protein  37.47 
 
 
356 aa  215  9e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0486136 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  34.58 
 
 
340 aa  209  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0292  Luciferase-like monooxygenase  46.18 
 
 
448 aa  209  6e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.313138 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0098  luciferase-like  34.22 
 
 
333 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0103  luciferase family protein  34.85 
 
 
334 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000816879 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  35.48 
 
 
339 aa  207  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  36.04 
 
 
338 aa  205  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  36.04 
 
 
357 aa  205  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0564  luciferase family protein  37.9 
 
 
337 aa  205  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2838  luciferase family protein  36.86 
 
 
338 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0259325  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2861  luciferase-like monooxygenase  37.7 
 
 
424 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2799  luciferase-like monooxygenase  37.7 
 
 
352 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0580  luciferase-like monooxygenase  37.7 
 
 
352 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1765  luciferase-like monooxygenase  37.17 
 
 
397 aa  204  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0103  luciferase family protein  34.66 
 
 
334 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2855  luciferase-like monooxygenase  37.7 
 
 
352 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0088  luciferase family protein  34.58 
 
 
334 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161707 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2136  luciferase family protein  37.84 
 
 
332 aa  203  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2739  luciferase-like monooxygenase  37.84 
 
 
336 aa  203  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  34.51 
 
 
328 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  35.22 
 
 
327 aa  202  8e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3726  hypothetical protein  36.39 
 
 
351 aa  202  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000427742  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1747  luciferase-like monooxygenase  37.84 
 
 
336 aa  202  8e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0106  luciferase family protein  34.32 
 
 
334 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045714 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2172  luciferase family protein  34.96 
 
 
331 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115486  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1145  luciferase family protein  37.57 
 
 
332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0690  luciferase-like  37.57 
 
 
332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1169  luciferase family protein  37.57 
 
 
332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0647  luciferase-like protein  34.13 
 
 
331 aa  200  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4281  flavin-dependent oxidoreductase  37.3 
 
 
332 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1051  luciferase-like monooxygenase  37.67 
 
 
332 aa  199  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0352  luciferase-like  34.69 
 
 
355 aa  199  7.999999999999999e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0153  bacterial luciferase family protein  32.98 
 
 
333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7218  Luciferase-like monooxygenase  35.87 
 
 
335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140559  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1048  luciferase family protein  37.4 
 
 
332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1047  luciferase family protein  34.95 
 
 
327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.360006  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6282  luciferase family protein  35.23 
 
 
335 aa  197  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975045  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2368  Luciferase-like monooxygenase  34.42 
 
 
334 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0105651 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  35.6 
 
 
337 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3964  Luciferase-like monooxygenase  37.03 
 
 
343 aa  195  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1789  luciferase-like protein  34.51 
 
 
333 aa  195  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3670  luciferase family protein  36.76 
 
 
343 aa  194  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3958  Luciferase-like monooxygenase  36.1 
 
 
346 aa  194  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.321099 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0039  luciferase  32.17 
 
 
333 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3603  flavin dependant oxidoreductase  35.29 
 
 
338 aa  192  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3458  hypothetical protein  34.14 
 
 
339 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.147347  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3262  Luciferase-like monooxygenase  35.31 
 
 
331 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3339  hypothetical protein  33.87 
 
 
339 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3316  luciferase-like  33.07 
 
 
335 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02070  Luciferase-like flavin monooxygenase  34.95 
 
 
331 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00186  flavin-dependent oxidoreductase  34.79 
 
 
328 aa  189  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.395347  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1795  luciferase family protein  35.56 
 
 
336 aa  189  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2562  Luciferase-like monooxygenase  35.71 
 
 
348 aa  189  8e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.261536  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2679  putative luciferase-like monooxygenase  33.96 
 
 
353 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172098  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4452  luciferase family protein  32.44 
 
 
333 aa  188  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  34.15 
 
 
343 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0761  luciferase family oxidoreductase, group 1  35.68 
 
 
337 aa  188  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390481  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32520  hypothetical protein  33.87 
 
 
333 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.985458  normal  0.231393 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2755  hypothetical protein  33.6 
 
 
333 aa  185  9e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1438  Luciferase-like monooxygenase  33.69 
 
 
331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0843804  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1074  luciferase family protein  33.6 
 
 
345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0714  luciferase family protein  35.9 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1357  luciferase family oxidoreductase, group 1  35.04 
 
 
332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3510  Luciferase-like monooxygenase  34.59 
 
 
333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2449  luciferase family protein  35.42 
 
 
336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1545  Luciferase-like monooxygenase  34.04 
 
 
331 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3215  Luciferase-like monooxygenase  34.32 
 
 
333 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.607873 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2993  luciferase family protein  30.11 
 
 
347 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.11529  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2640  luciferase family protein  32.7 
 
 
343 aa  182  9.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1436  luciferase-like protein  35.17 
 
 
357 aa  182  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3503  luciferase-like  34.14 
 
 
328 aa  182  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3090  luciferase family protein  29.95 
 
 
349 aa  181  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00266467  normal  0.324739 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3631  hypothetical protein  33.97 
 
 
335 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3465  hypothetical protein  33.97 
 
 
335 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2544  luciferase family protein  33.51 
 
 
326 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.154645  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3463  hypothetical protein  33.97 
 
 
335 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2932  putative flavin-dpendent alkanal monooxygenase, luciferase-like  33.78 
 
 
331 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3571  hypothetical protein  33.97 
 
 
335 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4004  hypothetical protein  34.96 
 
 
347 aa  180  4e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0498  hypothetical protein  33.6 
 
 
341 aa  180  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3792  Luciferase-like monooxygenase  34.11 
 
 
361 aa  179  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186196  hitchhiker  0.000277385 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3720  hypothetical protein  34.69 
 
 
351 aa  179  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3587  hypothetical protein  34.69 
 
 
351 aa  179  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3171  luciferase family protein  32.98 
 
 
326 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.977634  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1776  luciferase family protein  31.45 
 
 
333 aa  179  9e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3534  hypothetical protein  33.42 
 
 
335 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2678  luciferase family protein  32.98 
 
 
326 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0310045  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3480  luciferase family protein  35.54 
 
 
346 aa  176  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  0.078624 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1101  luciferase family protein  30.21 
 
 
335 aa  176  7e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.624073  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2911  luciferase family protein  29.76 
 
 
348 aa  175  9e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.425969 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0060  luciferase family protein  35.31 
 
 
333 aa  175  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>