More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0688 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0688  luciferase-like protein  100 
 
 		 348 aa  687    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3879  monooxygenase  58.45 
 
 		 373 aa  362  4e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0215  luciferase family protein  56.73 
 
 		 374 aa  362  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1595  luciferase-like monooxygenase  57.88 
 
 		 385 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.823817  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3793  Luciferase-like monooxygenase  49.15 
 
 		 379 aa  303  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.858529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1982  luciferase family oxidoreductase, group 1  49.71 
 
 		 346 aa  299  4e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0356258  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2015  luciferase family protein  50.41 
 
 		 391 aa  280  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878231  normal  0.162196 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3465  luciferase family protein  41.44 
 
 		 386 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34640  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  39.68 
 
 		 436 aa  212  9e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0647  luciferase-like protein  34.39 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0292  Luciferase-like monooxygenase  44.32 
 
 		 448 aa  185  9e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.313138 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2838  luciferase family protein  36.13 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0259325  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  34.19 
 
 		 338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  37.57 
 
 		 340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2911  luciferase family protein  31.99 
 
 		 348 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.425969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  34.19 
 
 		 328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1173  luciferase family protein  31.91 
 
 		 335 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0583995  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1101  luciferase family protein  31.62 
 
 		 335 aa  178  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.624073  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2368  Luciferase-like monooxygenase  34.56 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0105651 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3090  luciferase family protein  31.82 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00266467  normal  0.324739 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1115  luciferase family protein  31.99 
 
 		 335 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1206  luciferase family protein  31.34 
 
 		 335 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3184  Luciferase-like monooxygenase  31.62 
 
 		 335 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0529886 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2993  luciferase family protein  31.43 
 
 		 347 aa  175  9e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.11529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0513  luciferase family protein  29.91 
 
 		 333 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  34.19 
 
 		 339 aa  172  5.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2172  luciferase family protein  33.05 
 
 		 331 aa  172  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115486  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1994  luciferase family oxidoreductase, group 1  35.06 
 
 		 341 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1357  luciferase family oxidoreductase, group 1  34.47 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6468  luciferase family protein  36.89 
 
 		 356 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0486136 
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  33.52 
 
 		 327 aa  170  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0103  luciferase family protein  34.18 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0103  luciferase family protein  34.46 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000816879 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0088  luciferase family protein  34.18 
 
 		 334 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161707 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3316  luciferase-like  33.43 
 
 		 335 aa  169  7e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3458  hypothetical protein  34.67 
 
 		 339 aa  169  8e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.147347  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6282  luciferase family protein  34.19 
 
 		 335 aa  168  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975045  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0564  luciferase family protein  36.49 
 
 		 337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1047  luciferase family protein  33.24 
 
 		 327 aa  166  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.360006  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3339  hypothetical protein  32.39 
 
 		 339 aa  166  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3958  Luciferase-like monooxygenase  35.21 
 
 		 346 aa  166  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.321099 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7218  Luciferase-like monooxygenase  33.71 
 
 		 335 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140559  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3510  Luciferase-like monooxygenase  33.71 
 
 		 333 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2562  Luciferase-like monooxygenase  34.56 
 
 		 348 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.261536  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2739  luciferase-like monooxygenase  35.49 
 
 		 336 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2861  luciferase-like monooxygenase  35.49 
 
 		 424 aa  165  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0106  luciferase family protein  34.48 
 
 		 334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045714 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1789  luciferase-like protein  32.57 
 
 		 333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0690  luciferase-like  35.55 
 
 		 332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1145  luciferase family protein  35.55 
 
 		 332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1169  luciferase family protein  35.55 
 
 		 332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2799  luciferase-like monooxygenase  35.49 
 
 		 352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0153  bacterial luciferase family protein  33.81 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0098  luciferase-like  34.47 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1765  luciferase-like monooxygenase  34.65 
 
 		 397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0580  luciferase-like monooxygenase  35.21 
 
 		 352 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1747  luciferase-like monooxygenase  35.21 
 
 		 336 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0352  luciferase-like  35.63 
 
 		 355 aa  164  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  33.15 
 
 		 357 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3598  luciferase family protein  31.52 
 
 		 336 aa  163  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000425972  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2855  luciferase-like monooxygenase  35.21 
 
 		 352 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1048  luciferase family protein  35.55 
 
 		 332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2640  luciferase family protein  33.82 
 
 		 343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4281  flavin-dependent oxidoreductase  34.97 
 
 		 332 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1447  luciferase family protein  35.1 
 
 		 336 aa  162  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.765591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3670  luciferase family protein  34.75 
 
 		 343 aa  162  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0643  Luciferase-like monooxygenase  34.77 
 
 		 343 aa  162  7e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207067  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1545  Luciferase-like monooxygenase  33.24 
 
 		 331 aa  162  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2136  luciferase family protein  35.26 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1051  luciferase-like monooxygenase  35.26 
 
 		 332 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3603  flavin dependant oxidoreductase  34.91 
 
 		 338 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10108  lkanal monooxygenase-like protein YvbT  31.53 
 
 		 342 aa  160  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.842065  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3964  Luciferase-like monooxygenase  34.46 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0039  luciferase  32.76 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3726  hypothetical protein  34.92 
 
 		 351 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000427742  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2514  luciferase family protein  32.01 
 
 		 353 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5700  luciferase family protein  34.69 
 
 		 333 aa  160  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732464 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3215  Luciferase-like monooxygenase  34.37 
 
 		 333 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.607873 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2544  luciferase family protein  34.29 
 
 		 326 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.154645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0761  luciferase family oxidoreductase, group 1  37.54 
 
 		 337 aa  159  9e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390481  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0664  luciferase family protein  34.48 
 
 		 343 aa  159  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.860501 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2932  putative flavin-dpendent alkanal monooxygenase, luciferase-like  32.66 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3171  luciferase family protein  33.14 
 
 		 326 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.977634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3262  Luciferase-like monooxygenase  33.24 
 
 		 331 aa  156  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02130  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.47 
 
 		 329 aa  156  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0356  luciferase family protein  33.14 
 
 		 339 aa  155  9e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0815  hypothetical protein  33.24 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4004  hypothetical protein  31.9 
 
 		 347 aa  155  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3681  Luciferase-like monooxygenase  32.37 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3720  hypothetical protein  31.61 
 
 		 351 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3043  luciferase family protein  34.19 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3587  hypothetical protein  31.61 
 
 		 351 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1795  luciferase family protein  33.04 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2449  luciferase family protein  33.91 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4452  luciferase family protein  32.17 
 
 		 333 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2678  luciferase family protein  33.14 
 
 		 326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0310045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32520  hypothetical protein  32.75 
 
 		 333 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.985458  normal  0.231393 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1097  luciferase-like  33.72 
 
 		 334 aa  153  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.286853  normal  0.650073 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0714  luciferase family protein  30.48 
 
 		 335 aa  153  5e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2755  hypothetical protein  32.46 
 
 		 333 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>