More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_34640 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_34640  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 		 436 aa  841    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1595  luciferase-like monooxygenase  50.79 
 
 		 385 aa  326  6e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.823817  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2015  luciferase family protein  50 
 
 		 391 aa  304  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878231  normal  0.162196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3793  Luciferase-like monooxygenase  46.67 
 
 		 379 aa  303  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.858529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3879  monooxygenase  49.47 
 
 		 373 aa  293  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0215  luciferase family protein  44.04 
 
 		 374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1982  luciferase family oxidoreductase, group 1  44.33 
 
 		 346 aa  245  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0356258  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3465  luciferase family protein  40.93 
 
 		 386 aa  230  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0688  luciferase-like protein  41.78 
 
 		 348 aa  208  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6468  luciferase family protein  36.88 
 
 		 356 aa  193  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0486136 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0292  Luciferase-like monooxygenase  48.08 
 
 		 448 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.313138 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  36.39 
 
 		 340 aa  190  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0580  luciferase-like monooxygenase  37.63 
 
 		 352 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7218  Luciferase-like monooxygenase  36.79 
 
 		 335 aa  184  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140559  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 		 328 aa  184  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2855  luciferase-like monooxygenase  37.63 
 
 		 352 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1747  luciferase-like monooxygenase  37.63 
 
 		 336 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2861  luciferase-like monooxygenase  37.63 
 
 		 424 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2799  luciferase-like monooxygenase  37.63 
 
 		 352 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2739  luciferase-like monooxygenase  37.63 
 
 		 336 aa  183  7e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1765  luciferase-like monooxygenase  36.84 
 
 		 397 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0103  luciferase family protein  33.59 
 
 		 334 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000816879 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0103  luciferase family protein  33.33 
 
 		 334 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0088  luciferase family protein  33.59 
 
 		 334 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161707 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2172  luciferase family protein  33.68 
 
 		 331 aa  179  8e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115486  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0647  luciferase-like protein  33.51 
 
 		 331 aa  179  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  33.07 
 
 		 327 aa  177  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2993  luciferase family protein  32.11 
 
 		 347 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.11529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2911  luciferase family protein  32.21 
 
 		 348 aa  177  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.425969 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2562  Luciferase-like monooxygenase  36.1 
 
 		 348 aa  176  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.261536  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0352  luciferase-like  36.2 
 
 		 355 aa  176  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1047  luciferase family protein  33.07 
 
 		 327 aa  176  8e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.360006  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3090  luciferase family protein  32.21 
 
 		 349 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00266467  normal  0.324739 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2368  Luciferase-like monooxygenase  32.81 
 
 		 334 aa  176  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0105651 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6282  luciferase family protein  35.71 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975045  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1051  luciferase-like monooxygenase  35.88 
 
 		 332 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3726  hypothetical protein  36.08 
 
 		 351 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000427742  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02070  Luciferase-like flavin monooxygenase  34.84 
 
 		 331 aa  174  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1048  luciferase family protein  35.62 
 
 		 332 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3964  Luciferase-like monooxygenase  36.48 
 
 		 343 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0098  luciferase-like  32.82 
 
 		 333 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0564  luciferase family protein  34.21 
 
 		 337 aa  172  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0106  luciferase family protein  33.86 
 
 		 334 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045714 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3670  luciferase family protein  36.22 
 
 		 343 aa  172  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1173  luciferase family protein  31.05 
 
 		 335 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0583995  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2861  Luciferase-like monooxygenase  37.3 
 
 		 335 aa  170  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32520  hypothetical protein  32.02 
 
 		 333 aa  170  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.985458  normal  0.231393 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2755  hypothetical protein  31.76 
 
 		 333 aa  169  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4281  flavin-dependent oxidoreductase  34.66 
 
 		 332 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3316  luciferase-like  31.84 
 
 		 335 aa  168  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1789  luciferase-like protein  34.13 
 
 		 333 aa  169  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1145  luciferase family protein  34.92 
 
 		 332 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0690  luciferase-like  34.92 
 
 		 332 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2136  luciferase family protein  35.19 
 
 		 332 aa  169  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  33.85 
 
 		 339 aa  169  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1169  luciferase family protein  34.92 
 
 		 332 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3958  Luciferase-like monooxygenase  36.22 
 
 		 346 aa  168  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.321099 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5700  luciferase family protein  34.03 
 
 		 333 aa  168  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3792  Luciferase-like monooxygenase  35.66 
 
 		 361 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186196  hitchhiker  0.000277385 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2640  luciferase family protein  30.15 
 
 		 343 aa  167  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3587  hypothetical protein  32.54 
 
 		 351 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3720  hypothetical protein  32.54 
 
 		 351 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1776  luciferase family protein  31.32 
 
 		 333 aa  166  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3458  hypothetical protein  30.87 
 
 		 339 aa  166  8e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.147347  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0153  bacterial luciferase family protein  31.94 
 
 		 333 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1238  putative luciferase  31.75 
 
 		 339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.816802  normal  0.894284 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4004  hypothetical protein  32.54 
 
 		 347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1357  luciferase family oxidoreductase, group 1  32.98 
 
 		 332 aa  164  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1438  Luciferase-like monooxygenase  32.02 
 
 		 331 aa  164  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0843804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3215  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 		 333 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.607873 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1154  luciferase-like  31.58 
 
 		 339 aa  163  7e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.111277  normal  0.95241 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1795  luciferase family protein  32.19 
 
 		 336 aa  163  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0039  luciferase  31.94 
 
 		 333 aa  162  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3631  hypothetical protein  32.72 
 
 		 335 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3465  hypothetical protein  32.28 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1097  luciferase-like  33.42 
 
 		 334 aa  160  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.286853  normal  0.650073 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0664  luciferase family protein  33.16 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.860501 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0714  luciferase family protein  32.55 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2514  luciferase family protein  32.98 
 
 		 353 aa  160  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3534  hypothetical protein  32.98 
 
 		 335 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3463  hypothetical protein  32.28 
 
 		 335 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3510  Luciferase-like monooxygenase  32.54 
 
 		 333 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3171  luciferase family protein  31.75 
 
 		 326 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.977634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4452  luciferase family protein  32.29 
 
 		 333 aa  159  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3571  hypothetical protein  32.01 
 
 		 335 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0545  Luciferase-like monooxygenase  30.95 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3642  hypothetical protein  30.95 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3352  hypothetical protein  30.95 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0538  hypothetical protein  30.95 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0742204 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3456  hypothetical protein  31.66 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03890  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.5 
 
 		 343 aa  158  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.04221 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4479  hypothetical protein  31.22 
 
 		 335 aa  158  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2544  luciferase family protein  31.22 
 
 		 326 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.154645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1447  luciferase family protein  33.85 
 
 		 336 aa  158  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.765591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0643  Luciferase-like monooxygenase  32.63 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207067  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03027  predicted enzyme  30.95 
 
 		 335 aa  157  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2678  luciferase family protein  30.95 
 
 		 326 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0310045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02978  hypothetical protein  30.95 
 
 		 335 aa  157  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3597  hypothetical protein  32.45 
 
 		 335 aa  157  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0164889 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3612  hypothetical protein  30.69 
 
 		 335 aa  156  6e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>