50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0952 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0952  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  561  1.0000000000000001e-159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3932  hypothetical protein  50.7 
 
 		 286 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3854  hypothetical protein  49.48 
 
 		 286 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357835  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0151  hypothetical protein  50.52 
 
 		 283 aa  242  5e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2688  hypothetical protein  47.4 
 
 		 286 aa  236  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.566827  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6698  hypothetical protein  46.58 
 
 		 291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.490421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1068  hypothetical protein  48.69 
 
 		 276 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1084  hypothetical protein  48.69 
 
 		 276 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0372016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1095  hypothetical protein  48.31 
 
 		 276 aa  232  6e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1368  hypothetical protein  49.05 
 
 		 281 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233326  normal  0.203451 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1367  hypothetical protein  46.39 
 
 		 285 aa  229  5e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134083 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1083  hypothetical protein  45.49 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.377526  normal  0.11045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1094  hypothetical protein  45.49 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1067  hypothetical protein  45.49 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5005  hypothetical protein  46.32 
 
 		 294 aa  226  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5006  hypothetical protein  45.42 
 
 		 287 aa  225  6e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38250  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  44.72 
 
 		 280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0252  hypothetical protein  48.09 
 
 		 290 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6257  hypothetical protein  48.24 
 
 		 285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.949372  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13500  hypothetical protein  46.36 
 
 		 285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000277953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4343  hypothetical protein  43.84 
 
 		 288 aa  219  5e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5643  hypothetical protein  46.69 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3207  putative F420-dependent oxidoreductase  47 
 
 		 272 aa  214  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1512  hypothetical protein  47.76 
 
 		 279 aa  205  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00633715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1545  hypothetical protein  45.95 
 
 		 301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000935429  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3680  putative F420-dependent oxidoreductase  46.03 
 
 		 281 aa  196  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2620  hypothetical protein  44.37 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7266  hypothetical protein  40.8 
 
 		 334 aa  196  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0059  hypothetical protein  42.33 
 
 		 303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1071  hypothetical protein  42.66 
 
 		 304 aa  192  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2385  putative F420-dependent oxidoreductase  44.87 
 
 		 288 aa  188  8e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4349  hypothetical protein  38.01 
 
 		 324 aa  176  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3965  hypothetical protein  38.36 
 
 		 324 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0497  hypothetical protein  40.61 
 
 		 303 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0508  hypothetical protein  40.61 
 
 		 303 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0486  hypothetical protein  40.61 
 
 		 303 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5428  hypothetical protein  39.62 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3644  hypothetical protein  37.37 
 
 		 307 aa  153  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5686  hypothetical protein  41.2 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4154  hypothetical protein  37.21 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.238248  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  25.91 
 
 		 327 aa  52.4  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  26.94 
 
 		 344 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  25.75 
 
 		 318 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  24.24 
 
 		 318 aa  49.7  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  25.72 
 
 		 322 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  27 
 
 		 346 aa  47  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  24.71 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  19.59 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  28.12 
 
 		 335 aa  43.9  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1261  luciferase family protein  27.54 
 
 		 300 aa  42.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.0146024 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>