78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3207 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3207  putative F420-dependent oxidoreductase  100 
 
 		 272 aa  534  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38250  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  61.48 
 
 		 280 aa  332  3e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1512  hypothetical protein  56.62 
 
 		 279 aa  292  3e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00633715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5006  hypothetical protein  57.09 
 
 		 287 aa  287  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1067  hypothetical protein  54.78 
 
 		 283 aa  285  4e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1083  hypothetical protein  54.78 
 
 		 283 aa  285  4e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.377526  normal  0.11045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1094  hypothetical protein  54.78 
 
 		 283 aa  285  4e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1367  hypothetical protein  57.48 
 
 		 285 aa  285  5e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1068  hypothetical protein  59.22 
 
 		 276 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1084  hypothetical protein  59.22 
 
 		 276 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0372016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1095  hypothetical protein  58.82 
 
 		 276 aa  279  3e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13500  hypothetical protein  55.04 
 
 		 285 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000277953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1368  hypothetical protein  57.65 
 
 		 281 aa  268  5e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233326  normal  0.203451 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5005  hypothetical protein  54.48 
 
 		 294 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3680  putative F420-dependent oxidoreductase  52.77 
 
 		 281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2385  putative F420-dependent oxidoreductase  54.41 
 
 		 288 aa  249  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6698  hypothetical protein  51.29 
 
 		 291 aa  247  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.490421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0252  hypothetical protein  50.79 
 
 		 290 aa  227  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4343  hypothetical protein  46.86 
 
 		 288 aa  223  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0151  hypothetical protein  48.07 
 
 		 283 aa  223  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0952  hypothetical protein  47 
 
 		 285 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3854  hypothetical protein  46.3 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357835  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3932  hypothetical protein  47.41 
 
 		 286 aa  206  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2688  hypothetical protein  43.33 
 
 		 286 aa  199  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.566827  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5643  hypothetical protein  44.36 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1545  hypothetical protein  46.07 
 
 		 301 aa  189  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000935429  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7266  hypothetical protein  41.94 
 
 		 334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2620  hypothetical protein  44.68 
 
 		 296 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6257  hypothetical protein  42.59 
 
 		 285 aa  172  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.949372  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4349  hypothetical protein  40.79 
 
 		 324 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1071  hypothetical protein  41.53 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0059  hypothetical protein  39.64 
 
 		 303 aa  159  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0486  hypothetical protein  38.33 
 
 		 303 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0508  hypothetical protein  38.33 
 
 		 303 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0497  hypothetical protein  38.33 
 
 		 303 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3965  hypothetical protein  40.43 
 
 		 324 aa  155  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3644  hypothetical protein  40.78 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5428  hypothetical protein  38.64 
 
 		 275 aa  152  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5686  hypothetical protein  38.91 
 
 		 271 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4154  hypothetical protein  39.93 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.238248  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  29.76 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  28.16 
 
 		 318 aa  67  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  28.47 
 
 		 346 aa  67  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.92 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  29.46 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  28.52 
 
 		 327 aa  62.4  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  28.12 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.12 
 
 		 332 aa  57  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  26.53 
 
 		 359 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  27.65 
 
 		 326 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.5 
 
 		 333 aa  52.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  26.94 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4112  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.37 
 
 		 344 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.273719  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  27.84 
 
 		 318 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  25.87 
 
 		 344 aa  49.3  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.47 
 
 		 336 aa  48.9  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  26.17 
 
 		 341 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  27.78 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00690  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.19 
 
 		 331 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.889784  normal  0.0731127 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.2 
 
 		 318 aa  47.4  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  25.59 
 
 		 360 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  27.76 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  27.27 
 
 		 321 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  22.3 
 
 		 334 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.36 
 
 		 339 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  30.46 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2778  Luciferase-like monooxygenase  38.46 
 
 		 317 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2862  Luciferase-like monooxygenase  27.05 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.628513 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2003  Luciferase-like, subgroup  29.88 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.749975 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.91 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2493  luciferase family protein  38.98 
 
 		 372 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  26.62 
 
 		 309 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4047  luciferase family protein  30.77 
 
 		 347 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  0.465581 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3804  luciferase family protein  32.05 
 
 		 318 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0754765 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3743  luciferase family protein  32.05 
 
 		 318 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  27.85 
 
 		 344 aa  42.7  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3731  luciferase-like protein  32.05 
 
 		 318 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  26.7 
 
 		 349 aa  42  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>