82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0252 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0252  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  572  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4343  hypothetical protein  59.33 
 
 		 288 aa  317  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6698  hypothetical protein  57.3 
 
 		 291 aa  308  8e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.490421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5006  hypothetical protein  52 
 
 		 287 aa  261  8e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3932  hypothetical protein  54.81 
 
 		 286 aa  261  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13500  hypothetical protein  51.76 
 
 		 285 aa  260  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000277953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1367  hypothetical protein  53.08 
 
 		 285 aa  257  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134083 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1095  hypothetical protein  53.44 
 
 		 276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1084  hypothetical protein  53.44 
 
 		 276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0372016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1068  hypothetical protein  53.44 
 
 		 276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38250  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  51.46 
 
 		 280 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1368  hypothetical protein  51.92 
 
 		 281 aa  251  7e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233326  normal  0.203451 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0151  hypothetical protein  51.13 
 
 		 283 aa  249  4e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1067  hypothetical protein  49.23 
 
 		 283 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1083  hypothetical protein  49.23 
 
 		 283 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.377526  normal  0.11045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1094  hypothetical protein  49.23 
 
 		 283 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5005  hypothetical protein  50 
 
 		 294 aa  246  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3680  putative F420-dependent oxidoreductase  51.38 
 
 		 281 aa  238  6.999999999999999e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3854  hypothetical protein  49.81 
 
 		 286 aa  237  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357835  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2688  hypothetical protein  49.81 
 
 		 286 aa  233  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.566827  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2385  putative F420-dependent oxidoreductase  52.34 
 
 		 288 aa  230  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1512  hypothetical protein  51.24 
 
 		 279 aa  229  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00633715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6257  hypothetical protein  50.37 
 
 		 285 aa  229  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.949372  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3207  putative F420-dependent oxidoreductase  50.79 
 
 		 272 aa  227  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0952  hypothetical protein  48.11 
 
 		 285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7266  hypothetical protein  45.61 
 
 		 334 aa  212  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5643  hypothetical protein  46.35 
 
 		 297 aa  208  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1545  hypothetical protein  48.05 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000935429  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0059  hypothetical protein  45.39 
 
 		 303 aa  196  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2620  hypothetical protein  48.39 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1071  hypothetical protein  46.52 
 
 		 304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3644  hypothetical protein  44.44 
 
 		 307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4349  hypothetical protein  44.07 
 
 		 324 aa  176  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3965  hypothetical protein  43.7 
 
 		 324 aa  169  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0486  hypothetical protein  42.03 
 
 		 303 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0508  hypothetical protein  42.03 
 
 		 303 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0497  hypothetical protein  42.03 
 
 		 303 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5428  hypothetical protein  40.87 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4154  hypothetical protein  40.77 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.238248  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5686  hypothetical protein  36.1 
 
 		 271 aa  115  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100066 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  31.82 
 
 		 318 aa  85.5  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  30.87 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.35 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  29.25 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  27.1 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2852  luciferase family protein  31 
 
 		 314 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.709446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  24.75 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.86 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.92 
 
 		 336 aa  54.3  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.62 
 
 		 327 aa  53.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  25.68 
 
 		 335 aa  53.5  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  27.94 
 
 		 321 aa  52.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  23.66 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.83 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  27.78 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.78 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.89 
 
 		 332 aa  50.8  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  25.85 
 
 		 346 aa  50.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  26.01 
 
 		 327 aa  48.9  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4576  putative oxidoreductase  29.18 
 
 		 355 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.248726  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.24 
 
 		 361 aa  46.6  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  24.38 
 
 		 318 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  29.29 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  36.84 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1994  luciferase family oxidoreductase, group 1  32.98 
 
 		 341 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2916  luciferase family protein  27.74 
 
 		 330 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  24.65 
 
 		 344 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4973  luciferase family protein  27.02 
 
 		 360 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  21.85 
 
 		 350 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  21.54 
 
 		 350 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  24.77 
 
 		 346 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4358  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  26.53 
 
 		 490 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366323  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1142  signal recognition particle protein  26.9 
 
 		 485 aa  42.4  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0433759  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.06 
 
 		 339 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3743  luciferase family protein  26.47 
 
 		 318 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3804  luciferase family protein  26.47 
 
 		 318 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0754765 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3731  luciferase-like protein  26.47 
 
 		 318 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1771  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  28.57 
 
 		 496 aa  42.7  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  30.43 
 
 		 301 aa  42.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3725  luciferase family protein  27.87 
 
 		 316 aa  42.4  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.290268  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17061  signal recognition particle protein (SRP54)  26.44 
 
 		 487 aa  42.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  26.44 
 
 		 351 aa  42.4  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>