139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1655 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1655  hypothetical protein  100 
 
 		 432 aa  870    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0980  protein of unknown function DUF88  39.44 
 
 		 260 aa  101  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0302  protein of unknown function DUF88  33.33 
 
 		 408 aa  97.1  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  30.92 
 
 		 249 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2817  hypothetical protein  30.46 
 
 		 253 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556577  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2999  protein of unknown function DUF88  30.46 
 
 		 253 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  35.48 
 
 		 501 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2905  protein of unknown function DUF88  30.46 
 
 		 253 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.489552  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  33.77 
 
 		 421 aa  84.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  34.84 
 
 		 496 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  36.49 
 
 		 507 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  35.48 
 
 		 508 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  38.52 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  31.82 
 
 		 472 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  34.84 
 
 		 498 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  34.84 
 
 		 498 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  34.84 
 
 		 498 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  32.9 
 
 		 440 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0007  hypothetical protein  35.71 
 
 		 487 aa  82  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0347  hypothetical protein  31.82 
 
 		 483 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1798  hypothetical protein  31.82 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  32.9 
 
 		 564 aa  80.5  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1883  hypothetical protein  32 
 
 		 477 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148092  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  34 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04690  hypothetical protein  31.33 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3191  protein of unknown function DUF88  32.67 
 
 		 478 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000122431  normal  0.16823 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  37.93 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  34.27 
 
 		 480 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  34.85 
 
 		 264 aa  75.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0052  protein of unknown function DUF88  37.14 
 
 		 470 aa  74.7  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315794  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1042  protein of unknown function DUF88  37.14 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.18689 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0898  hypothetical protein  30.83 
 
 		 311 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0915  hypothetical protein  30.83 
 
 		 311 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0904  hypothetical protein  30.83 
 
 		 311 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.070358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0806  protein of unknown function DUF88  26.67 
 
 		 246 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4443  hypothetical protein  31.54 
 
 		 329 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1014  hypothetical protein  32.03 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206165 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1822  hypothetical protein  32.31 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.81231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3445  hypothetical protein  27.68 
 
 		 842 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132322 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3705  protein of unknown function DUF88  25.88 
 
 		 600 aa  63.9  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000821311  hitchhiker  0.0000382798 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4412  hypothetical protein  26.46 
 
 		 787 aa  63.9  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00112817  normal  0.0579767 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18070  Protein of unknown function DUF88  30.99 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.304133  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1542  hypothetical protein  30.34 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2090  hypothetical protein  29.29 
 
 		 268 aa  62  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0105  hypothetical protein  26.51 
 
 		 236 aa  62.4  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0182  hypothetical protein  26.83 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1025  hypothetical protein  26.56 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0102117  normal  0.260028 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0220  hypothetical protein  26.83 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0199  hypothetical protein  26.83 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3241  hypothetical protein  27.04 
 
 		 789 aa  61.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3809  protein of unknown function DUF88  29.31 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.154504  normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3658  hypothetical protein  28.86 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339092  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0707  protein of unknown function DUF88  26.19 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000235983  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2469  protein of unknown function DUF88  32.79 
 
 		 629 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0741  protein of unknown function DUF88  37.19 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.614685 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15160  conserved hypothetical protein TIGR00288  32.85 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3691  hypothetical protein  29.25 
 
 		 272 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2652  protein of unknown function DUF88  27.86 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000246678  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0476  hypothetical protein  30.4 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0704  hypothetical protein  29.7 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3025  protein of unknown function DUF88  28.97 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.775317  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03707  hypothetical protein  29.63 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3744  hypothetical protein  28.28 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3564  hypothetical protein  28.92 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0656546 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1195  protein of unknown function DUF88  41.89 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1386  hypothetical protein  29.31 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2044  hypothetical protein  24.54 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0376115  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3535  hypothetical protein  27.33 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.098439  normal  0.0144387 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3603  protein of unknown function DUF88  28.57 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2410  hypothetical protein  27.94 
 
 		 259 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.727494  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0659  hypothetical protein  30.51 
 
 		 262 aa  55.1  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5405  protein of unknown function DUF88  26.8 
 
 		 450 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.964746  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1475  hypothetical protein  25.62 
 
 		 229 aa  54.3  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4318  hypothetical protein  28.1 
 
 		 298 aa  54.3  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.577985  normal  0.180731 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11160  conserved hypothetical protein  24.2 
 
 		 262 aa  53.9  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.997063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5232  hypothetical protein  27.21 
 
 		 284 aa  53.9  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.682006 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0048  hypothetical protein  22.86 
 
 		 239 aa  53.1  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.665316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7469  protein of unknown function DUF88  22.64 
 
 		 260 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1869  hypothetical protein  25.4 
 
 		 335 aa  52  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.670416  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3082  hypothetical protein  29.08 
 
 		 261 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.407546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0670  protein of unknown function DUF88  25.33 
 
 		 234 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135963  normal  0.923562 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2871  hypothetical protein  24.53 
 
 		 240 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3051  protein of unknown function DUF88  29.35 
 
 		 418 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10856 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0650  protein of unknown function DUF88  25.33 
 
 		 234 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1924  protein of unknown function DUF88  30.15 
 
 		 334 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000499479  unclonable  0.0000000129019 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0118  hypothetical protein  29.66 
 
 		 286 aa  50.8  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3395  hypothetical protein  23.9 
 
 		 432 aa  50.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11150  hypothetical protein  25.62 
 
 		 314 aa  50.4  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.280093 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0057  hypothetical protein  21.26 
 
 		 246 aa  50.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.184388 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2536  hypothetical protein  25 
 
 		 313 aa  49.7  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13473  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3232  hypothetical protein  25.33 
 
 		 419 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0597283  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0056  protein of unknown function DUF88  27.27 
 
 		 448 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2085  hypothetical protein  24.83 
 
 		 249 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000370224  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2419  hypothetical protein  27.45 
 
 		 247 aa  48.9  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4909  hypothetical protein  28.37 
 
 		 279 aa  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0665884  normal  0.351144 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0587  protein of unknown function DUF88  31.88 
 
 		 240 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000787089  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1459  hypothetical protein  22.95 
 
 		 248 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0110  hypothetical protein  22.95 
 
 		 248 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.151004 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0028  protein of unknown function DUF88  32 
 
 		 509 aa  47.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0673  protein of unknown function DUF88  34.57 
 
 		 165 aa  47.4  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.696503  normal  0.0525429 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>