107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0587 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0587  protein of unknown function DUF88  100 
 
 
240 aa  496  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000787089  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1187  hypothetical protein  74.87 
 
 
418 aa  309  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000236385  decreased coverage  0.000174597 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3051  protein of unknown function DUF88  79.12 
 
 
418 aa  308  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10856 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2484  hypothetical protein  69.71 
 
 
439 aa  263  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00113577  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1706  hypothetical protein  44.91 
 
 
507 aa  189  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.936741 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0028  protein of unknown function DUF88  47.03 
 
 
509 aa  175  7e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0056  protein of unknown function DUF88  46.27 
 
 
448 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0344  protein of unknown function DUF88  49.41 
 
 
504 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.752457  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3848  hypothetical protein  44.12 
 
 
461 aa  156  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1289  protein of unknown function DUF88  42.6 
 
 
474 aa  141  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0260555  hitchhiker  0.00441203 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4578  protein of unknown function DUF88  48.84 
 
 
527 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.975373  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3564  hypothetical protein  45.03 
 
 
415 aa  133  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0546  protein of unknown function DUF88  33.94 
 
 
426 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  28.48 
 
 
507 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  28.48 
 
 
501 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0347  hypothetical protein  30 
 
 
483 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  30 
 
 
472 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  28.48 
 
 
498 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  28.48 
 
 
498 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1798  hypothetical protein  30 
 
 
483 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  28.48 
 
 
498 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  27.62 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  28.48 
 
 
496 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  27.81 
 
 
508 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1883  hypothetical protein  29.66 
 
 
477 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148092  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  28 
 
 
564 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  28.86 
 
 
421 aa  75.5  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  25.13 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  28 
 
 
440 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  26.67 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  27.33 
 
 
480 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3191  protein of unknown function DUF88  27.7 
 
 
478 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000122431  normal  0.16823 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  30.48 
 
 
264 aa  67.8  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  30.26 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2905  protein of unknown function DUF88  29.61 
 
 
253 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.489552  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2999  protein of unknown function DUF88  29.61 
 
 
253 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2817  hypothetical protein  29.61 
 
 
253 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556577  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0741  protein of unknown function DUF88  36.36 
 
 
251 aa  53.5  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.614685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2090  hypothetical protein  22.29 
 
 
268 aa  51.6  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1822  hypothetical protein  25.62 
 
 
275 aa  50.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.81231  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0659  hypothetical protein  30.4 
 
 
262 aa  50.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0980  protein of unknown function DUF88  27 
 
 
260 aa  50.8  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0105  hypothetical protein  29.29 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0048  hypothetical protein  47.06 
 
 
239 aa  49.7  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.665316  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04690  hypothetical protein  28 
 
 
412 aa  48.9  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2026  hypothetical protein  48.94 
 
 
270 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1459  hypothetical protein  28.15 
 
 
248 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1542  hypothetical protein  27.16 
 
 
272 aa  47.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18070  Protein of unknown function DUF88  27.91 
 
 
335 aa  47.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.304133  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0110  hypothetical protein  28.15 
 
 
248 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.151004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4005  hypothetical protein  51.11 
 
 
263 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5232  hypothetical protein  48.94 
 
 
284 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.682006 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3445  hypothetical protein  26.97 
 
 
842 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.132322 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4745  hypothetical protein  51.11 
 
 
246 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1655  hypothetical protein  31.88 
 
 
432 aa  47.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3603  protein of unknown function DUF88  47.73 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162611  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4443  hypothetical protein  23.75 
 
 
329 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0057  hypothetical protein  28.36 
 
 
246 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.184388 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4412  hypothetical protein  27.27 
 
 
787 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00112817  normal  0.0579767 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03707  hypothetical protein  50 
 
 
276 aa  47  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2410  hypothetical protein  33.98 
 
 
259 aa  45.8  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.727494  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0199  hypothetical protein  26.32 
 
 
232 aa  45.8  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0335  hypothetical protein  43.48 
 
 
247 aa  45.4  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000159017  normal  0.161063 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4482  hypothetical protein  47.83 
 
 
267 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1014  hypothetical protein  27.91 
 
 
299 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.206165 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3705  protein of unknown function DUF88  26.15 
 
 
600 aa  45.4  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000821311  hitchhiker  0.0000382798 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3452  hypothetical protein  30.56 
 
 
282 aa  45.4  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2044  hypothetical protein  47.83 
 
 
249 aa  45.4  0.0009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0376115  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0182  hypothetical protein  26.36 
 
 
232 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0118  hypothetical protein  38.36 
 
 
286 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0220  hypothetical protein  26.36 
 
 
232 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1873  hypothetical protein  45.65 
 
 
252 aa  44.7  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0489  protein of unknown function DUF88  44.23 
 
 
287 aa  44.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49641  predicted protein  30.38 
 
 
779 aa  44.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3082  hypothetical protein  28.1 
 
 
261 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.407546  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3691  hypothetical protein  43.75 
 
 
272 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2071  hypothetical protein  45.65 
 
 
247 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000154426  normal  0.408823 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00290  hypothetical protein  42.11 
 
 
249 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0052  protein of unknown function DUF88  25.3 
 
 
470 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315794  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0857  protein of unknown function DUF88  45.1 
 
 
275 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3535  hypothetical protein  44.68 
 
 
264 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.098439  normal  0.0144387 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2871  hypothetical protein  47.83 
 
 
240 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2568  hypothetical protein  31.25 
 
 
189 aa  43.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.000000000124155  unclonable  0.0000000364355 
 
 
 
NC_008148  Rxyl_0007  hypothetical protein  28.33 
 
 
487 aa  43.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1403  hypothetical protein  32.5 
 
 
183 aa  43.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.175354 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00589  hypothetical protein  29.59 
 
 
156 aa  43.1  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0707  protein of unknown function DUF88  34.29 
 
 
258 aa  42.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000235983  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1475  hypothetical protein  26.36 
 
 
229 aa  43.1  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0095  hypothetical protein  29.79 
 
 
273 aa  42.7  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0117028  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3395  hypothetical protein  43.48 
 
 
432 aa  42.7  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0476  hypothetical protein  38.46 
 
 
265 aa  42.7  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1042  protein of unknown function DUF88  25.32 
 
 
378 aa  42.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.18689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7469  protein of unknown function DUF88  45.65 
 
 
260 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0898  hypothetical protein  26.74 
 
 
311 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0915  hypothetical protein  26.74 
 
 
311 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281794  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0904  hypothetical protein  26.74 
 
 
311 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.070358 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0316  hypothetical protein  43.48 
 
 
264 aa  42.4  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0675  hypothetical protein  37.1 
 
 
193 aa  42.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179061  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0991  protein of unknown function DUF88  37.1 
 
 
195 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.727303  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0806  protein of unknown function DUF88  34.33 
 
 
246 aa  42.4  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806829  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>