More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0228 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
333 aa  672  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  8.2788e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1661  glycosyl transferase family protein  38.91 
 
 
316 aa  204  1e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0913  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.15 
 
 
341 aa  172  7e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  6.88111e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1029  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
360 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3564  glycosyl transferase family protein  31.29 
 
 
389 aa  147  2e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3875  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 
331 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  28.62 
 
 
343 aa  141  2e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0604  putative glycosyl transferase  28.99 
 
 
340 aa  139  5e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.781878  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0718  family 2 glycosyl transferase  27.54 
 
 
352 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00805458 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2541  putative glycosyl transferase  28.18 
 
 
341 aa  133  4e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1349  glycosyltransferase  27.27 
 
 
343 aa  131  2e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05860  glycosyl transferase  25.62 
 
 
351 aa  127  3e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  26.99 
 
 
358 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  1.6442e-06 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  28.1 
 
 
337 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08480  glycosyl transferase  25.55 
 
 
324 aa  122  8e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.525807 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0838  glycosyl transferase family 2  27.08 
 
 
368 aa  111  1e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1038  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 
355 aa  106  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.378242  normal  0.03094 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1959  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 
329 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.465626 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5927  succinoglycan biosynthesis protein  26.59 
 
 
341 aa  103  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7649  glycosyl transferase family 2  28.17 
 
 
352 aa  99.8  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  29.07 
 
 
822 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0722  succinoglycan biosynthesis protein ExoA  23.95 
 
 
353 aa  97.1  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0657  glycosyl transferase family protein  24.62 
 
 
331 aa  95.9  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1222  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 
329 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.966529  normal  0.285342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2563  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 
329 aa  93.6  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4805  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 
339 aa  92.8  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  25.55 
 
 
322 aa  92  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1781  glycosyl transferase family 2  27.56 
 
 
326 aa  91.3  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.456914  normal  0.601286 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4957  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 
330 aa  89.4  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.083679 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  26.94 
 
 
403 aa  85.5  1e-15  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4523  glycosyl transferase family protein  24.84 
 
 
336 aa  85.1  1e-15  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131272  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4622  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 
355 aa  84.3  3e-15  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0686248 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  24.14 
 
 
450 aa  82.8  7e-15  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 
260 aa  82.8  7e-15  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  22.83 
 
 
428 aa  81.6  2e-14  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  27.76 
 
 
581 aa  80.5  4e-14  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.74352e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  22.6 
 
 
411 aa  80.5  4e-14  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.62 
 
 
336 aa  80.1  5e-14  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1291  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 
351 aa  79.7  6e-14  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  25.09 
 
 
441 aa  79  1e-13  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  25.09 
 
 
441 aa  79  1e-13  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  25.09 
 
 
441 aa  79  1e-13  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  25.09 
 
 
441 aa  79  1e-13  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  25.09 
 
 
441 aa  79  1e-13  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1662  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 
345 aa  78.6  1e-13  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.363785  hitchhiker  0.00433752 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  25.09 
 
 
412 aa  78.6  2e-13  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  25.09 
 
 
412 aa  78.2  2e-13  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
420 aa  77.8  3e-13  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3231  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 
316 aa  77  4e-13  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  9.4491e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0709  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 
249 aa  75.9  8e-13  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2238  glycosyl transferase family 2  26.45 
 
 
374 aa  75.5  1e-12  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 
335 aa  75.5  1e-12  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  27.55 
 
 
399 aa  75.1  2e-12  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  22.71 
 
 
509 aa  73.9  4e-12  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  27.65 
 
 
333 aa  73.9  4e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 
310 aa  73.2  6e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  25.46 
 
 
346 aa  73.2  6e-12  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  1.0329e-13 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  24.81 
 
 
298 aa  72.4  9e-12  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0595  glycosyl transferase family protein  34.68 
 
 
402 aa  72  1e-11  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  28.43 
 
 
235 aa  72.4  1e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  27.63 
 
 
528 aa  72  1e-11  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  23.26 
 
 
927 aa  72  1e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  23.53 
 
 
1002 aa  72.4  1e-11  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  25.12 
 
 
445 aa  71.2  2e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  22.92 
 
 
1115 aa  71.6  2e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  23.26 
 
 
1115 aa  71.2  2e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  31.63 
 
 
746 aa  70.9  3e-11  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  9.40813e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0738  glycosyl transferase family 2  28.43 
 
 
249 aa  71.2  3e-11  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.751434 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
321 aa  70.9  3e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  23.26 
 
 
1115 aa  70.5  4e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 
326 aa  70.1  5e-11  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.7 
 
 
326 aa  70.1  5e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.25 
 
 
326 aa  70.1  5e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  37.65 
 
 
326 aa  70.1  5e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  22.92 
 
 
1119 aa  70.1  5e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  26.39 
 
 
268 aa  69.7  6e-11  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07275  glycosyl transferase  28.84 
 
 
296 aa  69.3  8e-11  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170431  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  29.56 
 
 
333 aa  69.3  9e-11  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.25 
 
 
326 aa  69.3  9e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  24.43 
 
 
1152 aa  69.3  1e-10  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  25.34 
 
 
694 aa  68.9  1e-10  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  24.89 
 
 
872 aa  68.9  1e-10  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3641  glycosyl transferase family protein  23.56 
 
 
423 aa  69.3  1e-10  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144986  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3933  glycosyl transferase family 2  23.56 
 
 
423 aa  68.9  1e-10  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  24.43 
 
 
1152 aa  68.9  1e-10  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1578  glycosyl transferase family 2  26.58 
 
 
305 aa  68.9  1e-10  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5865  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 
292 aa  69.3  1e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  21.01 
 
 
477 aa  68.9  1e-10  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  21 
 
 
323 aa  69.3  1e-10  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  28.64 
 
 
328 aa  68.9  1e-10  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  22.19 
 
 
311 aa  68.2  2e-10  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 
347 aa  68.2  2e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  23.11 
 
 
301 aa  68.6  2e-10  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 
328 aa  68.6  2e-10  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 
303 aa  67.8  2e-10  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  24.91 
 
 
597 aa  68.2  2e-10  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  22.94 
 
 
337 aa  67.4  3e-10  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  32.76 
 
 
247 aa  67.8  3e-10  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0959  Cps2I  24.89 
 
 
306 aa  67.8  3e-10  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1346  glycosyl transferase  30.16 
 
 
697 aa  67.8  3e-10  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.938308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>