More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0578 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  58.5 
 
 		 775 aa  908    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 756 aa  1523    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  68.3 
 
 		 764 aa  1075    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  58.58 
 
 		 482 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  39.77 
 
 		 767 aa  512  1e-144  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  42.38 
 
 		 715 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  42.55 
 
 		 715 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  40.28 
 
 		 747 aa  402  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1632  Sodium/hydrogen exchanger  41.91 
 
 		 723 aa  393  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.531828 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  39.48 
 
 		 715 aa  377  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0736  sodium/hydrogen exchanger  45.99 
 
 		 495 aa  342  2e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1396  sodium/hydrogen exchanger  43.39 
 
 		 689 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052164  normal  0.118619 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1281  sodium/hydrogen exchanger  44.99 
 
 		 460 aa  326  1e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345739  normal  0.428465 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  42.22 
 
 		 423 aa  303  8.000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3561  sodium/hydrogen exchanger  40.95 
 
 		 420 aa  302  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1474  sodium/hydrogen exchanger  42.09 
 
 		 703 aa  298  4e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00326365  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3558  sodium/hydrogen exchanger  39.1 
 
 		 455 aa  287  4e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04834  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family  39.29 
 
 		 421 aa  285  3.0000000000000004e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01670  potassium:hydrogen antiporter, putative  36.16 
 
 		 951 aa  281  4e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4342  sodium/hydrogen exchanger  39.81 
 
 		 416 aa  264  6e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.322852  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3562  sodium/hydrogen exchanger  41.58 
 
 		 429 aa  263  6.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01290  potassium ion/proton antiporter (Eurofung)  38.71 
 
 		 883 aa  262  2e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.721044  normal  0.960342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5898  Kef-type K+ transport systems membrane components-like protein  36.47 
 
 		 683 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103243  normal  0.0297868 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0935  sodium/hydrogen exchanger  39.75 
 
 		 448 aa  258  4e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0791  Na+/H+ antiporter, putative  39.75 
 
 		 448 aa  258  4e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4109  sodium/hydrogen exchanger  37.08 
 
 		 425 aa  256  7e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478962 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43795  K(+)/H(+) antiporter  36.23 
 
 		 816 aa  254  5.000000000000001e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00004515  normal  0.344688 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1098  sodium/hydrogen exchanger  40.2 
 
 		 419 aa  254  6e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000276702  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0928  sodium/hydrogen exchanger family protein  38.82 
 
 		 430 aa  238  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4036  sodium/hydrogen exchanger  36.43 
 
 		 422 aa  233  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554914  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3445  sodium/hydrogen exchanger  36.16 
 
 		 427 aa  229  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243488 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2757  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.5 
 
 		 442 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.224799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3175  sodium/hydrogen exchanger  40.85 
 
 		 416 aa  216  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  30.88 
 
 		 436 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1229  sodium/hydrogen exchanger  34.09 
 
 		 410 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.440766  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  26.18 
 
 		 750 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6043  sodium/hydrogen exchanger  33.5 
 
 		 414 aa  194  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5813  sodium/hydrogen exchanger  33.5 
 
 		 414 aa  193  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2132  sodium/hydrogen exchanger  36.39 
 
 		 425 aa  192  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2714  sodium/hydrogen exchanger  35.19 
 
 		 439 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  26.88 
 
 		 748 aa  190  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  33.25 
 
 		 749 aa  189  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  30.92 
 
 		 460 aa  189  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1572  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.38 
 
 		 410 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4159  sodium/hydrogen exchanger  29.66 
 
 		 446 aa  181  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1654  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  33.07 
 
 		 410 aa  179  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148564  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2667  sodium/hydrogen exchanger  31.5 
 
 		 435 aa  178  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0143  sodium/hydrogen exchanger  33.07 
 
 		 410 aa  178  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1476  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  34.16 
 
 		 547 aa  177  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0269203  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0450  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  34.16 
 
 		 625 aa  177  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.26198  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2617  sodium/hydrogen exchanger  34.16 
 
 		 592 aa  177  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.129932  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1391  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  34.16 
 
 		 547 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4038  sodium/hydrogen exchanger  32.06 
 
 		 406 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0995  sodium/hydrogen exchanger  31.34 
 
 		 452 aa  172  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3484  sodium/hydrogen exchanger  31.81 
 
 		 406 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.861174  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1208  sodium/hydrogen exchanger  34.16 
 
 		 410 aa  172  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0581239  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1126  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  34.16 
 
 		 410 aa  172  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.251778  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0173  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  34.16 
 
 		 410 aa  172  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.661692  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0913  sodium/hydrogen exchanger  29.29 
 
 		 413 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2104  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  29.31 
 
 		 444 aa  164  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.134319  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2049  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  29.31 
 
 		 444 aa  163  9e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1004  sodium/hydrogen exchanger  29.31 
 
 		 444 aa  163  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0864919  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2241  sodium/hydrogen exchanger  29.31 
 
 		 444 aa  163  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310432  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3440  sodium/hydrogen exchanger  30.96 
 
 		 573 aa  161  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2332  sodium/hydrogen exchanger  29.82 
 
 		 444 aa  156  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  30.77 
 
 		 389 aa  153  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3203  sodium/hydrogen exchanger  27.13 
 
 		 404 aa  145  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  28.14 
 
 		 382 aa  144  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1412  sodium/hydrogen exchanger  26.67 
 
 		 424 aa  143  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4587  Sodium/hydrogen exchanger  25.11 
 
 		 712 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  29.43 
 
 		 414 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  28.36 
 
 		 387 aa  140  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  28.36 
 
 		 387 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  28.36 
 
 		 387 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  28.36 
 
 		 387 aa  139  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  28.61 
 
 		 387 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  28.11 
 
 		 387 aa  138  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  27.86 
 
 		 445 aa  137  9e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  28.11 
 
 		 387 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  27.86 
 
 		 387 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  28.15 
 
 		 387 aa  134  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  28.15 
 
 		 387 aa  134  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  29.06 
 
 		 396 aa  134  6.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  27.36 
 
 		 385 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  27.74 
 
 		 375 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  27.74 
 
 		 375 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  27.74 
 
 		 375 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  27.74 
 
 		 375 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  27.74 
 
 		 375 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  27.74 
 
 		 375 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  27.53 
 
 		 375 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  27.48 
 
 		 375 aa  131  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  27.57 
 
 		 412 aa  131  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  27.64 
 
 		 400 aa  130  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2626  sodium/hydrogen exchanger  23.76 
 
 		 722 aa  128  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0163  sodium/hydrogen exchanger  27.86 
 
 		 435 aa  128  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0515868 
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.48 
 
 		 427 aa  127  9e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  26.98 
 
 		 424 aa  124  5e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  27.75 
 
 		 390 aa  124  5e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4191  Sodium/hydrogen exchanger  26.18 
 
 		 399 aa  124  9e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>