More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1329 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1329  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
346 aa  704    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017523 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0563  biotin synthase  59.41 
 
 
345 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.295179  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2462  biotin synthase  54.65 
 
 
347 aa  378  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2775  biotin synthase  54.65 
 
 
347 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1130  biotin synthase  52.35 
 
 
352 aa  350  1e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000236268  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0181  Radical SAM domain protein  49.84 
 
 
349 aa  334  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  47.38 
 
 
351 aa  332  8e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000036845  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1597  biotin synthase  46.13 
 
 
341 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0240  biotin synthase  47.71 
 
 
349 aa  317  2e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19160  biotin synthase  46.18 
 
 
350 aa  311  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0257647  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1244  Radical SAM domain protein  46.88 
 
 
360 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1551  biotin synthase  46.57 
 
 
348 aa  298  7e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1502  biotin synthase  46.75 
 
 
348 aa  297  1e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000209115  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2151  biotin synthase  43.03 
 
 
354 aa  297  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0841  biotin synthase  43.91 
 
 
344 aa  296  3e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1735  biotin synthase  45.45 
 
 
350 aa  291  2e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00262623  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0166  radical SAM domain-containing protein  43.65 
 
 
370 aa  280  2e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.372295  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3189  biotin synthase  41.94 
 
 
345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000310414  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1722  biotin synthase  42.2 
 
 
348 aa  271  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000337366  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2083  biotin synthase  41.12 
 
 
372 aa  267  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1632  biotin synthase  42.86 
 
 
356 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000234633  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0271  Radical SAM domain protein  40.42 
 
 
347 aa  265  1e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.195415  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0144  Radical SAM domain protein  39.3 
 
 
352 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000047373  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1844  biotin synthase  40.62 
 
 
360 aa  251  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1491  biotin synthase  40.43 
 
 
357 aa  250  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1839  biotin synthase  39.94 
 
 
353 aa  248  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0814889  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1607  biotin synthase  39.47 
 
 
337 aa  247  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1100  Radical SAM domain protein  37.64 
 
 
364 aa  245  6.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00787041  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1020  biotin synthase  42.59 
 
 
311 aa  242  7.999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2639  Radical SAM domain protein  40.38 
 
 
374 aa  241  1e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1863  radical SAM domain-containing protein  41.16 
 
 
380 aa  240  2.9999999999999997e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.176912  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2277  biotin synthase  39.57 
 
 
337 aa  239  4e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1504  biotin synthase  43.92 
 
 
331 aa  236  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3925  biotin synthase  40.37 
 
 
359 aa  235  7e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1388  biotin synthase  42.09 
 
 
323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00378301  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3255  biotin synthase  38.44 
 
 
359 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.464529  hitchhiker  0.000014228 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16510  iron-only hydrogenase maturation protein HydE  37.46 
 
 
351 aa  231  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0706  biotin synthase  40.27 
 
 
359 aa  230  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.997344  hitchhiker  0.000263623 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0838  biotin synthase  29.93 
 
 
350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4857  Radical SAM domain protein  29.67 
 
 
365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0028  Radical SAM domain protein  28.34 
 
 
368 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2085  biotin synthase  27.11 
 
 
350 aa  98.2  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000297943  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  26.52 
 
 
341 aa  93.2  5e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  26.88 
 
 
341 aa  92.8  8e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0108  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.8 
 
 
473 aa  89.7  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1125  biotin synthase  26.52 
 
 
341 aa  89  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0106  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.46 
 
 
473 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0530  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.91 
 
 
466 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0145  biotin and thiamin synthesis associated  24.14 
 
 
475 aa  80.1  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000404218  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1026  biotin synthase  29.32 
 
 
344 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1131  biotin synthase  25.22 
 
 
341 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0169  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.18 
 
 
477 aa  78.2  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000784524  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1040  biotin synthase  27.31 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.683221  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0933  biotin synthase  27.31 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02211  Biotin synthase  23.24 
 
 
374 aa  75.9  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1841  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.74 
 
 
490 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0513393  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0182  thiamine biosynthesis protein ThiH  30 
 
 
469 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3104  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.39 
 
 
470 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4088  biotin synthase  23.86 
 
 
352 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.629007  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0630  biotin synthase  24.38 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000166613  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1632  biotin synthase  22.96 
 
 
331 aa  72.8  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  27.78 
 
 
388 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  27.59 
 
 
331 aa  72  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1738  biotin synthase  24.01 
 
 
349 aa  72.4  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2823  biotin synthase  25 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03970  biotin synthase, putative  22.78 
 
 
388 aa  71.6  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.299072  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1241  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.2 
 
 
492 aa  71.6  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0801  biotin synthase  23.08 
 
 
363 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  29.37 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  25.19 
 
 
360 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1553  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.88 
 
 
471 aa  70.5  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02695  Biotin synthase  22.74 
 
 
362 aa  70.5  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.175174  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2557  biotin synthase  22.76 
 
 
369 aa  70.5  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000730416  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  28.4 
 
 
320 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1410  biotin synthase  23.37 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000875332  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2150  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.37 
 
 
489 aa  69.7  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2107  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.65 
 
 
370 aa  69.7  0.00000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003871  biotin synthase  24.03 
 
 
350 aa  69.7  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0612  biotin synthase  23.4 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1504  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.21 
 
 
473 aa  69.7  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0434134  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2637  biotin and thiamin synthesis associated  25.89 
 
 
474 aa  69.7  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0455456  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0170  biotin synthase  24.91 
 
 
351 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  25.84 
 
 
331 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  25.19 
 
 
362 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01807  biotin synthase  24.03 
 
 
356 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1978  biotin synthase  22.92 
 
 
338 aa  68.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  28.62 
 
 
328 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0163  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.29 
 
 
491 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06500  biotin synthase  23.26 
 
 
352 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00342267  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0657  biotin synthase  26.15 
 
 
324 aa  67.8  0.0000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  23.21 
 
 
328 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0337  biotin synthase  24.63 
 
 
339 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  25.19 
 
 
359 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0352  biotin synthase  27.3 
 
 
326 aa  68.6  0.0000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.643225  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  25.21 
 
 
333 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0600  biotin synthase  23.26 
 
 
352 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  25.39 
 
 
329 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0860  biotin synthase  22.38 
 
 
350 aa  67.4  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  27.41 
 
 
368 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  27.41 
 
 
368 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>