More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_3112 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1359  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.8 
 
 		 978 aa  733    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.838712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14100  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  55.94 
 
 		 1043 aa  1144    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28440  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  57.96 
 
 		 986 aa  1150    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32018  normal  0.0233138 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3112  DNA polymerase III, epsilon subunit  100 
 
 		 966 aa  1979    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000116759  hitchhiker  0.000000000648685 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.62 
 
 		 944 aa  370  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.09 
 
 		 956 aa  363  8e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.65 
 
 		 927 aa  362  2e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.45 
 
 		 960 aa  328  3e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.88 
 
 		 930 aa  325  3e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.01 
 
 		 934 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.33 
 
 		 952 aa  316  9.999999999999999e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.84 
 
 		 934 aa  314  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.53 
 
 		 934 aa  312  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.74 
 
 		 934 aa  310  9e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.74 
 
 		 934 aa  310  9e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.89 
 
 		 921 aa  308  3e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.64 
 
 		 934 aa  308  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.64 
 
 		 934 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.73 
 
 		 929 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.74 
 
 		 934 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.64 
 
 		 934 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.73 
 
 		 934 aa  306  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.73 
 
 		 934 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  26.78 
 
 		 929 aa  289  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.28 
 
 		 921 aa  288  2.9999999999999996e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25.39 
 
 		 957 aa  287  9e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  28.42 
 
 		 822 aa  285  3.0000000000000004e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0024  helicase c2  27.24 
 
 		 846 aa  270  1e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  26.9 
 
 		 832 aa  258  3e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  30.11 
 
 		 851 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1132  hypothetical protein  27.37 
 
 		 681 aa  249  1e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  29.57 
 
 		 876 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  31.59 
 
 		 639 aa  241  2.9999999999999997e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0509  helicase c2  29.19 
 
 		 843 aa  241  4e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  28.61 
 
 		 843 aa  237  9e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  26.82 
 
 		 667 aa  236  2.0000000000000002e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  27.19 
 
 		 838 aa  232  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  30.36 
 
 		 651 aa  230  8e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  27.55 
 
 		 840 aa  229  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  28.94 
 
 		 658 aa  228  3e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  29.27 
 
 		 646 aa  228  4e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  28.93 
 
 		 640 aa  226  2e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  29.01 
 
 		 674 aa  219  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  27.86 
 
 		 659 aa  220  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  30.75 
 
 		 633 aa  215  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  29.73 
 
 		 639 aa  214  7e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1626  ATP-dependent DNA helicase-related protein  29.28 
 
 		 713 aa  214  7.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  28.24 
 
 		 707 aa  214  7.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4323  helicase c2  31.04 
 
 		 631 aa  213  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1295  helicase c2  30.63 
 
 		 664 aa  213  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4459  helicase c2  30.78 
 
 		 633 aa  213  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157065  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  27.35 
 
 		 729 aa  212  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4486  helicase c2  30.73 
 
 		 714 aa  210  9e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0820  helicase c2  29.3 
 
 		 650 aa  209  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  25.34 
 
 		 709 aa  208  4e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  27.64 
 
 		 661 aa  207  6e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  30.53 
 
 		 653 aa  207  7e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  29.22 
 
 		 647 aa  204  6e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0323  helicase c2  30.86 
 
 		 699 aa  201  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0709  helicase c2  28.73 
 
 		 650 aa  201  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01597  ATP-dependent helicase  29.83 
 
 		 675 aa  198  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  27.52 
 
 		 641 aa  198  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0280  helicase c2  30 
 
 		 683 aa  197  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0332575 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1030  Rad3-related DNA helicase  25.08 
 
 		 937 aa  196  1e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0174435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3486  helicase c2  28.23 
 
 		 698 aa  196  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  27.27 
 
 		 646 aa  195  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10610  DNA helicase, Rad3  28.49 
 
 		 673 aa  195  4e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.382167  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4468  helicase c2  30.49 
 
 		 635 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3499  helicase c2  29.92 
 
 		 724 aa  191  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.285018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1779  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  27.93 
 
 		 641 aa  191  5e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2170  putative ATP-dependent helicase  30.01 
 
 		 752 aa  190  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.779886  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1612  putative ATP-dependent helicase  29.84 
 
 		 751 aa  189  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100383  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2207  putative ATP-dependent helicase  30.22 
 
 		 749 aa  189  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1403  helicase c2  29.55 
 
 		 757 aa  189  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127709  hitchhiker  0.000000348035 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2251  ATP-dependent helicase, putative  29.52 
 
 		 755 aa  188  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.247338  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0504  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.56 
 
 		 909 aa  187  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2524  helicase c2  29.72 
 
 		 755 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00188741  decreased coverage  0.000000000263353 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2483  ATP-dependent DNA helicase DinG  26.86 
 
 		 690 aa  184  8.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204554 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3086  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.14 
 
 		 692 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175143  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1566  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.03 
 
 		 692 aa  180  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000620367 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1618  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.92 
 
 		 690 aa  180  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.326155  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2725  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.92 
 
 		 690 aa  180  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0300555  hitchhiker  0.000425027 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1652  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.92 
 
 		 690 aa  180  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2656  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.31 
 
 		 690 aa  179  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.765136  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1629  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.78 
 
 		 690 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1269  helicase c2  27.91 
 
 		 636 aa  178  5e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2429  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.74 
 
 		 691 aa  177  7e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.25 
 
 		 691 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1543  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  22.56 
 
 		 897 aa  174  7.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.959984  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1514  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  22.56 
 
 		 897 aa  174  7.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.103927  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0013  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.72 
 
 		 741 aa  174  9e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1819  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.46 
 
 		 690 aa  173  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.35 
 
 		 921 aa  169  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0021  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.29 
 
 		 692 aa  162  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1129  ATP-dependent DNA helicase DinG  24.45 
 
 		 694 aa  160  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0640459  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1585  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.38 
 
 		 725 aa  159  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3854  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.15 
 
 		 700 aa  158  6e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0916  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  29.04 
 
 		 954 aa  156  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4158  ATP-dependent DNA helicase DinG  26.37 
 
 		 758 aa  156  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0350  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.03 
 
 		 711 aa  156  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00468076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>