More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0008 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03578  predicted DNA-binding transcriptional regulator  100 
 
 
229 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1098  galactonate operon transcriptional repressor  100 
 
 
229 aa  473  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03522  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4060  galactonate operon transcriptional repressor  100 
 
 
229 aa  473  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0008  GntR domain-containing protein  100 
 
 
229 aa  473  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4204  galactonate operon transcriptional repressor  100 
 
 
229 aa  473  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.763278  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0008  GntR domain protein  100 
 
 
229 aa  473  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3907  galactonate operon transcriptional repressor  100 
 
 
229 aa  473  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0006  GntR family transcriptional regulator  95.63 
 
 
229 aa  454  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4164  galactonate operon transcriptional repressor  94.76 
 
 
229 aa  453  1e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  0.912647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4115  galactonate operon transcriptional repressor  94.76 
 
 
229 aa  453  1e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4222  galactonate operon transcriptional repressor  94.76 
 
 
229 aa  453  1e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0022  GntR domain protein  81.5 
 
 
232 aa  390  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0041  GntR domain-containing protein  77.97 
 
 
252 aa  374  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3530  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 
247 aa  141  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0642963  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2217  GntR domain protein  38.65 
 
 
239 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0711  GntR domain-containing protein  35.51 
 
 
243 aa  135  6e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.121808 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3688  GntR domain protein  34.48 
 
 
248 aa  134  2e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0894  GntR-like  35.75 
 
 
253 aa  128  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5012  GntR domain protein  36.07 
 
 
239 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3228  GntR family transcriptional regulator  36.74 
 
 
239 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542599  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0901  GntR-like  33.8 
 
 
246 aa  120  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49240  GntR family regulatory protein  36.79 
 
 
240 aa  118  8e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4214  GntR domain-containing protein  37.26 
 
 
266 aa  118  8e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1092  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
238 aa  117  1e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.191594 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2064  GntR domain-containing protein  32.56 
 
 
238 aa  117  1e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  1.13894e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3599  GntR domain-containing protein  32.71 
 
 
251 aa  117  2e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1327  GntR domain-containing protein  37.31 
 
 
246 aa  113  2e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0190888  normal  0.291118 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3667  GntR domain-containing protein  31.75 
 
 
245 aa  112  4e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0203377  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1724  GntR domain protein  29.61 
 
 
261 aa  112  4e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308508  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1994  GntR domain-containing protein  35.38 
 
 
240 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122046  normal  0.944631 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3082  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 
241 aa  112  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0951451 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0123  regulatory protein GntR HTH  32.71 
 
 
261 aa  112  7e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1284  GntR domain-containing protein  35.68 
 
 
274 aa  111  8e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0100582 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2142  GntR domain protein  31.63 
 
 
238 aa  111  9e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.530271  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3773  transcriptional regulator, GntR family  34.43 
 
 
237 aa  110  1e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38941  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3532  GntR-like  32.57 
 
 
244 aa  110  2e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1981  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
238 aa  110  2e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  3.58345e-09  normal  0.05165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1993  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
238 aa  110  2e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.85576e-06  unclonable  2.07183e-05 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4123  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
230 aa  110  2e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  8.60554e-08  normal  0.0423809 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1707  transcriptional regulator GntR  34.43 
 
 
237 aa  110  2e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0401914  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2068  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
238 aa  110  2e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  9.11573e-09  hitchhiker  3.03995e-06 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6253  GntR domain protein  36.41 
 
 
256 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0746  GntR-like protein  34.31 
 
 
241 aa  109  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3766  GntR domain protein  33.64 
 
 
251 aa  109  4e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3422  GntR domain protein  33.65 
 
 
244 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156381  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0804  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
240 aa  108  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1908  GntR domain protein  29.61 
 
 
261 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287646  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4164  transcriptional regulator, GntR family  30.99 
 
 
230 aa  108  7e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  2.55806e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3974  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
230 aa  108  8e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.45513e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4271  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
230 aa  108  8e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  1.61964e-08  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03641  predicted transcriptional regulator  30.99 
 
 
230 aa  108  9e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  7.92391e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4212  GntR domain protein  30.99 
 
 
230 aa  108  9e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  9.74871e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5191  transcriptional regulator, GntR family  30.99 
 
 
230 aa  108  9e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  1.2685e-06  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03586  hypothetical protein  30.99 
 
 
230 aa  108  9e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  4.43765e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1785  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
244 aa  108  9e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.751701  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4239  GntR domain-containing protein  30.99 
 
 
230 aa  108  9e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  2.3918e-05  decreased coverage  0.00261992 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3478  GntR domain protein  33.64 
 
 
251 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.554366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0046  GntR domain-containing protein  33.5 
 
 
235 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4894  GntR domain-containing protein  33.83 
 
 
229 aa  106  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000861781  hitchhiker  6.33527e-07 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4109  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
230 aa  105  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000434106  decreased coverage  0.00494792 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2131  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 
247 aa  105  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4115  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 
234 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  1.73473e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4171  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
234 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000336109  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4144  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
238 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278058  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4280  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
234 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.003808  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4221  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
234 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000881899  normal  0.895287 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4100  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 
234 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  1.22034e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  33.63 
 
 
231 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5052  transcriptional regulator  30.73 
 
 
242 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.259786  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0885  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
239 aa  102  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0434  GntR domain-containing protein  32.58 
 
 
287 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0144479  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1414  GntR domain-containing protein  30.32 
 
 
241 aa  102  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3460  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 
248 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612558  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0940  GntR domain protein  30.43 
 
 
239 aa  99.4  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120535  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3614  GntR domain-containing protein  34.62 
 
 
250 aa  97.4  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.661468  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  33.64 
 
 
239 aa  97.1  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 
255 aa  96.7  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1451  GntR domain-containing protein  29.77 
 
 
238 aa  95.9  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1472  GntR domain-containing protein  29.77 
 
 
238 aa  95.9  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4912  GntR domain-containing protein  29.36 
 
 
244 aa  95.9  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2718  GntR domain-containing protein  32.74 
 
 
252 aa  95.9  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0011  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
229 aa  95.5  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  1.9573e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0011  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
229 aa  95.5  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.98907e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4206  GntR domain-containing protein  29.52 
 
 
229 aa  95.5  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  4.81189e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  32.59 
 
 
238 aa  94.7  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1146  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
271 aa  94.7  9e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1899  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
241 aa  95.1  9e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.671252  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8406  regulatory protein GntR HTH  35.62 
 
 
277 aa  94.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  30.32 
 
 
226 aa  93.2  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3616  GntR domain-containing protein  31.46 
 
 
252 aa  92.8  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.760095 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1414  GntR domain-containing protein  27.6 
 
 
250 aa  92.4  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  0.0932364 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5704  GntR domain protein  32.46 
 
 
254 aa  92  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3302  GntR domain protein  33.16 
 
 
268 aa  91.7  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.826091 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2590  GntR domain-containing protein  30.7 
 
 
234 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1682  GntR domain-containing protein  30 
 
 
238 aa  89.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.119908 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  30.9 
 
 
247 aa  89.4  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 
255 aa  88.6  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2414  GntR domain-containing protein  34.13 
 
 
253 aa  88.6  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.493248  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  29.86 
 
 
239 aa  87.8  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>