137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1950 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1950  putative methyltransferase  100 
 
 
270 aa  558  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  55.97 
 
 
273 aa  322  6e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  35.54 
 
 
263 aa  172  6e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  30.48 
 
 
275 aa  157  1e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  32.38 
 
 
264 aa  149  6e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  31.32 
 
 
279 aa  135  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  32.48 
 
 
269 aa  128  1e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  29.72 
 
 
268 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  29.96 
 
 
270 aa  105  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.17 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  26.5 
 
 
302 aa  87  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  1.51267e-06 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  27.54 
 
 
274 aa  84.7  1e-15  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09260  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.27 
 
 
352 aa  79.3  5e-14  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.505356  normal  0.0667798 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  23.4 
 
 
291 aa  79  9e-14  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  26.15 
 
 
275 aa  76.3  6e-13  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  24.88 
 
 
286 aa  71.2  2e-11  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  29.21 
 
 
279 aa  69.7  5e-11  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  27.86 
 
 
265 aa  69.3  6e-11  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1447  hypothetical protein  26.43 
 
 
280 aa  68.2  1e-10  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.814616  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  28.73 
 
 
283 aa  68.2  1e-10  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  24.41 
 
 
286 aa  67.8  2e-10  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  26.32 
 
 
287 aa  67  3e-10  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3030  methyltransferase type 12  28.77 
 
 
274 aa  67  4e-10  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  23.28 
 
 
283 aa  64.7  1e-09  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0369  methyltransferase type 12  27.5 
 
 
254 aa  65.1  1e-09  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151072  normal  0.249023 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  24.64 
 
 
278 aa  62.8  6e-09  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  26.73 
 
 
293 aa  62.4  8e-09  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  23.32 
 
 
279 aa  60.5  3e-08  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  29.91 
 
 
279 aa  60.1  4e-08  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  25.97 
 
 
302 aa  59.7  5e-08  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  24.88 
 
 
279 aa  59.3  6e-08  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1045  hypothetical protein  23.42 
 
 
277 aa  58.5  1e-07  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  28.4 
 
 
280 aa  58.5  1e-07  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  4.70965e-06  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  32.38 
 
 
260 aa  58.9  1e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  24.37 
 
 
270 aa  57  3e-07  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  24.22 
 
 
283 aa  55.8  6e-07  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0326  hypothetical protein  22.18 
 
 
276 aa  55.1  1e-06  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0091  hypothetical protein  29.84 
 
 
240 aa  54.3  2e-06  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0346514  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1285  methyltransferase type 12  25 
 
 
273 aa  54.3  2e-06  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1495  hypothetical protein  25.66 
 
 
273 aa  54.7  2e-06  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000420591  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  23.46 
 
 
291 aa  53.9  3e-06  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4141  putative methyltransferase  27.52 
 
 
273 aa  53.1  4e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34511  normal  0.0273084 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  28.35 
 
 
271 aa  53.1  4e-06  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1721  hypothetical protein  24.59 
 
 
239 aa  53.1  5e-06  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  23.6 
 
 
278 aa  52.8  5e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  4.79797e-05 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  20.24 
 
 
295 aa  52.8  6e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  23.74 
 
 
286 aa  52  9e-06  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  27.49 
 
 
276 aa  52  1e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0040  hypothetical protein  25.48 
 
 
274 aa  50.8  2e-05  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.25968  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1722  hypothetical protein  23.7 
 
 
279 aa  50.4  3e-05  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.26 
 
 
212 aa  50.1  4e-05  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8959  hypothetical protein  24.49 
 
 
261 aa  50.1  4e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1982  hypothetical protein  22.13 
 
 
268 aa  49.3  7e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02844  methyltransferase  38.33 
 
 
239 aa  49.3  7e-05  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1296  hypothetical protein  29.17 
 
 
248 aa  48.9  9e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0615608  normal  0.430138 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0040  hypothetical protein  23.98 
 
 
232 aa  48.9  9e-05  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0288  hypothetical protein  23.5 
 
 
239 aa  48.1  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  28.03 
 
 
292 aa  48.5  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3603  hypothetical protein  34.33 
 
 
246 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.879922  normal  0.0916284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  39.24 
 
 
257 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  29.52 
 
 
247 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.07695e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1510  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.38 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  32.41 
 
 
211 aa  47  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1749  methyltransferase type 12  32.14 
 
 
215 aa  46.6  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.110719  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0112  Methyltransferase type 11  33.82 
 
 
258 aa  46.6  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2519  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.62 
 
 
438 aa  46.6  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.163711  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2192  methyltransferase type 11  33.85 
 
 
279 aa  46.6  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1271  hypothetical protein  25 
 
 
277 aa  46.6  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  5.29075e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1633  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30 
 
 
234 aa  46.6  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.879034  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3809  Methyltransferase type 11  27.4 
 
 
279 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3760  Methyltransferase type 11  27.4 
 
 
279 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2361  methyltransferase type 12  23.93 
 
 
291 aa  46.6  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  40 
 
 
261 aa  46.2  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  32.88 
 
 
243 aa  46.2  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0311  hypothetical protein  23.42 
 
 
237 aa  45.8  0.0007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.322092  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0121  methyltransferase type 12  30.67 
 
 
330 aa  45.8  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.333152 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1523  cobalt-precorrin-6Y C(15)-methyltransferase  29.46 
 
 
195 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  1.32961e-05 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  21.58 
 
 
289 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  31.65 
 
 
453 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0756  Methyltransferase type 11  27.67 
 
 
207 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  38.98 
 
 
254 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2323  hypothetical protein  30.21 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.569628  normal  0.0283599 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  30.34 
 
 
218 aa  44.3  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0200  hypothetical protein  21.51 
 
 
311 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1199  hypothetical protein  34.21 
 
 
223 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.105724  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0218  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
212 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1055  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  29.91 
 
 
218 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.265378 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0491  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.5 
 
 
288 aa  44.3  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1276  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.57 
 
 
271 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281343  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  43.64 
 
 
272 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1797  flagellar basal-body rod protein  27.07 
 
 
241 aa  44.7  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.119466  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1453  SAM-dependent methyltransferase  39.34 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.938233  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  38.27 
 
 
236 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  25.13 
 
 
288 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4469  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36 
 
 
228 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.152324 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
268 aa  44.3  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  36.92 
 
 
266 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  33.93 
 
 
361 aa  43.9  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2984  methyltransferase type 11  40 
 
 
227 aa  43.9  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  20.77 
 
 
323 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>