More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0015 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  87.93 
 
 
497 aa  920  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  88.13 
 
 
497 aa  923  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  100 
 
 
497 aa  1023  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  85.71 
 
 
497 aa  901  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  70.46 
 
 
501 aa  740  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  88.13 
 
 
497 aa  922  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  87.93 
 
 
497 aa  922  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  33.4 
 
 
452 aa  231  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  31.74 
 
 
497 aa  216  1e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  32.18 
 
 
510 aa  202  1e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  31.35 
 
 
470 aa  201  2e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  31.93 
 
 
468 aa  198  2e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  31.85 
 
 
539 aa  198  2e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  31.67 
 
 
458 aa  196  8e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  31.18 
 
 
470 aa  194  4e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  31.19 
 
 
466 aa  193  5e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  31.28 
 
 
474 aa  193  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  30.19 
 
 
453 aa  191  3e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  31.87 
 
 
462 aa  191  3e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  31.83 
 
 
440 aa  189  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  30.23 
 
 
523 aa  188  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  30.71 
 
 
457 aa  185  1e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  30.64 
 
 
553 aa  184  2e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  28.92 
 
 
484 aa  185  2e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  30.85 
 
 
453 aa  185  2e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  27.66 
 
 
519 aa  184  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  29.65 
 
 
479 aa  184  4e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  28.21 
 
 
500 aa  183  7e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  30.02 
 
 
495 aa  183  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  30.6 
 
 
471 aa  183  8e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  30.34 
 
 
440 aa  182  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  30.5 
 
 
631 aa  182  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  28.9 
 
 
491 aa  179  7e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  31.45 
 
 
480 aa  178  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  30 
 
 
536 aa  178  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  30.71 
 
 
480 aa  178  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  27.57 
 
 
517 aa  177  3e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  29.12 
 
 
500 aa  177  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2292  sulfatase  28.14 
 
 
489 aa  175  1e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  30.68 
 
 
543 aa  176  1e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1776  sulfatase  29.62 
 
 
520 aa  175  2e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.791288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  31.34 
 
 
486 aa  175  2e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  30.59 
 
 
492 aa  175  2e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  29 
 
 
482 aa  174  4e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4996  sulfatase  29.05 
 
 
506 aa  173  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  31.07 
 
 
488 aa  173  6e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  30.65 
 
 
481 aa  173  6e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  31.15 
 
 
490 aa  172  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  30.08 
 
 
487 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  29.18 
 
 
506 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1568  sulfatase  28.02 
 
 
638 aa  171  4e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365787  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0820  sulfatase  28.69 
 
 
627 aa  170  6e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  30.66 
 
 
481 aa  170  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0819  sulfatase  28.92 
 
 
523 aa  168  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  28.38 
 
 
472 aa  168  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  30.55 
 
 
543 aa  168  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0299  sulfatase  28.7 
 
 
609 aa  167  3e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  31.21 
 
 
460 aa  167  3e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2624  arylsulfatase  28.65 
 
 
541 aa  168  3e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.344429  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1030  sulfatase  28.15 
 
 
470 aa  167  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3640  sulfatase  26.42 
 
 
520 aa  166  8e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  29.12 
 
 
467 aa  166  8e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  31.88 
 
 
457 aa  166  9e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2743  sulfatase  27.78 
 
 
581 aa  166  1e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3047  sulfatase  28.43 
 
 
503 aa  165  2e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0209579 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3374  sulfatase  28.13 
 
 
507 aa  164  4e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  28.32 
 
 
553 aa  164  5e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  30.21 
 
 
511 aa  164  5e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0491  sulfatase  29.66 
 
 
500 aa  163  6e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.244971 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  27.56 
 
 
478 aa  163  8e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3651  sulfatase  29.06 
 
 
483 aa  162  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  6.43806e-07  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0357  arylsulfatase  30.47 
 
 
512 aa  161  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.340259  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0440  sulfatase  25.76 
 
 
505 aa  160  3e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0138449  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  28.54 
 
 
491 aa  160  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2053  sulfatase  30.14 
 
 
556 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.627693  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  28.35 
 
 
526 aa  158  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  29.81 
 
 
465 aa  158  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  29.05 
 
 
548 aa  158  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01110  arylsulfatase A family protein  28.6 
 
 
480 aa  157  4e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  27.58 
 
 
486 aa  157  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  28.46 
 
 
559 aa  157  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3990  sulfatase family protein  30.64 
 
 
517 aa  157  6e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3352  arylsulfatase, putative  29.04 
 
 
554 aa  157  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386484  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2014  sulfatase  27.95 
 
 
596 aa  156  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124362  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  29.62 
 
 
489 aa  156  9e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1946  sulfatase  29.87 
 
 
546 aa  155  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0419  sulfatase  27.89 
 
 
513 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4036  sulfatase  29.2 
 
 
459 aa  154  3e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188862  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3913  sulfatase  28.89 
 
 
522 aa  154  3e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.656698  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1202  sulfatase  29.05 
 
 
547 aa  154  3e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191965 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  27.87 
 
 
471 aa  154  3e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2890  sulfatase  29.29 
 
 
523 aa  154  3e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2406  sulfatase  29.12 
 
 
534 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  27.84 
 
 
442 aa  153  6e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  30.97 
 
 
535 aa  153  7e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2725  sulfatase  28.54 
 
 
724 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0744828  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  28.31 
 
 
482 aa  152  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0354  sulfatase  26.95 
 
 
493 aa  150  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3081  arylsulfatase  28.54 
 
 
496 aa  150  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2015  sulfatase  28.04 
 
 
497 aa  150  5e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.295257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>