More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A3890 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  98.76 
 
 		 402 aa  829    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  98.69 
 
 		 382 aa  787    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 		 402 aa  841    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  96.77 
 
 		 402 aa  808    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  98.69 
 
 		 382 aa  787    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  98.26 
 
 		 402 aa  823    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  97.51 
 
 		 402 aa  818    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  96.27 
 
 		 402 aa  804    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  95.87 
 
 		 387 aa  771    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  78.86 
 
 		 402 aa  676    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  98.76 
 
 		 402 aa  829    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  96.52 
 
 		 402 aa  811    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  96.77 
 
 		 402 aa  808    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  96.27 
 
 		 402 aa  805    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  97.26 
 
 		 402 aa  813    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  61.87 
 
 		 400 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  57.8 
 
 		 411 aa  500  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  59.59 
 
 		 403 aa  494  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  58.74 
 
 		 411 aa  492  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  59.42 
 
 		 403 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  59.69 
 
 		 403 aa  488  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  58.81 
 
 		 411 aa  490  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  59.95 
 
 		 406 aa  491  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  57.8 
 
 		 411 aa  482  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  57.74 
 
 		 413 aa  482  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  56.34 
 
 		 411 aa  478  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  63.8 
 
 		 399 aa  471  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  55.5 
 
 		 431 aa  451  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  55.89 
 
 		 422 aa  430  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  57.02 
 
 		 348 aa  416  9.999999999999999e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  57.02 
 
 		 348 aa  416  9.999999999999999e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  56.45 
 
 		 348 aa  414  1e-114  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0649  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  46.28 
 
 		 435 aa  356  2.9999999999999997e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  43.47 
 
 		 422 aa  352  7e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  44.91 
 
 		 381 aa  341  2e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  44.65 
 
 		 381 aa  339  5e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1058  ISAfe8, transposase  46.04 
 
 		 408 aa  333  3e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19621  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1215  ISAfe8, transposase  45.54 
 
 		 408 aa  331  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0668  transposase  56.19 
 
 		 231 aa  271  2e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000294639  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0717  transposase  56.88 
 
 		 219 aa  261  1e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0318714  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1133  transposase, IS605 OrfB  39.07 
 
 		 397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1324  transposase  39.07 
 
 		 397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0532148  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1584  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  37.97 
 
 		 417 aa  239  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.758267 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5477  IS605 family transposase OrfB  37.97 
 
 		 416 aa  240  4e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.461601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  36.53 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  33.76 
 
 		 395 aa  226  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3319  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  38.38 
 
 		 415 aa  227  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5691  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.8 
 
 		 396 aa  226  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3509  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.9 
 
 		 398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1550  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.63 
 
 		 401 aa  219  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.734191  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  34.19 
 
 		 390 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6840  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.32 
 
 		 396 aa  213  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.643066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  33.67 
 
 		 383 aa  209  7e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  35.64 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  35.64 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6349  transposase  36.34 
 
 		 429 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  35.01 
 
 		 410 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  34.68 
 
 		 424 aa  207  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  37.78 
 
 		 361 aa  206  5e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  35.11 
 
 		 399 aa  206  7e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1159  transposase, IS605 OrfB family  33.42 
 
 		 416 aa  205  9e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  35.81 
 
 		 398 aa  205  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  35.81 
 
 		 398 aa  205  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  35.03 
 
 		 377 aa  204  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  34.49 
 
 		 373 aa  202  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  34.03 
 
 		 368 aa  202  6e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  35.81 
 
 		 398 aa  202  7e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0201  IS605 family transposase OrfB  32.89 
 
 		 385 aa  202  7e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000194492  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1800  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  36.88 
 
 		 386 aa  202  8e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31256  normal  0.500943 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4920  transposase, IS607 family  36.66 
 
 		 393 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3537  transposase, IS605 OrfB family  36.66 
 
 		 393 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0103085 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  32.51 
 
 		 391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  33.84 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  32.51 
 
 		 391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  35.11 
 
 		 410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  34.46 
 
 		 381 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  33.96 
 
 		 373 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  33.96 
 
 		 373 aa  200  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  33.51 
 
 		 373 aa  199  7e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  33.51 
 
 		 372 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  33.89 
 
 		 405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  32.18 
 
 		 391 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  33.51 
 
 		 383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0394  transposase, IS605 OrfB family  32.16 
 
 		 402 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3797  IS605 family transposase OrfB  34.09 
 
 		 429 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  33.69 
 
 		 372 aa  196  7e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.5 
 
 		 376 aa  196  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  32.21 
 
 		 370 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  33.69 
 
 		 372 aa  196  9e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0182  IS605 family transposase OrfB  33.08 
 
 		 383 aa  195  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  33.69 
 
 		 372 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  33.24 
 
 		 383 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  33.69 
 
 		 373 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  33.69 
 
 		 373 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  36.06 
 
 		 377 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  33.69 
 
 		 373 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2446  IS605 family transposase OrfB  32.82 
 
 		 383 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.327325  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  32.58 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4737  IS605 family transposase OrfB  32.45 
 
 		 371 aa  194  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3396  IS605 family transposase OrfB  32.11 
 
 		 385 aa  194  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000848869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>