99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2516 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1535  Saccharopine dehydrogenase  90.15 
 
 		 396 aa  750    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.82797 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2516  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 396 aa  831    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.558897  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0125  Saccharopine dehydrogenase  78.14 
 
 		 403 aa  635    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0572  saccharopine dehydrogenase  83.63 
 
 		 398 aa  702    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2320  Saccharopine dehydrogenase  84.05 
 
 		 396 aa  718    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2607  saccharopine dehydrogenase  71.14 
 
 		 398 aa  605  9.999999999999999e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2539  saccharopine dehydrogenase  72.15 
 
 		 398 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2095  saccharopine dehydrogenase-like protein  71.9 
 
 		 399 aa  600  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1597  Acyl carrier protein (ACP)  72.91 
 
 		 399 aa  599  1e-170  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0902  saccharopine dehydrogenase  72.15 
 
 		 397 aa  598  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168136 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1676  Saccharopine dehydrogenase  71.39 
 
 		 398 aa  593  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0203222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1307  Saccharopine dehydrogenase  71.9 
 
 		 399 aa  585  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000784986 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2918  Saccharopine dehydrogenase  72.41 
 
 		 398 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6504  Saccharopine dehydrogenase  71.1 
 
 		 395 aa  580  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1555  Saccharopine dehydrogenase  68.03 
 
 		 401 aa  580  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000142738  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0747  saccharopine dehydrogenase  67.34 
 
 		 403 aa  577  1.0000000000000001e-163  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000418334  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1128  Saccharopine dehydrogenase  68.29 
 
 		 399 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.785881  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2142  Saccharopine dehydrogenase  68.86 
 
 		 404 aa  574  1.0000000000000001e-163  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0148  Saccharopine dehydrogenase  67.34 
 
 		 409 aa  572  1.0000000000000001e-162  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3052  saccharopine dehydrogenase  68.37 
 
 		 399 aa  569  1e-161  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0981  saccharopine dehydrogenase  71.39 
 
 		 398 aa  570  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0620633  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1790  saccharopine dehydrogenase  66.58 
 
 		 401 aa  566  1e-160  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0415  saccharopine dehydrogenase  66.41 
 
 		 405 aa  565  1e-160  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2888  Saccharopine dehydrogenase  68.11 
 
 		 403 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120454 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1201  saccharopine dehydrogenase  66.92 
 
 		 402 aa  560  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.150944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1922  saccharopine dehydrogenase  68.11 
 
 		 392 aa  559  1e-158  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00339893 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0458  saccharopine dehydrogenase  64.3 
 
 		 401 aa  555  1e-157  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0061  saccharopine dehydrogenase  63.8 
 
 		 403 aa  551  1e-156  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0208  saccharopine dehydrogenase  63.54 
 
 		 401 aa  548  1e-155  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.69447  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4440  saccharopine dehydrogenase  66.67 
 
 		 401 aa  549  1e-155  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0285  saccharopine dehydrogenase  63.8 
 
 		 404 aa  547  1e-154  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0186  saccharopine dehydrogenase  63.29 
 
 		 401 aa  545  1e-154  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0165  saccharopine dehydrogenase  63.29 
 
 		 401 aa  546  1e-154  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  65.9 
 
 		 405 aa  542  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1181  saccharopine dehydrogenase  63.54 
 
 		 394 aa  543  1e-153  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.886294  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0748  saccharopine dehydrogenase  64.3 
 
 		 400 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0677  saccharopine dehydrogenase  63.68 
 
 		 397 aa  540  9.999999999999999e-153  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.10466 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03351  Carboxynorspermidine dehydrogenase  64.05 
 
 		 400 aa  536  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00142848  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1081  saccharopine dehydrogenase  62.28 
 
 		 399 aa  527  1e-148  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706576  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0999  saccharopine dehydrogenase  63.2 
 
 		 405 aa  526  1e-148  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0445398  hitchhiker  0.00533099 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003102  carboxynorspermidine dehydrogenase putative  47.51 
 
 		 414 aa  384  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02740  hypothetical protein  47.26 
 
 		 417 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1231  hypothetical protein  45.02 
 
 		 414 aa  365  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00001292  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2137  saccharopine dehydrogenase  44.42 
 
 		 414 aa  364  1e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0299628  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2289  saccharopine dehydrogenase  45.66 
 
 		 405 aa  361  1e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.772575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5844  hypothetical protein  42.68 
 
 		 413 aa  335  5.999999999999999e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1380  saccharopine dehydrogenase  42.07 
 
 		 412 aa  334  1e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000104449  normal  0.291708 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4157  saccharopine dehydrogenase  41.41 
 
 		 413 aa  328  7e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.83779 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0352  hypothetical protein  41.41 
 
 		 413 aa  325  1e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0335  hypothetical protein  41.16 
 
 		 413 aa  321  9.999999999999999e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0438  saccharopine dehydrogenase  40.66 
 
 		 426 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0417875  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2884  saccharopine dehydrogenase  41.5 
 
 		 412 aa  319  5e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0988  saccharopine dehydrogenase  40.91 
 
 		 413 aa  317  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000577497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2928  saccharopine dehydrogenase  39.9 
 
 		 414 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2764  saccharopine dehydrogenase  39.9 
 
 		 414 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0028  saccharopine dehydrogenase  40.15 
 
 		 412 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1475  saccharopine dehydrogenase family protein  41.35 
 
 		 412 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0126  saccharopine dehydrogenase  41.35 
 
 		 412 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.281282 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0914  putative saccharopine dehydrogenase family protein  39.8 
 
 		 424 aa  302  8.000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.867111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1715  saccharopine dehydrogenase  40.85 
 
 		 422 aa  301  2e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000659439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1501  saccharopine dehydrogenase  39.55 
 
 		 424 aa  300  4e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2125  saccharopine dehydrogenase  38.7 
 
 		 399 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2844  saccharopine dehydrogenase  38.44 
 
 		 399 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241943 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2955  saccharopine dehydrogenase  41.23 
 
 		 407 aa  296  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  33.75 
 
 		 408 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3221  saccharopine dehydrogenase  32.04 
 
 		 407 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3295  Saccharopine dehydrogenase  32.38 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.886794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5034  saccharopine dehydrogenase  31.3 
 
 		 407 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4946  saccharopine dehydrogenase  31.3 
 
 		 407 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5327  saccharopine dehydrogenase  31.05 
 
 		 407 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4677  Saccharopine dehydrogenase  32 
 
 		 401 aa  177  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  24.11 
 
 		 398 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  25.37 
 
 		 415 aa  99.8  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  23.75 
 
 		 367 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  23.81 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  21.05 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1941  Saccharopine dehydrogenase  26.52 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  24.15 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  24.83 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  23.62 
 
 		 350 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  21.68 
 
 		 748 aa  58.2  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  26.6 
 
 		 376 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  21.65 
 
 		 384 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  25.38 
 
 		 360 aa  51.6  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1219  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  20.94 
 
 		 394 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.182404  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  23.77 
 
 		 454 aa  50.8  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1441  hypothetical protein  24.55 
 
 		 394 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1242  saccharopine dehydrogenase  24.12 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1342  hypothetical protein  23.95 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1217  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  23.95 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1416  hypothetical protein  23.95 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.572078 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1241  hypothetical protein  23.95 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  21.97 
 
 		 369 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1424  potassium efflux system protein  30.63 
 
 		 371 aa  47.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1482  hypothetical protein  23.95 
 
 		 394 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5762  Saccharopine dehydrogenase  26.88 
 
 		 355 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3965  hypothetical protein  22.3 
 
 		 394 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2986  saccharopine dehydrogenase  35.48 
 
 		 365 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2027  saccharopine dehydrogenase  25.42 
 
 		 351 aa  43.5  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0488088  normal  0.664425 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>