259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1772 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1772  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  467  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236777  normal  0.415522 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0875  protein of unknown function DUF45  37.22 
 
 
240 aa  132  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1535  hypothetical protein  35.65 
 
 
238 aa  123  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.714061 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0073  protein of unknown function DUF45  34.07 
 
 
316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.658711 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1561  zinc protease, putative  30.71 
 
 
244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2267  hypothetical protein  37.04 
 
 
217 aa  116  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.083076  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0661  zinc protease, putative  33.33 
 
 
243 aa  113  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.792264  normal  0.0577046 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2732  hypothetical protein  32.37 
 
 
240 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0904  hypothetical protein  30.74 
 
 
251 aa  108  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1661  protein of unknown function DUF45  35.81 
 
 
244 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.843742  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0788  protein of unknown function DUF45  31 
 
 
241 aa  106  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2109  protein of unknown function DUF45  30.74 
 
 
249 aa  103  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1657  protein of unknown function DUF45  31.03 
 
 
244 aa  103  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1381  protein of unknown function DUF45  32.58 
 
 
229 aa  103  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.263783  normal  0.318048 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  33.04 
 
 
241 aa  95.9  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  28.19 
 
 
242 aa  87  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  23.94 
 
 
243 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4201  protein of unknown function DUF45  29.58 
 
 
245 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  32.49 
 
 
233 aa  83.2  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  30.37 
 
 
240 aa  82.4  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  27.4 
 
 
252 aa  82  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  26.7 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0448  hypothetical protein  29.44 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  30.35 
 
 
239 aa  80.1  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  28.92 
 
 
251 aa  80.1  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3363  hypothetical protein  27.85 
 
 
249 aa  79.3  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  25.98 
 
 
227 aa  79  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0018  hypothetical protein  26.96 
 
 
254 aa  79  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4173  hypothetical protein  28.97 
 
 
303 aa  78.6  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  27.27 
 
 
301 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  28.17 
 
 
240 aa  78.2  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  26.04 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  27.5 
 
 
253 aa  77  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  27.67 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  29.86 
 
 
300 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  27.5 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  30 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  23.04 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  29.13 
 
 
228 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  28.71 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4199  hypothetical protein  28.69 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2166  hypothetical protein  30.17 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  32.17 
 
 
308 aa  75.9  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4740  protein of unknown function DUF45  37.61 
 
 
318 aa  75.1  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1069  hypothetical protein  24.87 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.887273  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  29.76 
 
 
242 aa  75.1  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  28.57 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  24.87 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  28.17 
 
 
240 aa  74.3  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  23.9 
 
 
226 aa  73.9  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0723  hypothetical protein  27.84 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.835761  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  29.91 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  27.62 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  27.62 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1049  hypothetical protein  26.11 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  27.8 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2293  hypothetical protein  30.92 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  28.91 
 
 
288 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  27.14 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  26.7 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  26.7 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  19.44 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  28.37 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  28.37 
 
 
292 aa  72  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  22.57 
 
 
251 aa  71.6  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  25.59 
 
 
238 aa  71.6  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0079  zinc metalloprotease  27.5 
 
 
230 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0200194  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  26.67 
 
 
316 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0401  hypothetical protein  25.5 
 
 
233 aa  71.2  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  26.19 
 
 
251 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  28.5 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0212  hypothetical protein  28.07 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  30.14 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  26.67 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  25.76 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  28.1 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  28.04 
 
 
245 aa  69.3  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  26.89 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2818  hypothetical protein  28.65 
 
 
240 aa  68.9  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608131  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2928  hypothetical protein  26.74 
 
 
219 aa  68.9  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0649  hypothetical protein  25.36 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  26.67 
 
 
222 aa  68.2  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0807  hypothetical protein  26.13 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  23.15 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  24.87 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  28.85 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2977  hypothetical protein  30.14 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0331949 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  23.41 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  31.44 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3692  hypothetical protein  34.19 
 
 
314 aa  66.6  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1260  hypothetical protein  27.45 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.017504 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  23.67 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  27.45 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  25.87 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl659  zinc metalloprotease  23.5 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  26.7 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  25.96 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  27.18 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0547  protein of unknown function DUF45  29.91 
 
 
306 aa  65.5  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0531  hypothetical protein  29.91 
 
 
306 aa  65.5  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.10161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>