More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2700 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2700  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
584 aa  1193    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00534164 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2749  protein of unknown function DUF268  45.24 
 
 
261 aa  220  7e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2878  hypothetical protein  54.5 
 
 
256 aa  201  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0648  protein of unknown function DUF268  38.86 
 
 
250 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  33.78 
 
 
386 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  33.01 
 
 
380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  33.5 
 
 
326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0938  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 
317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 
318 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 
326 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.93 
 
 
326 aa  109  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
357 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.78 
 
 
326 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  34.47 
 
 
302 aa  107  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  33.01 
 
 
326 aa  106  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 
299 aa  104  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  33.51 
 
 
305 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
316 aa  103  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  31.79 
 
 
1035 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  29.34 
 
 
373 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  32.11 
 
 
321 aa  102  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  31.44 
 
 
397 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  27.12 
 
 
374 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 
330 aa  99.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  34.13 
 
 
325 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 
310 aa  100  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  34.5 
 
 
289 aa  99.8  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  31.75 
 
 
310 aa  99.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  31.22 
 
 
341 aa  99  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  28.73 
 
 
307 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  27.18 
 
 
306 aa  98.2  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  25.09 
 
 
398 aa  97.8  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  30.15 
 
 
344 aa  97.4  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.14 
 
 
295 aa  95.9  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.22 
 
 
312 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4231  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 
360 aa  95.1  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
344 aa  93.6  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 
581 aa  93.6  9e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  26 
 
 
318 aa  93.6  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2822  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 
317 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
305 aa  92.8  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 
235 aa  93.6  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1309  glycosyl transferase family 2  32.42 
 
 
272 aa  93.2  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  29.8 
 
 
362 aa  92.4  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 
308 aa  92.8  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 
294 aa  92.8  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  31.39 
 
 
390 aa  92  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2345  glycosyl transferase family protein  34.41 
 
 
323 aa  92  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.92 
 
 
312 aa  91.3  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
300 aa  91.3  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 
324 aa  90.9  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 
277 aa  90.9  6e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 
331 aa  90.5  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 
230 aa  90.1  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 
337 aa  90.1  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  29.22 
 
 
672 aa  89  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  26.03 
 
 
244 aa  89  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  27.87 
 
 
379 aa  89  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  35.43 
 
 
250 aa  88.6  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.36 
 
 
310 aa  88.2  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 
235 aa  88.2  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3090  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
310 aa  87.4  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.933883  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 
280 aa  87.4  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2974  WbdN  32.37 
 
 
260 aa  87.4  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0521919  hitchhiker  0.0000000316715 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  28.29 
 
 
352 aa  87  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
337 aa  86.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  29.29 
 
 
335 aa  86.7  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  29.85 
 
 
326 aa  86.3  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 
349 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
276 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  28.84 
 
 
544 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  28.22 
 
 
317 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3305  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 
342 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
314 aa  85.9  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1092  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 
333 aa  85.9  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  34.48 
 
 
325 aa  85.9  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  24.23 
 
 
333 aa  85.1  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  43 
 
 
319 aa  85.1  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1912  glycosyl transferase family 2  26.84 
 
 
342 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  26.38 
 
 
363 aa  85.1  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.8 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  29.87 
 
 
320 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2486  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.23 
 
 
321 aa  84  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1130  glycosyl transferase family 2  33.74 
 
 
332 aa  84  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2017  glycosyl transferase family 2  41.44 
 
 
324 aa  83.6  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000864394 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  27.67 
 
 
233 aa  83.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 
347 aa  83.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1730  glycosyl transferase family 2  28.35 
 
 
326 aa  83.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5016  glycosyl transferase family 2  28.02 
 
 
330 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.623026  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3698  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.19 
 
 
327 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  29.24 
 
 
333 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1379  glycosyl transferase family protein  33.14 
 
 
297 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.264212  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  27.75 
 
 
311 aa  83.2  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  24 
 
 
466 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0860  b-glycosyltransferase  28.09 
 
 
314 aa  82.4  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0642732 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2672  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.650455  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>