99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1225 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1225  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 301 aa  613  9.999999999999999e-175  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2282  radical SAM domain-containing protein  52.03 
 
 		 313 aa  333  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1956  Radical SAM domain protein  54.08 
 
 		 301 aa  330  2e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1072  radical SAM domain-containing protein  49.83 
 
 		 306 aa  318  7e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1372  radical SAM domain-containing protein  53.17 
 
 		 298 aa  315  5e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1696  radical SAM domain-containing protein  46.78 
 
 		 336 aa  312  4.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4174  radical SAM domain-containing protein  47.44 
 
 		 305 aa  311  5.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000899263  hitchhiker  0.0000122101 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1488  Radical SAM domain protein  50 
 
 		 323 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4313  radical SAM domain-containing protein  47.46 
 
 		 305 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3220  radical SAM family protein  48.66 
 
 		 312 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0910246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1667  radical SAM domain-containing protein  46 
 
 		 312 aa  297  1e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1772  radical SAM family protein  46.96 
 
 		 300 aa  296  3e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138508  normal  0.113699 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1745  Radical SAM domain protein  48.47 
 
 		 303 aa  293  2e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0609211 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1790  Radical SAM domain protein  45.74 
 
 		 307 aa  293  3e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1274  radical SAM domain-containing protein  46.96 
 
 		 319 aa  292  4e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330948  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1859  radical SAM domain-containing protein  45.27 
 
 		 300 aa  285  8e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.54951  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1179  radical SAM domain-containing protein  46.53 
 
 		 334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0438654  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1076  Radical SAM domain protein  44.52 
 
 		 327 aa  280  2e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2082  radical SAM  45.27 
 
 		 308 aa  280  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1368  radical SAM domain-containing protein  45.21 
 
 		 334 aa  280  3e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0299345  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1149  radical SAM domain protein  44.22 
 
 		 334 aa  272  4.0000000000000004e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000033704  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2526  radical SAM domain-containing protein  43.62 
 
 		 318 aa  271  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.252975  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0616  radical SAM domain-containing protein  44.09 
 
 		 296 aa  268  8e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1289  radical SAM domain-containing protein  48.15 
 
 		 298 aa  266  4e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1949  radical SAM domain-containing protein  43.23 
 
 		 319 aa  261  1e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3427  radical SAM domain-containing protein  45.68 
 
 		 313 aa  260  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0110  Radical SAM domain protein  46.35 
 
 		 296 aa  259  3e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.389889  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1899  Radical SAM domain protein  45.61 
 
 		 309 aa  257  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.735258  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0368  radical SAM family protein  44.32 
 
 		 315 aa  255  6e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000743683  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1251  radical SAM domain-containing protein  48.03 
 
 		 303 aa  254  9e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269935  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1947  Radical SAM domain protein  46.24 
 
 		 283 aa  254  9e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1063  radical SAM domain-containing protein  47.67 
 
 		 303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2309  Radical SAM domain protein  45.12 
 
 		 302 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0838  radical SAM domain-containing protein  45.83 
 
 		 320 aa  248  1e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0815  radical SAM domain-containing protein  45.83 
 
 		 320 aa  248  1e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0883393  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07611  pyruvate formate lyase activating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15630)  40.51 
 
 		 373 aa  244  9e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00159546  normal  0.16163 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0003  radical SAM domain-containing protein  45.32 
 
 		 286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0003  radical SAM domain-containing protein  45.32 
 
 		 286 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0661  Radical SAM domain protein  43.57 
 
 		 320 aa  242  5e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2121  radical SAM domain-containing protein  43.62 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152404  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1143  radical SAM domain-containing protein  45.22 
 
 		 287 aa  226  4e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0526  Radical SAM domain protein  41.3 
 
 		 344 aa  220  1.9999999999999999e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0095894  unclonable  0.0000000400012 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  35.87 
 
 		 293 aa  206  4e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206983 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1152  Radical SAM domain protein  34.02 
 
 		 321 aa  202  5e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.429756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1701  radical SAM domain-containing protein  42.11 
 
 		 295 aa  202  7e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2506  radical SAM domain-containing protein  38.2 
 
 		 331 aa  186  4e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000358558  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  32.53 
 
 		 326 aa  169  5e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0210847  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0826  radical SAM domain-containing protein  34.88 
 
 		 373 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1947  radical SAM domain-containing protein  35.37 
 
 		 372 aa  159  4e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0925  radical SAM domain-containing protein  33.68 
 
 		 355 aa  155  7e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0881  radical SAM domain-containing protein  33.22 
 
 		 374 aa  154  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.607875  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1370  radical SAM domain-containing protein  34.03 
 
 		 373 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3602  formate acetyltransferase activating enzyme  31.38 
 
 		 345 aa  149  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.795374  normal  0.163348 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0987  radical SAM domain-containing protein  32.43 
 
 		 371 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0093  Radical SAM domain protein  25.76 
 
 		 356 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0103  Radical SAM domain protein  25.6 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2213  radical SAM domain-containing protein  24.47 
 
 		 367 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  24.64 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0086  radical SAM family protein  25 
 
 		 356 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 		 348 aa  52.8  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2430  radical SAM domain-containing protein  24.56 
 
 		 365 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0451112 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  25.88 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  25.43 
 
 		 339 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0217  radical SAM domain-containing protein  24.83 
 
 		 356 aa  52  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  24.46 
 
 		 372 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  24.07 
 
 		 337 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  23.99 
 
 		 337 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5878  Radical SAM domain protein  22.85 
 
 		 362 aa  49.7  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0206709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  22.79 
 
 		 342 aa  48.9  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  26.72 
 
 		 333 aa  48.5  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  24.26 
 
 		 333 aa  48.1  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1460  radical SAM domain-containing protein  25.61 
 
 		 332 aa  47.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0449  radical SAM family protein  22.97 
 
 		 370 aa  48.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355453  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  23.89 
 
 		 353 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0270  radical SAM domain-containing protein  25.68 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  22.74 
 
 		 339 aa  47  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1325  radical SAM domain-containing protein  27.62 
 
 		 365 aa  47  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.322233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2551  pyruvate formate-lyase activating enzyme-like protein  23.84 
 
 		 354 aa  46.6  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592966  normal  0.73651 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0917  Radical SAM domain protein  23.13 
 
 		 324 aa  46.6  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2555  Radical SAM domain protein  25.51 
 
 		 366 aa  46.2  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466932  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6305  Radical SAM domain-containing protein  26.22 
 
 		 388 aa  45.8  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1963  Radical SAM domain protein  24.09 
 
 		 334 aa  45.8  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0105086  decreased coverage  0.00565461 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0629  Radical SAM domain protein  28.89 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000217214  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2854  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2539  Radical SAM domain protein  23.2 
 
 		 360 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1841  Radical SAM domain protein  23.48 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2217  Radical SAM domain protein  23.29 
 
 		 374 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1995  radical SAM domain-containing protein  24.92 
 
 		 405 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  24.83 
 
 		 376 aa  44.3  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2684  Radical SAM domain protein  23.05 
 
 		 367 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307935  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1172  hypothetical protein  24.89 
 
 		 358 aa  43.5  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0922  radical SAM domain-containing protein  26.01 
 
 		 333 aa  43.1  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  23.9 
 
 		 344 aa  43.5  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1999  radical SAM domain-containing protein  24.07 
 
 		 351 aa  43.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.156539  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2402  radical SAM domain-containing protein  25.21 
 
 		 297 aa  42.7  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  23.83 
 
 		 282 aa  42.7  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0932  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 362 aa  42.7  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1178  hypothetical protein  24.89 
 
 		 358 aa  42.4  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1849  radical SAM family protein  28.02 
 
 		 329 aa  42.4  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>