More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3796 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  100 
 
 
323 aa  654    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  54.72 
 
 
312 aa  333  3e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  46.77 
 
 
315 aa  288  7e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  48.04 
 
 
326 aa  286  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  46.96 
 
 
312 aa  286  4e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  46.96 
 
 
311 aa  285  5e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  47.08 
 
 
310 aa  285  5.999999999999999e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  48.86 
 
 
306 aa  285  7e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  46.01 
 
 
339 aa  283  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  46.75 
 
 
310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  45.71 
 
 
328 aa  280  2e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  46.25 
 
 
332 aa  279  4e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1117  ABC transporter related  49.84 
 
 
317 aa  278  7e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1802  ABC transporter related  47.54 
 
 
340 aa  278  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.42 
 
 
317 aa  276  3e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  45.45 
 
 
305 aa  271  1e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3306  ABC transporter related  45.42 
 
 
302 aa  271  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  46.69 
 
 
322 aa  270  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  47.35 
 
 
293 aa  271  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  47.25 
 
 
303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  44.63 
 
 
309 aa  261  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  44.63 
 
 
309 aa  261  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  44.37 
 
 
310 aa  260  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4128  ABC transporter related protein  44.09 
 
 
313 aa  256  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  hitchhiker  0.00834769 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  46.53 
 
 
345 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0667  ABC transporter related  43.04 
 
 
307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.201988 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  42.19 
 
 
314 aa  251  9.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  44.23 
 
 
309 aa  251  1e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  45.03 
 
 
355 aa  250  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  43.19 
 
 
304 aa  249  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  43.19 
 
 
304 aa  248  7e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  43.71 
 
 
311 aa  248  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  44.37 
 
 
321 aa  247  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  42.67 
 
 
311 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  42.16 
 
 
303 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  44.52 
 
 
304 aa  246  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4919  nodulation factor exporter subunit NodI  45 
 
 
342 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  43 
 
 
304 aa  245  6e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  44 
 
 
306 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  43.29 
 
 
351 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  42.76 
 
 
304 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  43.33 
 
 
344 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  42.43 
 
 
373 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  44 
 
 
304 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  44 
 
 
304 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  44 
 
 
304 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  43.29 
 
 
351 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  44.19 
 
 
304 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0277  ABC-2 type transporter ATPase  43.52 
 
 
301 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.449682  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  44.03 
 
 
320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  42.76 
 
 
304 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  42.76 
 
 
304 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  42.95 
 
 
326 aa  242  7e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  44.04 
 
 
320 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  42.95 
 
 
304 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1092  ABC transporter related  43.81 
 
 
310 aa  241  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.291374  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  44.16 
 
 
320 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  42.33 
 
 
308 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  40.19 
 
 
305 aa  239  5e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2295  nodulation ABC transporter NodI  41.72 
 
 
325 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3558  ABC transporter related  40.32 
 
 
307 aa  233  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0440586  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0389  ABC transporter related  43.05 
 
 
305 aa  233  3e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1144  ABC transporter related  40.58 
 
 
312 aa  232  5e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2475  nodulation ABC transporter NodI  43.19 
 
 
304 aa  229  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  38.92 
 
 
327 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0410  nodulation ATP-binding protein I  43.05 
 
 
305 aa  224  1e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3573  ABC transporter related  39.24 
 
 
313 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_353  ABC-2 type transport system, ATP-binding protein  41.39 
 
 
305 aa  223  4e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.761814  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0633  ABC transporter related  37.85 
 
 
314 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  39.03 
 
 
310 aa  220  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3711  ABC transporter related  38.77 
 
 
323 aa  219  5e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  41.8 
 
 
310 aa  218  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  37.66 
 
 
310 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4259  ABC transporter-related protein  38.59 
 
 
315 aa  208  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  40.2 
 
 
304 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0461  ABC-type multidrug transport system ATPase component  38.11 
 
 
320 aa  206  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.22 
 
 
308 aa  206  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.22 
 
 
308 aa  206  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516397  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.54 
 
 
308 aa  205  7e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.24 
 
 
308 aa  204  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  38.94 
 
 
309 aa  202  7e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  38.49 
 
 
308 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0452  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.6 
 
 
309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000639628  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.52 
 
 
411 aa  200  3e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.38 
 
 
279 aa  200  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.74 
 
 
323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54604  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.06 
 
 
327 aa  199  6e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  39 
 
 
283 aa  199  7e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.53 
 
 
343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.03 
 
 
324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0010745  normal  0.559357 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  37.74 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2715  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.31 
 
 
322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.832052 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0120  ABC transporter, ATP-binding protein  40.13 
 
 
305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.695477  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  37.74 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.44 
 
 
327 aa  196  3e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.06 
 
 
333 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.18 
 
 
319 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4649  ABC transporter related protein  36.66 
 
 
300 aa  195  8.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14569  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  37.92 
 
 
304 aa  195  8.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  39.03 
 
 
319 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>