More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1314 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
301 aa  616  1e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.97 
 
 
296 aa  285  5e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.53 
 
 
308 aa  232  6e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.04 
 
 
302 aa  229  4e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219396  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  38.38 
 
 
302 aa  228  8e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1324  hypothetical protein  38.21 
 
 
302 aa  211  1e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000450557  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.64 
 
 
294 aa  201  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.62 
 
 
298 aa  169  5e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.58 
 
 
295 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.93 
 
 
291 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.26 
 
 
309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.760567  normal  0.885082 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 
298 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.33 
 
 
306 aa  162  6e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.97 
 
 
326 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.79 
 
 
296 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 
309 aa  161  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.13 
 
 
295 aa  161  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 
299 aa  160  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.932671  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.97 
 
 
326 aa  158  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.46 
 
 
294 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0385  NADH dehydrogenase subunit, putative  35.71 
 
 
294 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.56 
 
 
294 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1308  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  34.27 
 
 
336 aa  150  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 
306 aa  143  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 
321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.22 
 
 
309 aa  139  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3538  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  32.97 
 
 
326 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.33 
 
 
321 aa  139  6e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  normal  0.481083 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  32.31 
 
 
297 aa  139  7.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3602  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.32 
 
 
323 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.692612  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1041  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  29.89 
 
 
328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0980  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase  29.89 
 
 
328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0107  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.52 
 
 
308 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.18 
 
 
328 aa  134  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2820  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.75 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0203208  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1691  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  29.14 
 
 
328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0053937  hitchhiker  0.000000612217 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.45 
 
 
306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.92 
 
 
381 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0755  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  33.73 
 
 
389 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0016  3-beta-hydroxy-delta(5)-steroid dehydrogenase  27.59 
 
 
340 aa  130  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3590  ubiquinone dependent NADH dehydrogenase  26.43 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885976  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.56 
 
 
318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.826321  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1353  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.96 
 
 
332 aa  124  1e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2776  NADH dehydrogenase  27.37 
 
 
328 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.424947  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0343  NADH-ubiquinone oxidoreductase  31.54 
 
 
325 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00306764  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1151  NADH-ubiquinone oxidoreductase  27.37 
 
 
328 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2812  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.37 
 
 
328 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.626398  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1007  NADH dehydrogenase  33.33 
 
 
389 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4953  NADH dehydrogenase  27.8 
 
 
318 aa  123  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575257  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0437  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.86 
 
 
349 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0063  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase,-like protein  29.39 
 
 
320 aa  122  8e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.42 
 
 
322 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.922509  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1129  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  27.88 
 
 
316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0046  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  29.39 
 
 
321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0246  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.37 
 
 
327 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0152  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  33.76 
 
 
335 aa  120  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1049  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  32.08 
 
 
412 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.97 
 
 
353 aa  119  6e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2240  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  31.95 
 
 
381 aa  119  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167528  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1318  NADH dehydrogenase  31.75 
 
 
389 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0224  hypothetical protein  29.26 
 
 
322 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.362913  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1668  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  30.52 
 
 
316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0199  hypothetical protein  28.9 
 
 
317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980999  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
287 aa  117  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000016396  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0660  dehydrogenase  30.58 
 
 
321 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3737  NADH dehydrogenase  28.57 
 
 
317 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.288709  normal  0.886457 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0035  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putativ  26.88 
 
 
320 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.44 
 
 
512 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.074322  normal  0.90269 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 
330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0173  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.5 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3910  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.835741  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1068  NmrA family protein  33.48 
 
 
311 aa  113  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.746478  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.47 
 
 
320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.35 
 
 
320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3052  NADH dehydrogenase  29.83 
 
 
319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0275567 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1265  hypothetical protein  27.57 
 
 
432 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0386  NADH-ubiquinone oxidoreductase family protein  25.34 
 
 
340 aa  108  1e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2399  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 
327 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131768  normal  0.0846691 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 
319 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 
319 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.65 
 
 
301 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 
307 aa  107  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.07 
 
 
289 aa  107  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.257288 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2944  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  29.49 
 
 
319 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.44 
 
 
314 aa  107  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1264  hypothetical protein  26.91 
 
 
432 aa  106  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.34 
 
 
319 aa  106  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851831  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2769  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 
318 aa  105  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2361  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.41 
 
 
345 aa  105  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.252137 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.91 
 
 
338 aa  105  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.89 
 
 
318 aa  105  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0963  male sterility protein  29.91 
 
 
338 aa  105  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.47 
 
 
321 aa  105  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.84 
 
 
318 aa  105  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02430  conserved hypothetical protein  29.59 
 
 
375 aa  104  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000237678  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.52 
 
 
319 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.563899 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 
319 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.3 
 
 
450 aa  103  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.892104 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 
320 aa  102  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.665439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>