More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1773 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1773  putative metalloprotease  100 
 
 		 230 aa  461  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.480116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0890  peptidase M48, Ste24p  70.35 
 
 		 228 aa  319  3e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397549  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2687  peptidase M48, Ste24p  66.81 
 
 		 232 aa  303  2.0000000000000002e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1185  peptidase M48, Ste24p  68.72 
 
 		 228 aa  293  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.126393  normal  0.840759 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2649  putative Zn-dependent protease  66.08 
 
 		 228 aa  274  9e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.157554  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1306  peptidase M48, Ste24p  66.52 
 
 		 228 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.278651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3987  peptidase M48, Ste24p  58.85 
 
 		 228 aa  247  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3239  peptidase M48, Ste24p  28.92 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3315  peptidase M48, Ste24p  28.92 
 
 		 252 aa  78.6  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2378  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 		 640 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  32.99 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02766  predicted peptidase  28.92 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0758  peptidase M48 Ste24p  28.92 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  32.83 
 
 		 478 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2400  peptidase M48, Ste24p  28.5 
 
 		 550 aa  75.9  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0992443  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  29.95 
 
 		 524 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0183  peptidase M48 Ste24p  28.78 
 
 		 632 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.457604 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  31.33 
 
 		 289 aa  75.1  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4238  peptidase, M48B family  28.43 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3094  M48B family peptidase  28.43 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0775  peptidase M48 Ste24p  28.43 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0200008 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3270  M48B family peptidase  28.43 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3369  peptidase, M48B family  28.43 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.433794  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0188  peptidase M48 Ste24p  30.95 
 
 		 632 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3078  M48B family peptidase  28.43 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267563 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0849  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.322576  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0517  peptidase M48, Ste24p  30.3 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  28.94 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0845  M48 family peptidase  28.57 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3351  M48 family peptidase  28.57 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4490  peptidase M48 Ste24p  34.01 
 
 		 494 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  32.83 
 
 		 487 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  29.95 
 
 		 493 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  32.83 
 
 		 500 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  25.78 
 
 		 604 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  33.13 
 
 		 494 aa  72.4  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  26.92 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3955  peptidase M48 Ste24p  32.08 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1092  peptidase M48, Ste24p  25.7 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000219795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1012  peptidase M48, Ste24p  25.7 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.453448  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  29.94 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1077  peptidase M48, Ste24p  25.7 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.12014 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  26.02 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2706  peptidase M48, Ste24p  31.74 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.268844  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1044  peptidase M48, Ste24p  25.7 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330667  normal  0.397377 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0985  peptidase M48, Ste24p  25.7 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00562813  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  30.51 
 
 		 489 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  27.86 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  27.32 
 
 		 278 aa  67  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  30.54 
 
 		 274 aa  67  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2756  peptidase M48, Ste24p  32.22 
 
 		 354 aa  67  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03610  putative putative Zn-dependent protease with chaperone function  29.41 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00852154  hitchhiker  0.000000000112328 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5407  peptidase M48 Ste24p  27.57 
 
 		 489 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  30.65 
 
 		 489 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0353  putative lipoprotein  29.41 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  28.92 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  27.88 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  29.29 
 
 		 489 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0552  peptidase M48, Ste24p  28.57 
 
 		 497 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125277  normal  0.0387817 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  27.71 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7542  hypothetical protein  27.55 
 
 		 488 aa  65.5  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  26.7 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000410475  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3704  peptidase M48 Ste24p  29.61 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  30.18 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  29.65 
 
 		 504 aa  65.1  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  33.73 
 
 		 292 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0218  peptidase M48 Ste24p  31.71 
 
 		 311 aa  65.1  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0550  peptidase M48, Ste24p  27.55 
 
 		 503 aa  65.1  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00913  predicted peptidase with chaperone function  29.56 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.297471  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  27.88 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1015  M48B family peptidase  29.56 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261576  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2211  M48B family peptidase  29.56 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000159617  normal  0.373836 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  29.34 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0130  peptidase M48, Ste24p  26.74 
 
 		 528 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2687  peptidase M48 Ste24p  29.56 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  0.800439 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2419  peptidase, M48B family  29.56 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000823036  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  31.06 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1070  peptidase, M48B family  29.56 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000805539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  27.88 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00920  hypothetical protein  29.56 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.297268  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1006  M48B family peptidase  29.56 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612622  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  30.49 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0203  peptidase M48, Ste24p  31.71 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  34.32 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  33.12 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0277  peptidase M48, Ste24p  27.32 
 
 		 497 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3342  peptidase M48, Ste24p  28.08 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.887566  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  28.11 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1699  putative peptidase  27.83 
 
 		 475 aa  63.2  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00848357  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  33.94 
 
 		 561 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  28.51 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0264  peptidase M48 Ste24p  28.05 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197309  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2734  peptidase M48 Ste24p  29.06 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015723  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  32.16 
 
 		 567 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  29.38 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  33.54 
 
 		 483 aa  62.4  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  27.33 
 
 		 268 aa  62  0.000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0280  peptidase M48, Ste24p  28.22 
 
 		 284 aa  62  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1761  peptidase, putative  27.39 
 
 		 493 aa  61.6  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0448124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>