217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0031 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_0031  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  100 
 
 
337 aa  651    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249261 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2642  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  61.03 
 
 
333 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0399  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  61.52 
 
 
328 aa  379  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1462  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  69 
 
 
332 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.75413  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2094  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  64.94 
 
 
329 aa  360  3e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.234939  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0113  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  68.39 
 
 
332 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.182493 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0060  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  68.09 
 
 
332 aa  343  4e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.27983 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0582  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  51.96 
 
 
331 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.576283  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3195  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  52.08 
 
 
327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0542977  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2969  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  52.08 
 
 
327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174646  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2555  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.21 
 
 
337 aa  259  6e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.314091  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3177  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  50.5 
 
 
335 aa  251  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.170039  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3151  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  49.85 
 
 
327 aa  247  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.669426  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1856  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.4 
 
 
338 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.287805  hitchhiker  0.00236278 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1692  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.71 
 
 
345 aa  239  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4542  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.06 
 
 
335 aa  238  8e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.187603 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0888  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  50.62 
 
 
326 aa  238  9e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0160282 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0632  lipid-A-disaccharide synthase  47.85 
 
 
341 aa  231  9e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.11111 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4108  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.48 
 
 
338 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7565  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  49.84 
 
 
337 aa  225  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0624  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.85 
 
 
342 aa  222  6e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1350  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.57 
 
 
340 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.271516  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3121  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  49.56 
 
 
327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4704  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.19 
 
 
343 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.321555  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0196  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.11 
 
 
341 aa  212  5.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0216  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.11 
 
 
341 aa  212  5.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716971  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3047  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.7 
 
 
341 aa  209  7e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0897  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.05 
 
 
345 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1481  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.97 
 
 
343 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6829  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  51.88 
 
 
332 aa  199  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0650  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.45 
 
 
315 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0534  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.54 
 
 
347 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.506816  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0490  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.88 
 
 
357 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0439  lipid-A-disaccharide synthase  40.92 
 
 
343 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422513  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0426  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.46 
 
 
346 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.951399 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1203  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.2 
 
 
339 aa  178  1e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.603805  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1261  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.79 
 
 
357 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2583  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40 
 
 
335 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2801  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.48 
 
 
335 aa  162  9e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1669  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.07 
 
 
339 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2421  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.18 
 
 
335 aa  159  7e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2491  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.18 
 
 
335 aa  159  9e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1706  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.97 
 
 
339 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.944594  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2347  lipid-A-disaccharide synthase  39.17 
 
 
355 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1684  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.97 
 
 
339 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2673  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.97 
 
 
335 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112968  normal  0.034202 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3228  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.22 
 
 
360 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.95 
 
 
361 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1399  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.17 
 
 
339 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1245  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.14 
 
 
327 aa  153  5e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0682  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.69 
 
 
369 aa  151  2e-35  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00304258  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40 
 
 
331 aa  149  7e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2205  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.28 
 
 
328 aa  149  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0766314  normal  0.274166 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2681  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.39 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.429333 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1022  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.39 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0136979  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1013  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.39 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00336563  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1076  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.28 
 
 
328 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0122696  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1820  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.31 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.118843  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00919  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.39 
 
 
328 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.226306  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2728  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.39 
 
 
328 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003986  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.86 
 
 
335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0848  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.64 
 
 
348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2198  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.25 
 
 
331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00926  hypothetical protein  36.39 
 
 
328 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3412  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.94 
 
 
375 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.34 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1468  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.16 
 
 
336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2258  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.67 
 
 
353 aa  147  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01536  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.55 
 
 
335 aa  147  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1558  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.69 
 
 
337 aa  147  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.88408  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3208  lipid-A-disaccharide synthase  40.67 
 
 
333 aa  146  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000403525  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2409  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.08 
 
 
328 aa  146  6e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47014  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2387  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.68 
 
 
335 aa  146  6e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.624248  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1639  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.68 
 
 
338 aa  143  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.17 
 
 
360 aa  143  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0734  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.14 
 
 
335 aa  142  7e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1587  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.74 
 
 
330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1727  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.36 
 
 
340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.159463  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2089  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.45 
 
 
335 aa  140  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000632162  normal  0.521337 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3814  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.92 
 
 
333 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0872881  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.32 
 
 
325 aa  139  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.436451  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1083  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.02 
 
 
325 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.125044 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1770  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.79 
 
 
333 aa  139  8.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2825  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.33 
 
 
337 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0571094 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1900  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.58 
 
 
334 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000723906 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1050  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.02 
 
 
325 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.212598 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2401  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.02 
 
 
349 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297195  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1018  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.02 
 
 
325 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.799043 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0991  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.02 
 
 
325 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0656  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.98 
 
 
331 aa  137  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0633  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.47 
 
 
336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.368441  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2180  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.64 
 
 
332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1511  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.8 
 
 
336 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0535  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.33 
 
 
372 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000711701  hitchhiker  0.0000117935 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1099  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.7 
 
 
325 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1063  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.74 
 
 
372 aa  135  7.000000000000001e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1394  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.2 
 
 
375 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000899686 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01857  tetraacyldisaccharide 4-kinase  36.48 
 
 
349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223866  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2059  lipid-A-disaccharide synthase  36.66 
 
 
361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.46452 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1476  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.8 
 
 
333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114547  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>