More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0915 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0915  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
140 aa  279  8e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.574244  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.68 
 
 
148 aa  100  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.492419 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  31.16 
 
 
152 aa  77.4  6e-14  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0684  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.85 
 
 
154 aa  73.9  7e-13  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508331  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1656  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.58 
 
 
142 aa  71.6  3e-12  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.310193  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1369  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
133 aa  70.9  6e-12  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.88 
 
 
137 aa  67.8  4e-11  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.58 
 
 
131 aa  67.4  6e-11  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.376121  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1618  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.05 
 
 
136 aa  67.4  6e-11  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272583  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.89 
 
 
140 aa  67  7e-11  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.6 
 
 
147 aa  67  8e-11  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.67 
 
 
140 aa  66.6  9e-11  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.89 
 
 
144 aa  66.2  1e-10  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1730  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.82 
 
 
132 aa  66.6  1e-10  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0560  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.41 
 
 
137 aa  65.9  2e-10  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.326497 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.82 
 
 
141 aa  65.5  2e-10  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3522  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.1 
 
 
133 aa  65.1  3e-10  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  30.83 
 
 
138 aa  64.7  4e-10  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  27.35 
 
 
147 aa  64.3  5e-10  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  31.9 
 
 
139 aa  64.3  5e-10  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  32.8 
 
 
134 aa  64.3  5e-10  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3007  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.46 
 
 
143 aa  63.9  6e-10  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0352  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 
145 aa  63.9  7e-10  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0388  biopolymer transport protein  30 
 
 
145 aa  63.9  7e-10  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  28.45 
 
 
144 aa  63.5  8e-10  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0346  biopolymer transport protein ExbD  27.78 
 
 
141 aa  63.5  9e-10  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  29.84 
 
 
134 aa  63.5  9e-10  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  32 
 
 
153 aa  63.2  1e-09  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2155  biopolymer transport protein (ExbD2)  30.3 
 
 
136 aa  62.8  1e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4033  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.84 
 
 
158 aa  63.2  1e-09  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439813  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2817  biopolymer transport protein (ExbD2)  32.54 
 
 
135 aa  63.2  1e-09  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276974  hitchhiker  1.82227e-06 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  32 
 
 
153 aa  63.2  1e-09  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  32 
 
 
153 aa  63.2  1e-09  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1736  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.89 
 
 
139 aa  63.2  1e-09  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109286  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4238  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.25 
 
 
156 aa  62.8  1e-09  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0609  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.38 
 
 
136 aa  63.2  1e-09  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000633887  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.84 
 
 
159 aa  62.4  2e-09  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 
140 aa  62  2e-09  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.48 
 
 
141 aa  62.4  2e-09  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0560  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.17 
 
 
156 aa  62.8  2e-09  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3669  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
127 aa  62.8  2e-09  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0711  putative biopolymer transport protein  25 
 
 
140 aa  62.4  2e-09  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0310861 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0197  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.78 
 
 
145 aa  62.8  2e-09  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.058797  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0696  protein TolR  29.69 
 
 
150 aa  61.6  3e-09  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4372  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.25 
 
 
156 aa  61.6  3e-09  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0661  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.69 
 
 
150 aa  61.6  3e-09  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602006  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4166  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.25 
 
 
156 aa  61.6  3e-09  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0872  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.31 
 
 
141 aa  61.6  3e-09  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.532124  normal  0.142279 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0695  protein TolR  29.69 
 
 
150 aa  61.6  3e-09  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  26.83 
 
 
173 aa  61.6  4e-09  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0330  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 
173 aa  61.2  4e-09  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175992  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0705  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.06 
 
 
152 aa  61.2  4e-09  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105618  normal  0.350278 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1634  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.29 
 
 
143 aa  61.2  4e-09  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0335583  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  33.33 
 
 
151 aa  61.6  4e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  33.33 
 
 
151 aa  61.6  4e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.45 
 
 
156 aa  61.2  5e-09  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  28.45 
 
 
156 aa  61.2  5e-09  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14750  Biopolymer transport protein ExbD  31.16 
 
 
142 aa  60.8  5e-09  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  25 
 
 
146 aa  60.8  5e-09  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1613  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.79 
 
 
142 aa  60.8  6e-09  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.921592  normal  0.194939 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  29.46 
 
 
167 aa  60.5  7e-09  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  31.75 
 
 
139 aa  60.5  7e-09  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.91 
 
 
154 aa  60.5  7e-09  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.17 
 
 
151 aa  60.5  8e-09  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.31 
 
 
143 aa  60.1  9e-09  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  28.7 
 
 
142 aa  60.1  1e-08  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  28.7 
 
 
140 aa  60.1  1e-08  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  28.7 
 
 
142 aa  60.1  1e-08  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2155  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.52 
 
 
134 aa  60.1  1e-08  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2955  putative TolR-like translocation protein  30.43 
 
 
142 aa  60.1  1e-08  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  28.7 
 
 
142 aa  60.1  1e-08  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0971  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.37 
 
 
137 aa  60.1  1e-08  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  28.7 
 
 
142 aa  60.1  1e-08  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  28.7 
 
 
142 aa  60.1  1e-08  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  28.7 
 
 
142 aa  60.1  1e-08  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  28.7 
 
 
142 aa  60.1  1e-08  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2179  hypothetical protein  31.97 
 
 
146 aa  59.3  2e-08  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2367  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.6 
 
 
162 aa  59.3  2e-08  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0389  biopolymer transport protein ExbD  26.98 
 
 
141 aa  59.3  2e-08  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.627769  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.74 
 
 
144 aa  59.3  2e-08  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.58 
 
 
151 aa  59.3  2e-08  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3332  biopolymer transport protein ExbD  26.19 
 
 
141 aa  58.9  2e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  30.95 
 
 
139 aa  58.9  2e-08  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3341  biopolymer transport protein ExbD  26.19 
 
 
141 aa  58.9  2e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0150  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.37 
 
 
149 aa  58.9  2e-08  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000194485  hitchhiker  0.00605756 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3406  biopolymer transport protein ExbD  26.19 
 
 
141 aa  59.3  2e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.479649 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3507  biopolymer transport protein ExbD  26.19 
 
 
141 aa  58.9  2e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3412  biopolymer transport protein ExbD  26.19 
 
 
141 aa  58.5  3e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0273  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.15 
 
 
136 aa  58.2  3e-08  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02811  Biopolymer transport protein  26.15 
 
 
132 aa  58.5  3e-08  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0477065  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0846  ExbD2-like biopolymer transport protein  28.46 
 
 
143 aa  58.5  3e-08  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.424366  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2392  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.93 
 
 
133 aa  58.5  3e-08  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.791616 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0174  TonB system transport protein ExbD  28.07 
 
 
152 aa  57.8  4e-08  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2118  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.45 
 
 
142 aa  58.2  4e-08  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2151  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.23 
 
 
140 aa  58.2  4e-08  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0691787  normal  0.335965 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.81 
 
 
136 aa  57.8  5e-08  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0272  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.21 
 
 
149 aa  57.8  5e-08  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512888  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3184  biopolymer transport protein ExbD  25.4 
 
 
141 aa  57.8  5e-08  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3474  biopolymer transport protein ExbD  25.4 
 
 
141 aa  57.8  5e-08  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4210  TonB system transport protein ExbD type-1  28.35 
 
 
142 aa  57.8  5e-08  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>