More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0264 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 		 404 aa  816    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  65.1 
 
 		 411 aa  524  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  60.99 
 
 		 408 aa  494  9.999999999999999e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  60.2 
 
 		 404 aa  492  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  59.55 
 
 		 410 aa  489  1e-137  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  59.65 
 
 		 406 aa  484  1e-135  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  58.31 
 
 		 412 aa  472  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  56.93 
 
 		 410 aa  473  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  57.21 
 
 		 418 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  58.21 
 
 		 404 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  56.82 
 
 		 418 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  57.46 
 
 		 405 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  57.96 
 
 		 429 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  57.32 
 
 		 429 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  59.2 
 
 		 405 aa  463  1e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  58.46 
 
 		 405 aa  458  9.999999999999999e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  57.71 
 
 		 404 aa  457  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  58.21 
 
 		 405 aa  457  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  54.59 
 
 		 404 aa  451  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  55.64 
 
 		 410 aa  451  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  55.83 
 
 		 438 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  53.6 
 
 		 404 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  53.6 
 
 		 404 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  53.35 
 
 		 415 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  52.85 
 
 		 404 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  53.38 
 
 		 413 aa  428  1e-118  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  51.74 
 
 		 398 aa  409  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  44.91 
 
 		 398 aa  330  3e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  45.23 
 
 		 411 aa  306  3e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  43.72 
 
 		 407 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  42.86 
 
 		 406 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  38.99 
 
 		 409 aa  266  5e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  40.69 
 
 		 419 aa  265  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  42.42 
 
 		 420 aa  265  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  41.58 
 
 		 403 aa  260  3e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  38.94 
 
 		 409 aa  260  4e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  40.35 
 
 		 432 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  39.7 
 
 		 414 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2940  phosphoserine phosphatase SerB  41.41 
 
 		 421 aa  249  9e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  42.12 
 
 		 419 aa  247  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  39.95 
 
 		 406 aa  243  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  37.01 
 
 		 400 aa  238  1e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  40.6 
 
 		 429 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4276  phosphoserine phosphatase SerB  39.85 
 
 		 410 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1834  phosphoserine phosphatase SerB  39.39 
 
 		 417 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0739277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1853  phosphoserine phosphatase SerB  39.39 
 
 		 417 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1900  phosphoserine phosphatase SerB  39.39 
 
 		 417 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2083  phosphoserine phosphatase SerB  40.56 
 
 		 419 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2903  phosphoserine phosphatase SerB  39.6 
 
 		 410 aa  231  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854311  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  53.11 
 
 		 435 aa  224  2e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1688  phosphoserine phosphatase SerB  38.16 
 
 		 380 aa  216  8e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0594827 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  51.67 
 
 		 400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  51.67 
 
 		 400 aa  212  7.999999999999999e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  45.67 
 
 		 326 aa  212  7.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  53.81 
 
 		 281 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0687  phosphoserine phosphatase  45.64 
 
 		 317 aa  211  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.189531  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1310  phosphoserine phosphatase SerB  46.44 
 
 		 303 aa  209  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193327  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1107  phosphoserine phosphatase  44.66 
 
 		 306 aa  209  8e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  54.73 
 
 		 326 aa  208  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  41.46 
 
 		 322 aa  206  5e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  41.46 
 
 		 322 aa  206  5e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  41.46 
 
 		 322 aa  206  5e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  41.46 
 
 		 322 aa  206  5e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  41.46 
 
 		 322 aa  206  5e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  41.46 
 
 		 322 aa  206  5e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  42.12 
 
 		 322 aa  206  5e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  41.46 
 
 		 322 aa  206  5e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  41.46 
 
 		 322 aa  206  5e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  40.74 
 
 		 357 aa  206  6e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  51.92 
 
 		 326 aa  206  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  51.92 
 
 		 326 aa  206  9e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  51.92 
 
 		 326 aa  206  9e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  43.45 
 
 		 322 aa  205  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4936  phosphoserine phosphatase  55.85 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4902  phosphoserine phosphatase  55.85 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4988  phosphoserine phosphatase  55.85 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5506  phosphoserine phosphatase SerB  40.2 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.933575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4990  phosphoserine phosphatase  55.85 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4829  phosphoserine phosphatase  55.85 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5907  phosphoserine phosphatase SerB  40.2 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.580138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  48.44 
 
 		 328 aa  204  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  44.93 
 
 		 325 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  44.93 
 
 		 325 aa  199  6e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  45.37 
 
 		 325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1874  phosphoserine phosphatase SerB  49.55 
 
 		 297 aa  197  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058047 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  49.23 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  48.56 
 
 		 325 aa  194  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2720  phosphoserine phosphatase  50.71 
 
 		 236 aa  193  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377645  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2007  phosphoserine phosphatase SerB  50.23 
 
 		 235 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1007  phosphoserine phosphatase SerB  48.06 
 
 		 328 aa  191  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  45.74 
 
 		 325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  48.86 
 
 		 279 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  47.51 
 
 		 278 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02993  SerB  43.17 
 
 		 327 aa  190  5e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  44.98 
 
 		 275 aa  189  7e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  43.28 
 
 		 302 aa  189  7e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2846  phosphoserine phosphatase SerB  49.52 
 
 		 237 aa  189  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.583528 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3043  phosphoserine phosphatase SerB  39.64 
 
 		 335 aa  189  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  52 
 
 		 237 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2817  phosphoserine phosphatase SerB  48.04 
 
 		 331 aa  188  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>