More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3193 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3193  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
159 aa  322  1e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.680188  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1189  AsnC family transcriptional regulator  61.15 
 
 
167 aa  203  9e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000169629  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0362  AsnC family transcriptional regulator  59.74 
 
 
159 aa  194  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0186  AsnC family transcriptional regulator  57.59 
 
 
162 aa  192  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000683645  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2183  AsnC family transcriptional regulator  56.96 
 
 
162 aa  191  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00948662  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1206  AsnC family transcriptional regulator  54.49 
 
 
162 aa  190  5e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2209  transcriptional regulator, AsnC family  58.44 
 
 
159 aa  188  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.928029  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1415  transcriptional regulator, AsnC family  51.27 
 
 
162 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.959948  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1152  AsnC family transcriptional regulator  56.58 
 
 
160 aa  178  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3008  transcriptional regulator, AsnC family  51.57 
 
 
178 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1123  transcriptional regulator, AsnC family  55.92 
 
 
160 aa  177  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5046  transcriptional regulator, AsnC family  53.09 
 
 
165 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4724  AsnC family transcriptional regulator  52.47 
 
 
165 aa  176  8e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5041  AsnC family transcriptional regulator  52.47 
 
 
165 aa  176  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4772  AsnC family transcriptional regulator  52.47 
 
 
168 aa  176  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4612  AsnC family transcriptional regulator  52.47 
 
 
168 aa  176  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5134  AsnC family transcriptional regulator  52.47 
 
 
168 aa  176  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5013  transcriptional regulator, AsnC family  52.47 
 
 
165 aa  176  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0149  AsnC family transcriptional regulator  55.41 
 
 
160 aa  176  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2663  transcriptional regulator, AsnC family  50.63 
 
 
164 aa  174  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00226227  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0706  AsnC family transcriptional regulator  56.77 
 
 
160 aa  174  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0700  AsnC family transcriptional regulator  56.77 
 
 
160 aa  174  5e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.567855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4634  AsnC family transcriptional regulator  51.85 
 
 
168 aa  173  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1341  AsnC family transcriptional regulator  54.61 
 
 
160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0200  transcriptional regulator, AsnC family  51.85 
 
 
165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5034  transcriptional regulator, AsnC family  51.85 
 
 
165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0638366  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3513  AsnC family transcriptional regulator  49.38 
 
 
164 aa  168  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0047  transcriptional regulator, AsnC family  53.5 
 
 
162 aa  169  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00562884  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2862  transcriptional regulator, AsnC family  51.33 
 
 
166 aa  167  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2100  AsnC family transcriptional regulator  51.28 
 
 
163 aa  165  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0879  AsnC family transcriptional regulator  52.87 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2404  transcriptional regulator, AsnC family  47.77 
 
 
165 aa  159  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000668055  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0002  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 
163 aa  154  4e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355793  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3464  AsnC family transcriptional regulator  47.4 
 
 
163 aa  152  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00420636 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0002  AsnC family transcriptional regulator  44.81 
 
 
163 aa  145  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0002  transcriptional regulator, AsnC family  43.79 
 
 
163 aa  142  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00778678 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1770  transcriptional regulator, AsnC family  46.15 
 
 
161 aa  142  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000758756  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1532  transcriptional regulator, AsnC family  39.49 
 
 
161 aa  137  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2838  AsnC family transcriptional regulator  43.83 
 
 
162 aa  133  8e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258755 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2472  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 
163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3534  transcriptional regulator, AsnC family  37.18 
 
 
162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2857  transcriptional regulator, AsnC family  37.58 
 
 
162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.301241  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1320  transcriptional regulator, AsnC family  37.58 
 
 
162 aa  124  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2150  transcriptional regulator, AsnC family  37.74 
 
 
164 aa  123  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.171869 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3528  transcriptional regulator, AsnC family  38.22 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0541368  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0002  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  29.79 
 
 
172 aa  65.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  30.22 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  30.37 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2165  AsnC family transcriptional regulator  27.54 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0837  AsnC family transcriptional regulator  27.54 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0388954  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  27.54 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  29.63 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  29.58 
 
 
160 aa  63.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0738  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  25.18 
 
 
156 aa  61.2  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1694  AsnC family transcriptional regulator  24.29 
 
 
158 aa  61.2  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.43137  normal  0.666184 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  28.26 
 
 
153 aa  60.8  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2774  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 
156 aa  60.5  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0204  transcriptional regulator, AsnC family  31.91 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138221  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001024  PutR transcriptional activator of PutA and PutP  29.93 
 
 
158 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3837  AsnC family transcriptional regulator  29.08 
 
 
150 aa  58.2  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261619  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  29.23 
 
 
147 aa  57.8  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
168 aa  57.8  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 
161 aa  57.4  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  28.99 
 
 
156 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  25.36 
 
 
150 aa  57.4  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0833  transcriptional regulator, AsnC family  29.5 
 
 
148 aa  57  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 
158 aa  57  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  27.41 
 
 
160 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3847  AsnC family transcriptional regulator  23.02 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0723  proline dehydrogenase transcriptional activator  23.02 
 
 
164 aa  55.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2050  AsnC family transcriptional regulator  24.65 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07108  transcriptional regulator  27.27 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  29.25 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  29.5 
 
 
229 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2279  AsnC family transcriptional regulator  26.03 
 
 
174 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3095  AsnC family transcriptional regulator  25.34 
 
 
174 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679009  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  26.09 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  26.57 
 
 
151 aa  55.1  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0174  AsnC family transcriptional regulator  25.36 
 
 
160 aa  55.1  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 
164 aa  55.1  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2044  transcriptional regulator, AsnC family  29.79 
 
 
158 aa  54.7  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549903  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  25.18 
 
 
152 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  25 
 
 
155 aa  54.7  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  26.81 
 
 
153 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1713  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 
160 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911969  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3495  AsnC family transcriptional regulator  21.99 
 
 
176 aa  54.7  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0302787 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  32.41 
 
 
162 aa  54.3  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000552  transcriptional regulator  32.11 
 
 
151 aa  54.3  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2969  AsnC family transcriptional regulator  24.66 
 
 
174 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  29.45 
 
 
156 aa  53.9  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1319  transcription regulator AsnC  24.66 
 
 
174 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3628  transcriptional regulator, AsnC family  29.05 
 
 
145 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.568388  normal  0.0860677 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 
159 aa  53.9  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  26.62 
 
 
155 aa  53.9  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  26.62 
 
 
155 aa  53.9  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  27.34 
 
 
151 aa  53.9  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4856  transcriptional regulator, AsnC family  24.46 
 
 
164 aa  53.9  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00513546  normal  0.170919 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>